患者样本收集与临床病理数据记录
建立研究队列并收集ESCC患者的肿瘤组织及临床病理参数。
收集2008年1月至2018年12月在新疆医科大学第一附属医院确诊的229例ESCC患者的石蜡包埋肿瘤组织及配对非癌组织,记录年龄、性别、种族、肿瘤位置、大小、分化程度、TNM分期、淋巴结状态等。
Prognostic value of MTA1, SOX4 and EZH2 expression in esophageal squamous cell carcinoma.
仅包含患者样本的免疫组化检测和生存分析,缺乏体外或动物模型的功能验证和机制验证。
229例食管鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和配对非癌组织
患者队列:229例ESCC组织样本,含汉族119例和哈萨克族110例,诊断于2008年1月至2018年12月 免疫组化检测:MTA1、SOX4和EZH2抗体的稀释度分别为1:200、1:200和1:50,抗原修复条件等 评分标准:MTA1和SOX4以得分≥4为阳性,EZH2以得分≥3为阳性 生存分析:Kaplan-Meier曲线、log-rank检验和Cox回归,多因素模型包含MTA1表达等协变量 随访:随访截至2020年7月,通过医疗记录和电话获取信息
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立研究队列并收集ESCC患者的肿瘤组织及临床病理参数。
收集2008年1月至2018年12月在新疆医科大学第一附属医院确诊的229例ESCC患者的石蜡包埋肿瘤组织及配对非癌组织,记录年龄、性别、种族、肿瘤位置、大小、分化程度、TNM分期、淋巴结状态等。
检测MTA1、SOX4和EZH2在ESCC组织中的表达水平。
使用组织芯片仪构建TMA,切片后进行免疫组化染色,使用特异性抗体检测MTA1、SOX4和EZH2的表达。
对MTA1、SOX4和EZH2的表达进行半定量评分。
由两名不知情的病理学家在光学显微镜下评估染色强度和阳性细胞百分比,计算染色指数并确定阳性阈值。
分析MTA1、SOX4和EZH2表达与临床病理参数的关联。
使用χ2检验和Fisher精确检验分析蛋白表达与临床病理参数(年龄、性别、种族、分化程度等)的关联。
评估MTA1、SOX4和EZH2表达之间的相关性。
使用Spearman相关分析计算MTA1、SOX4、EZH2表达水平之间的相关系数和P值。
评估MTA1、SOX4和EZH2表达对ESCC患者预后的影响。
使用Kaplan-Meier曲线和log-rank检验进行单因素生存分析,使用Cox比例风险回归模型进行多因素分析,评估总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列 | 纳入和排除标准、样本量、民族构成、临床病理参数收集。 阅读提示:Materials and methods: Patients and tissue samples |
| 组织芯片构建 | 组织芯直径、阵列方式、切片厚度。 阅读提示:Materials and methods: Tissue microarray (TMA) and IHC |
| 免疫组化染色 | 一抗浓度、二抗、抗原修复条件、封闭条件、孵育时间和温度。 阅读提示:Materials and methods: Tissue microarray (TMA) and IHC |
| 免疫组化评分 | 评分标准、阳性阈值、双人评估和盲法。 阅读提示:Materials and methods: Evaluation of IHC |
| 生存分析 | 随访时间、终点定义、统计模型和协变量。 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |