临床样本分析
评估MICAL-L2和c-Myc在LUAD组织及NSCLC细胞系中的表达水平。
使用包含30例LUAD及配对癌旁组织的组织芯片进行免疫组化染色,检测MICAL-L2和c-Myc的表达;分析TCGA数据库;通过Western blot检测4种NSCLC细胞系(A549, H1299, H292, PC9)和正常细胞系中MICAL-L2的表达。
MICAL-L2 Is Essential for c-Myc Deubiquitination and Stability in Non-small Cell Lung Cancer Cells.
研究包含临床样本免疫组化、细胞增殖、蛋白互作、泛素化及稳定性实验,但缺乏动物模型等体内验证,且有明确的体外功能与机制验证。
A549人非小细胞肺癌细胞系 NCI-H1299人非小细胞肺癌细胞系 NCI-H292人非小细胞肺癌细胞系 PC9人非小细胞肺癌细胞系
MICAL-L2在LUAD组织中的表达(免疫组化,30对癌与癌旁组织) siRNA敲低MICAL-L2的序列(#1, #2, #3)及转染浓度 CHX处理浓度(10 μg/mL)及时间点(0, 30, 60, 90, 120 min) 蛋白酶体抑制剂MG-132(20 μM)和Velcade(10 μM)处理时间(24 h) 细胞周期分析时间点(48 h post-transfection)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MICAL-L2和c-Myc在LUAD组织及NSCLC细胞系中的表达水平。
使用包含30例LUAD及配对癌旁组织的组织芯片进行免疫组化染色,检测MICAL-L2和c-Myc的表达;分析TCGA数据库;通过Western blot检测4种NSCLC细胞系(A549, H1299, H292, PC9)和正常细胞系中MICAL-L2的表达。
检测MICAL-L2表达变化对NSCLC细胞增殖和细胞周期的影响。
通过siRNA敲低或质粒过表达MICAL-L2,使用CCK-8和EdU实验检测细胞增殖,流式细胞术分析细胞周期分布。
验证MICAL-L2与c-Myc之间的物理相互作用并定位结合域。
通过免疫荧光染色、内源性和外源性免疫共沉淀(Co-IP)验证MICAL-L2与c-Myc的相互作用;随后通过截短突变体分析精确定位结合域。
探讨MICAL-L2调控c-Myc蛋白稳定性的机制,特别是是否通过泛素-蛋白酶体途径。
使用CHX处理检测蛋白半衰期;使用蛋白酶体抑制剂(MG-132, Velcade)、自噬抑制剂(AICAR)、溶酶体抑制剂(chloroquine)处理;检测c-Myc多泛素化水平及磷酸化状态(T58)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| RPMI 1640培养基 | Hyclone | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 基因转染 | 脂质体2000 | Invitrogen | -- |
| 药物处理 | MG-132 | Selleck Chemicals | -- |
| 万珂 | Selleck Chemicals | -- | |
| 阿卡地新 | Selleck Chemicals | -- | |
| 磷酸氯喹 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Selleck Chemicals | -- |
| 微孔板读数 | 酶标仪 | Bio-Tek | Elx800 |
| 细胞增殖检测 | EdU染色试剂盒 | Ribobio | -- |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Carl Zeiss Meditec | -- |
| 蛋白质提取 | 裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 蛋白质浓度测定 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blotting | 硝酸纤维素膜 | -- | -- |
| 增强化学发光 | Millipore | -- | |
| Quantity One软件 | Bio-Rad | -- | |
| GAPDH抗体 | Sigma-Aldrich | G9545 | |
| MICAL-L2抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-24826 | |
| c-Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 13877 | |
| Cyclin-D1抗体 | Cell Signaling Technology | 2978 | |
| 泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3936 | |
| GFP抗体 | Cell Signaling Technology | 2956 | |
| CDK2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6248 | |
| CDK4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-260 | |
| CDK6抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7961 | |
| 磷酸化c-Myc T58抗体 | Affinity | AF3055 | |
| HA抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| Flag抗体 | Abmart | M20008 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | HiScript® Q RT SuperMix逆转录试剂盒 | Vazyme | -- |
| qPCR | AceQ® qPCR SYBR® Green预混液 | Vazyme | -- |
| ABI StepOne™实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫荧光 | MICAL-L2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376675 |
| c-Myc抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-764x | |
| DAPI染色液 | Southern Biotech | -- | |
| 奥林巴斯BX43显微镜 | Olympus | -- | |
| 奥林巴斯DP74数码相机 | Olympus | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A+G琼脂糖珠 | Beyotime | -- |
| 免疫组化 | MICAL-L2抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-24826 |
| c-Myc抗体 | Biosynthesis Biotechnology Co., Ltd | bs4963R | |
| 统计分析 | SPSS 19.0统计软件 | SPSS | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:A549, NCI-H1299, NCI-H292, PC9, MRC5, BEAS-2B;培养基:DMEM(高糖)或RPMI 1640,添加10% FBS、青霉素(100 U/mL)、链霉素(100 μg/mL);培养条件:37℃、5% CO2。 阅读提示:Methods: Cell Culture |
| 基因转染 | siRNA序列:siMICAL-L2 #1, #2, #3;转染试剂:Lipofectamine 2000;转染时细胞密度约80%。 阅读提示:Methods: Plasmids and siRNAs |
| 细胞增殖检测 | CCK-8实验:每孔加入10 μL CCK-8溶液,孵育1小时;每组5个重复。EdU实验:0.2 μL EdU加入培养基,孵育2小时。 阅读提示:Methods: Cell Counting Kit-8 Assay; Ethynyl-2-deoxyuridine (EdU) Incorporation Assays |
| 细胞周期分析 | 转染后48小时收集细胞;细胞浓度1.5 × 10^6 cells/mL;75%冰乙醇固定;RNase和碘化丙啶染色液孵育30分钟(37℃)。 阅读提示:Methods: Flow Cytometry |
| 蛋白质稳定性实验 | CHX处理浓度10 μg/mL;时间点:0, 30, 60, 90, 120 min。 阅读提示:Methods: Protein Stability Assays |
| 免疫共沉淀 | 细胞裂解液与抗体4℃孵育过夜;使用Protein A+G agarose beads沉淀。 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation (Co-IP) Assay |
| 泛素化检测 | 细胞共转染HA-ubiquitin和相关质粒;转染后48小时收集裂解液;80%用于Co-IP。 阅读提示:Methods: Polyubiquitination Assays |
| 免疫组化 | LUAD组织芯片:30例癌组织及配对癌旁组织;抗体:MICAL-L2 (PA5-24826), c-Myc (bs4963R)。 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry |
| 抑制剂处理 | AICAR (0.2 mM), chloroquine (10 μM), MG-132 (20 μM), Velcade (10 μM) 处理24小时。 阅读提示:Results: MICAL-L2 Regulates c-Myc Stability via Suppressing Ubiquitin-Mediated c-Myc Degradation, Figure 7 |