验证ZnONPs诱导内皮细胞铁死亡
确定ZnONPs是否诱导血管内皮细胞发生铁死亡
使用MTS检测细胞活力,测量GSH、MDA、C11-BODIPY荧光和PGSK荧光,Western blot检测GPX4、ACSL4、SLC7A11表达,并检测PTGS2 mRNA水平。
Ferritinophagy is involved in the zinc oxide nanoparticles-induced ferroptosis of vascular endothelial cells.
包含体外细胞模型(HUVECs、EA.hy926)和体内小鼠模型,并进行了功能验证(抑制剂、基因敲除、siRNA)和机制验证(AMPK-ULK1通路)。
HUVECs细胞系 EA.hy926细胞系 C57BL/6J小鼠肺部暴露模型
ZnONPs浓度(0-50 μg/mL)和时间(0-24小时) Fer-1(1 μM)和DFP(100 μM)预处理 3-MA(5 mM)抑制自噬 ATG5基因敲除 NCOA4敲低
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ZnONPs是否诱导血管内皮细胞发生铁死亡
使用MTS检测细胞活力,测量GSH、MDA、C11-BODIPY荧光和PGSK荧光,Western blot检测GPX4、ACSL4、SLC7A11表达,并检测PTGS2 mRNA水平。
确认抑制铁死亡能否减轻ZnONPs诱导的细胞死亡
用Fer-1(1 μM)或DFP(100 μM)预处理后,检测MDA水平和细胞活力。
确定ZnONPs暴露是否激活自噬
通过TEM观察自噬体,Western blot检测LC3B-II和SQSTM1表达,并使用自噬抑制剂(3-MA、CQ、BafA1)处理。
探究自噬是否参与ZnONPs诱导的铁死亡
使用3-MA抑制自噬或ATG5基因敲除,检测铁过载(PGSK)、脂质过氧化(MDA)和细胞活力。
确定NCOA4介导的铁蛋白降解是否参与ZnONPs诱导的铁死亡
Western blot检测FTH1和NCOA4表达,使用自噬抑制剂和NCOA4敲低,检测MDA和细胞活力,以及免疫共沉淀和免疫荧光验证NCOA4-FTH1相互作用。
探究AMPK-ULK1信号轴是否参与铁蛋白自噬的激活
Western blot检测p-PRKAA、p-ULK1和下游蛋白,siRNA敲低AMPK或ULK1后检测脂质过氧化、铁过载、FTH1表达和细胞活力。
确定线粒体损伤和ROS是否作为AMPK-ULK1轴的上游调节因子
TEM观察线粒体形态,TMRE检测膜电位,MitoSOX检测mtROS,使用MitoTEMPOL和NAC处理后检测AMPK/ULK1磷酸化、FTH1表达、MDA和细胞活力。
在体内模型中验证ZnONPs暴露是否诱导血管损伤和铁死亡
小鼠气管内滴注ZnONPs(12 μg/只),检测血管炎症因子、MDA、Ptgs2、GPX4、SLC7A11、p-PRKAA、p-ULK1、LC3B和FTH1表达。
验证抑制铁死亡能否逆转ZnONPs诱导的血管损伤
Fer-1(10 mg/kg)腹腔注射预处理,然后气管滴注ZnONPs,检测血管炎症因子、MDA和Ptgs2表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米颗粒处理 | 氧化锌纳米颗粒 | Sigma-Aldrich | 677450 |
| 铁死亡抑制 | Ferrostatin-1 | Sigma-Aldrich | SML0583 |
| 去铁酮 | Santa Cruz Biotechnology | sc-211220 | |
| 自噬抑制 | 3-甲基腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | M9281 |
| 氯喹 | Sigma-Aldrich | C6628 | |
| 巴弗洛霉素A1 | Santa Cruz Biotechnology | sc-201550 | |
| 细胞活力检测 | MTS试剂 | Promega | G3581 |
| 铁死亡诱导 | Erastin | Sigma-Aldrich | E7781 |
| 氧化应激抑制 | MitoTEMPOL | Sigma-Aldrich | SML0737 |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | a9165 | |
| 锌离子螯合 | 二乙烯三胺五乙酸 | Sigma-Aldrich | D6518 |
| TPEN | Sigma-Aldrich | P4413 | |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE | Sigma-Aldrich | 87917 |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| 铁检测 | Phen Green SK | Thermo Fisher Scientific | P14313 |
| 细胞活力检测 | 钙黄绿素-AM | Santa Cruz Biotechnology | sc-203865 |
| 细胞凋亡抑制 | Z-VAD-FMK | Selleck | S7023 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11965 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141 | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Abcam | ab156034 |
| 蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | 78430 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| PVDF膜 | BIO-RAD Laboratories | 1620177 | |
| GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| ACSL4抗体 | Abcam | ab155282 | |
| SLC7A11抗体 | Abcam | ab175186 | |
| LC3B抗体 | Abcam | ab192890 | |
| ATG5抗体 | Abcam | ab109490 | |
| p-MTOR (S2448)抗体 | Abcam | ab109268 | |
| ATG7抗体 | Abcam | ab52472 | |
| IREB2/IRP2抗体 | Cell Signaling Technology | 37135 | |
| PRKAA/AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 5832 | |
| MTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983 | |
| p-EIF4EBP1 (Thr37/46)抗体 | Cell Signaling Technology | 2855 | |
| p-RPS6KB (Thr389)抗体 | Cell Signaling Technology | 9234 | |
| p-PRKAA (Thr172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| p-ULK1 (Ser555)抗体 | Cell Signaling Technology | 5869 | |
| p-ULK1 (Ser757)抗体 | Cell Signaling Technology | 14202 | |
| RB1CC1/FIP200抗体 | Cell Signaling Technology | 12436 | |
| BECN1抗体 | Cell Signaling Technology | 3495 | |
| MT-CO2/COX2抗体 | Proteintech | 12375-1-AP | |
| MYC标签抗体 | Proteintech | 16286-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| NCOA4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-373739 | |
| FTH1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376594 | |
| AKT抗体 | BIMAKE | A5031 | |
| p-AKT (Ser473)抗体 | BIMAKE | A5031 | |
| ULK1抗体 | BIMAKE | A5149 | |
| ACTB抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| TEM | Epon 816 | Electron Microscopy Sciences | -- |
| Leica超薄切片机 | Leica Microsystems | -- | |
| JEM-1400Plus透射电子显微镜 | JEOL Ltd. | -- | |
| RT-qPCR | Eastep Super总RNA提取试剂盒 | Promega | LS1040 |
| GoScript逆转录试剂盒 | Promega | A5001 | |
| GoTaq实时定量PCR预混液 | Promega | A6002 | |
| CFX96 Touch实时PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G磁珠 | MedChemExpress | HY-K0202 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | B2064 | |
| 甘氨酸 | Sigma-Aldrich | G8898 | |
| DAPI | Thermo Fisher | 62248 | |
| LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 83506 | |
| FTH1抗体 | Abcam | ab75973 | |
| ATP5B抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166462 | |
| 驴抗小鼠IgG Alexa Fluor 594 | Molecular Probes | A-21203 | |
| 山羊抗兔IgG Alexa Fluor Plus 488 | Molecular Probes | A-32731 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher | LMRNA015 |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher | 31985062 | |
| 试剂配制 | 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 |
| 聚乙二醇300 | Sigma-Aldrich | 90878 | |
| 吐温80 | Sigma-Aldrich | P4780 | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 |
| 基因编辑 | lentiCRISPv2 | Addgene | 52961 |
| 质粒构建 | pCDH表达慢病毒载体 | System Biosciences | CD510B-1 |
| 病毒包装 | pMD2G | Addgene | 12260 |
| psPAX2 | Addgene | 12259 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:HUVEC (CRL-1730)、EA.hy926 (CRL-2922)、MRC-5 (CCL-171)、THP-1 (TIB-202);培养基:DMEM + 10% FBS + 1% 青霉素/链霉素;培养条件:37°C, 5% CO2. 阅读提示:Materials and methods: Cell lines |
| ZnONPs处理 | ZnONPs浓度:0, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 50 μg/mL;处理时间:0, 3, 6, 12, 24小时;细胞系:HUVECs和EA.hy926. 阅读提示:Figure legends and Results |
| 铁死亡抑制 | Fer-1 (1 μM) 和 DFP (100 μM) 预处理1小时;然后ZnONPs处理24小时. 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assays 和 Figure 2 legend |
| 自噬抑制 | 3-MA (5 mM), CQ (5 μM), BafA1 (100 nM) 预处理1小时;处理时间:0, 6, 12小时. 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assays 和 Figure 3/4 legends |
| 基因敲除/敲低 | ATG5敲除(lentiCRISPv2);NCOA4敲低(siRNA 75 nM转染48小时). 阅读提示:Materials and methods: Cell lines 和 siRNA transfection |
| 体内实验 | 小鼠品系:C57BL/6J雄性,8-10周龄,体重22-24g;ZnONPs剂量:12 μg/只(气管内滴注);暴露时间:3天;Fer-1剂量:10 mg/kg(腹腔注射,暴露前1小时). 阅读提示:Materials and methods: Animal treatment 和 Figure 9/10 legends |
| 检测方法 | MTS检测细胞活力;MDA试剂盒;GSH试剂盒;C11-BODIPY (50 μM);PGSK (20 μM);TMRE (10 nM);MitoSOX (5 μM);Western blot抗体信息;RT-qPCR引物序列. 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assays, FACS assays, Measurement of GSH/MDA, Western blotting, Real-time quantitative PCR analysis |