骨肉瘤中与转移和免疫浸润相关的预后生物标志物的识别

骨肉瘤是最常见的骨原发性恶性肿瘤，与高转移率和不良预后相关。肿瘤微环境（TME）与骨肉瘤转移之间的紧密关联已被确立。在本研究中，应用ESTIMATE算法基于癌症基因组图谱数据库的数据计算骨肉瘤患者的免疫和基质评分。使用元基因方法和反卷积方法揭示骨肉瘤患者中不同的TME景观。使用生物信息学分析识别与骨肉瘤转移和免疫浸润相关的差异表达基因（DEGs），并利用具有潜在预后意义的DEGs构建风险模型。随后，使用基因集富集分析和Spearman相关分析来描绘与这些预后生物标志物相关的生物学过程。最后，进行免疫组织化学（IHC）分析以评估临床骨肉瘤组织中免疫浸润和预后生物标志物的表达水平。ESTIMATE的结果表明，与转移性骨肉瘤患者相比，非转移性骨肉瘤患者具有更高的免疫/基质评分和更有利的预后。骨肉瘤患者的TME景观提示高水平的肿瘤浸润免疫细胞（TIICs）可能抑制转移。与非转移组织相比，转移组织中观察到更高数量的CD56bright自然杀伤细胞、未成熟B细胞、M1巨噬细胞和中性粒细胞，以及更低水平的M2巨噬细胞。共鉴定出69个与骨肉瘤转移和免疫浸润相关的DEGs。其中，GATA3、LPAR5、EVI2B、RIAM和CFH具有预后潜力，并且基于IHC分析结果在非转移性骨肉瘤组织中高表达。这些生物标志物参与多种免疫相关生物学过程，并与多种TIICs和免疫特征呈正相关。使用这些预后生物标志物构建的风险模型对骨肉瘤预后显示出高预测准确性。总之，本研究提出了一个五生物标志物预后特征，用于预测骨肉瘤患者的转移和免疫浸润。