MPL表达与CML进展的相关性分析
评估MPL在CML中的表达水平及其与疾病进展的关系
利用GEO数据集(GSE13159、GSE24739、GSE47927)分析MPL表达,进行差异表达分析、GSEA和WGCNA,并在CML样本中分析MPL与巨核细胞标志物的相关性。
Establishment of a novel mesenchymal stem cell-based regimen for chronic myeloid leukemia differentiation therapy.
包含体外细胞共培养、基因敲低/过表达、信号通路抑制、异种移植小鼠模型及临床样本分析等多层级验证,并明确功能与机制验证。
K562细胞系 LAMA-84细胞系 UC-MSCs共培养体系 K562异种移植小鼠模型
CML细胞系:K562和LAMA-84,来自China Center for Type Culture Collection UC-MSCs:人脐带来源,分离自南京鼓楼医院,培养于MEM-α培养基,使用代数≤10 共培养时间:48小时 eltrombopag剂量:0.5 μM、1 μM、2 μM(体外);25 mg/kg(体内,腹腔注射,隔日一次,共6周) 异种移植模型:K562细胞(5×10^7/只)尾静脉注射至裸鼠,1周后分组治疗
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MPL在CML中的表达水平及其与疾病进展的关系
利用GEO数据集(GSE13159、GSE24739、GSE47927)分析MPL表达,进行差异表达分析、GSEA和WGCNA,并在CML样本中分析MPL与巨核细胞标志物的相关性。
验证UC-MSCs能否诱导CML细胞向巨核细胞分化
将K562和LAMA-84细胞与UC-MSCs共培养,检测巨核细胞标志物(CD41、CD42b等)的表达,通过Wright-Giemsa染色和流式细胞术分析细胞形态和表面标志。
确定MPL信号是否是MSCs诱导CML细胞分化的关键机制
通过siRNA敲低MPL、过表达MPL、检测MPL下游信号(JAK2/STAT3、p38)的磷酸化,并使用eltrombopag处理,评估分化效果。
评估UC-MSCs联合eltrombopag在体内对CML肿瘤负荷的影响
建立K562异种移植小鼠模型,分为PBS、eltrombopag、MSCs、MSCs+eltrombopag四组,治疗6周后评估脾脏重量、外周血和骨髓中人CD45+细胞比例以及分化标志物。
确认JAK2/STAT3和p38 MAPK通路在联合治疗诱导分化中的作用
使用特异性抑制剂TG101209(JAK2)、Stattic(STAT3)、SB239063(p38)处理细胞,检测分化标志物;在MPL敲低细胞中检测信号通路磷酸化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM-α培养基 | BasalMedia | -- |
| RPMI 1640培养基 | BasalMedia | -- | |
| RNA提取与RT-qPCR | 5× All-In-One RT预混液 | Abmgood | -- |
| SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- |
| CFSE | Sigma-Aldrich | -- | |
| CD41抗体 | Biolegend | -- | |
| CD42b抗体 | Biolegend | -- | |
| MPL抗体 | Bioss | -- | |
| NovoCyte流式细胞仪 | ACEA Biosciences Inc | -- | |
| 细胞染色 | 瑞氏-吉姆萨试剂 | Jiancheng | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- |
| Opti-MEM | Gibco | -- | |
| 腺病毒感染 | Ad-mCherry-GFP-LC3B腺病毒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 慢病毒包装 | 慢病毒浓缩沉淀液 | -- | C103-01 |
| 蛋白质提取 | 膜和胞浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 9212 |
| 磷酸化p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 9215 | |
| 磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| STAT3抗体 | Bioworld | BS1336 | |
| ERK抗体 | Bioworld | BS1112 | |
| JAK2抗体 | Bioworld | BS2432 | |
| 磷酸化ERK抗体 | Bioworld | BS5016 | |
| 磷酸化JAK2抗体 | Bioworld | BS94058 | |
| LC3A/B抗体 | Servicebio | GB11124 | |
| MPL抗体 | Zen-Bioscience | 220651 | |
| AKT抗体 | Zen-Bioscience | 342529 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Zen-Bioscience | 382299 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Abcepta | AP3434a | |
| GAPDH抗体 | ABclonal | AC035 | |
| ATPase Na+/K+ beta 2抗体 | Bioss | bs-1152R | |
| High-sig ECL蛋白质印迹底物 | Tanon | -- | |
| 化学发光系统 | Clinx | -- | |
| 动物实验 | 艾曲波帕 | -- | -- |
| CD45抗体 | Santa Cruz | -- | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记的山羊抗小鼠IgG | Beyotime | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | UC-MSCs培养条件(MEM-α培养基,10% FBS,青霉素/链霉素);K562和LAMA-84培养条件(RPMI 1640培养基) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 生物信息学分析 | 数据集(GSE13159, GSE24739, GSE47927)的样本量;差异表达筛选阈值(|log2FC|>1, P<0.05) 阅读提示:Methods: Microarray data processing, GSEA, WGCNA |
| RT-qPCR | 引物序列(Table S1),内参基因(GAPDH) 阅读提示:Methods: Quantitative real-time PCR |
| 体外共培养 | 共培养时间(0-48小时),MSCs与CML细胞比例(文中未明确说明) 阅读提示:Methods: Cell culture; Figure legends 2, 3 |
| siRNA转染 | siRNA浓度(30 pmol/1×10^5细胞),转染试剂(Lipofectamine 2000),共培养时间(48小时) 阅读提示:Methods: Small interfering RNA (siRNA) transfection |
| Western blot | 抗体清单、稀释比例(未明确说明),内参蛋白(GAPDH, β-actin, ATPase) 阅读提示:Methods: Western blot analysis |
| 动物实验 | 小鼠品系(裸鼠)、年龄(6-8周)、细胞注射量(5×10^7/只)、MSCs剂量(1×10^6/只)、eltrombopag剂量(25 mg/kg)、给药频率和周期 阅读提示:Methods: Xenograft experiments |
| 体内检测 | 处死时间(移植后10周),检测指标(脾重、PB/BM中CD45+细胞比例、分化标志物) 阅读提示:Methods: HE staining and immunofluorescence; Figure 5 |