建立小鼠腺瘤模型并实施CRT和celecoxib治疗
评估CRT和celecoxib对腺瘤进展的影响,为研究TSC和TME反应提供模型。
使用APCMin/+小鼠,在90-100天开始治疗,分为对照组、CRT组(5Gy腹部照射+卡培他滨700mg/kg 7天)、celecoxib组(100ppm混入食物14天)和联合组。
Tumor-initiating stem cell shapes its microenvironment into an immunosuppressive barrier and pro-tumorigenic niche.
综合运用单细胞RNA测序、类器官共培养、细胞耗竭、谱系示踪及临床样本分析,多层次验证了TAMM通过PGE2-EP4信号促进TSC增殖的机制。
ApcMin/+小鼠肠道腺瘤模型 腺瘤类器官与MDC共培养 Bmi1-CreER谱系示踪小鼠模型 人结直肠癌(CRC)患者组织切片
CRT方案:腹部照射5Gy,12小时后给予卡培他滨(700mg/kg)7天 celecoxib治疗组:饲料中混合100ppm celecoxib 类器官共培养:MDC与类器官1:1比例,用celecoxib(5-20μM)和EP4抑制剂AH23848(10-30μM)处理 巨噬细胞耗竭:Clodrosome腹腔注射,剂量50mg/kg,隔日一次,共4次 免疫荧光标记:CldU(10mg/kg)标记慢周期细胞,Ki67标记增殖细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CRT和celecoxib对腺瘤进展的影响,为研究TSC和TME反应提供模型。
使用APCMin/+小鼠,在90-100天开始治疗,分为对照组、CRT组(5Gy腹部照射+卡培他滨700mg/kg 7天)、celecoxib组(100ppm混入食物14天)和联合组。
区分慢周期和增殖细胞,验证慢周期细胞是治疗抵抗的。
用CldU标记慢周期细胞,Ki67标记增殖细胞,通过免疫荧光分析CRT后不同时间点的细胞变化。
全面解析腺瘤中的细胞组分,鉴定TrTSCs及其与TME的相互作用。
从腺瘤中分离上皮和间充质细胞,进行scRNA-seq,结合UMAP、RNA velocity和CellPhoneDB分析。
验证TAMM是否通过PGE2-EP4信号促进TSC增殖。
将M-MDCs与腺瘤类器官共培养,加入celecoxib或EP4抑制剂,观察类器官生长变化。
检验TAMM在体内对肿瘤生长的必要性。
使用Clodrosome耗竭巨噬细胞,观察肿瘤数量和大小变化。
直接观察TAMM与TSC的相互作用及对肿瘤克隆的影响。
使用Bmi1-CreER;R26-LSL-GFP;ApcMin/+小鼠,研究CD68+ TAMM与Bmi1+ TSC的关联,并评估celecoxib处理效果。
评估小鼠模型发现对人类结直肠癌的适用性。
对59例人类CRC患者的组织切片进行H&E、IF和IHC染色,分析Krt15+Ascl2+ TrTSCs和CD68+ TAMM的关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠治疗 | 卡培他滨 | LC Laboratories | C-2799 |
| 塞来昔布 | LC Laboratories | C-1502 | |
| 巨噬细胞耗竭 | 空脂质体 | -- | -- |
| 细胞培养 | IntestiCult类器官生长培养基(小鼠) | StemCell Technologies | 06005 |
| 基质胶 | Corning | 356231 | |
| 细胞因子 | 巨噬细胞集落刺激因子 | StemCell Technologies | 78057 |
| 药物处理 | AH23848 | Sigma | A8227-25MG |
| 免疫荧光 | 抗Ki-67抗体 | ThermoFisher | RM-9106-S1 |
| 抗BrdU/CldU抗体 | Novus Biologicals | NB500-169 | |
| 抗Krt15抗体 | Novus Biologicals | NBP1-85602 | |
| 抗Ascl2抗体 | Biorbyt | orb155740 | |
| 抗CD68抗体 | Abcam | ab125212 | |
| 抗磷酸化β-连环蛋白(Ser552)抗体 | -- | -- | |
| 抗Bmi1抗体 | Cell Signaling Technology | 6964 | |
| 流式细胞术 | 抗CD45抗体 | ThermoFisher | 15-0451-83 |
| 抗CD11b抗体 | ThermoFisher | 47-0112-82 | |
| 抗Ly6c抗体 | ThermoFisher | 53-5932-82 | |
| 抗Ly6g抗体 | ThermoFisher | 61-9668-82 | |
| 抗MHCII抗体 | ThermoFisher | 17-5320-82 | |
| 抗CX3CR1抗体 | Biolegend | 149020 | |
| Western blot | 抗COX-2抗体 | Cell Signaling Technology | 4842 |
| 抗活化的Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661S | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8227 | |
| ECL Western印迹底物 | Pierce | 32106 | |
| 细胞分离 | 小鼠MDSC分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-094-538 |
| CD45微珠 | Miltenyi Biotec | 130-052-301 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系:APCMin/+;治疗时间:90-100天;CRT方案:5Gy照射+卡培他滨剂量;celecoxib剂量;抗生素处理 阅读提示:STAR Methods:Animal therapy procedure |
| 慢周期细胞标记 | CldU剂量和注射频率;追踪时间和方法 阅读提示:STAR Methods:Dual labeling of active-proliferating and slow-cycling tumor cells |
| 单细胞RNA测序 | 组织分离方法;测序平台和参数;数据分析方法(聚类、轨迹分析) 阅读提示:STAR Methods:Isolation of epithelial single cell, Isolation of lamina propria mesenchymal single cell, 10x Chromium single-cell RNA-seq library construction |
| 类器官共培养 | MDC分离方法;共培养比例(1:1);培养时间;抑制剂浓度;培养基成分 阅读提示:STAR Methods:3D Ex vivo organoid co-culture with MDCs |
| 巨噬细胞耗竭 | Clodrosome剂量(50mg/kg)和注射频率(隔日一次,共4次);分析时间(7-10天) 阅读提示:STAR Methods:Macrophage depletion |
| 谱系示踪 | 小鼠基因型(Bmi1-CreER;R26-LSL-GFP;ApcMin/+);他莫昔芬诱导方案;celecoxib处理方案 阅读提示:STAR Methods:Animal therapy procedure, Figure 6C |
| 人类样本分析 | 样本来源和数量(59例,其中35例可用);病理分期标准;染色和评分方法 阅读提示:STAR Methods:Human subjects, Figure 7 |
| Western blot | 抗体种类和稀释比例;蛋白质提取方法;显色底物 阅读提示:STAR Methods:Western blot analysis |