验证EspF与ANXA6的相互作用
确认EspF是否与宿主蛋白ANXA6结合,并定位结合域。
在HEK293细胞中共表达pECFP-EspF-flag和pEYFP-ANXA6-HA,通过FRET检测蛋白间距离(<10 nm),并通过CO-IP检测flag和HA标签的共沉淀;同时构建EspF N端(1-73 aa)和C端(74-248 aa)截短体进行CO-IP。
Enterohemorrhagic Escherichia coli Effector Protein EspF Interacts With Host Protein ANXA6 and Triggers Myosin Light Chain Kinase (MLCK)-Dependent Tight Junction Dysregulation.
包含体外细胞模型(Caco-2、HEK293)、细菌感染实验、FRET、CO-IP、Western blot和免疫荧光,覆盖互作验证、功能验证和机制通路验证。
Caco-2细胞单层模型 HEK293细胞
EspF与ANXA6互作依赖EspF C端(74-248 aa) Caco-2细胞中EspF/ANXA6表达或共表达降低ZO-1和occludin水平并破坏ZO-1分布 EspF-ANXA6共表达激活MLCK、诱导p-MLC和p-PKCα增加并降低钙调蛋白水平 EHEC感染WT菌株导致TER下降和ZO-1/occludin降低,ΔespF菌株减弱该效应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认EspF是否与宿主蛋白ANXA6结合,并定位结合域。
在HEK293细胞中共表达pECFP-EspF-flag和pEYFP-ANXA6-HA,通过FRET检测蛋白间距离(<10 nm),并通过CO-IP检测flag和HA标签的共沉淀;同时构建EspF N端(1-73 aa)和C端(74-248 aa)截短体进行CO-IP。
探讨EspF/ANXA6单独或共表达是否改变TJ蛋白ZO-1和occludin的水平及ZO-1的分布。
在Caco-2细胞中单独或共转染pEGFP-EspF-flag(EE)和pEYFP-ANXA6-HA(YA),或以pEYFP-EspF-T2A-ANXA6-HA(EYEA)共表达,通过Western blot检测ZO-1和occludin水平,通过免疫荧光检测ZO-1分布和荧光强度。
验证EspF-ANXA6共表达是否激活MLCK-MLC信号通路。
在Caco-2细胞中转染EYEA或EE,通过Western blot检测MLCK、p-MLC、MLC、p-PKCα、PKCα和钙调蛋白的水平。
确定EspF在EHEC感染诱导的TER下降和TJ蛋白减少中的作用。
Caco-2细胞在Transwell上培养至快速生长期,感染EHEC野生型(WT)、espF缺失株(ΔespF)和补株(p-ΔespF),MOI=100,监测TER变化,并通过Western blot检测ZO-1和occludin水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | DMEM(杜氏改良Eagle培养基,Gibco) | Gibco | -- |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | -- |
| 青霉素-链霉素溶液 | Gibco | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| TER测量 | EVOM电压表 | -- | -- |
| 细胞培养 | Transwell小室(6.5 mm,0.4 μm孔径) | Corning | -- |
| 免疫荧光 | Hoechst染料 | Beyotime | C1027 |
| 免疫共沉淀 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| Protein A+G琼脂糖珠 | Beyotime | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Merck Millipore | -- |
| 牛血清白蛋白 | Gbcbio | -- | |
| ECL化学发光底物试剂盒 | Millipore | WBKLS0100 | |
| 抗体 | 抗Flag抗体 | Sigma | F1804 |
| 抗HA抗体 | Bioworld | AP0005M | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗ZO-1抗体 | Abcam | ab216880 | |
| 抗ANXA6抗体 | Thermo Fisher Scientific | 720161 | |
| 抗磷酸化MLC抗体 | CST | 3674T | |
| 抗MLC抗体 | CST | 3672S | |
| 抗磷酸化PKCα抗体 | Santa Cruz | sc-377565 | |
| 抗PKCα抗体 | CST | 2056S | |
| 抗MLCK抗体 | BOSTER | BM4290 | |
| 抗钙调蛋白抗体 | Bioss | bs-3666R | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗 | Proteintech | SA00001-1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EspF-ANXA6互作验证 | 细胞类型(HEK293)、质粒构建(pECFP-EspF-flag、pEYFP-ANXA6-HA、pEGFP-EspF/N-flag、pEGFP-EspF/C-flag)、转染剂量(1 μg)、检测时间(48 h)、FRET参数(激发440 nm,发射520±20 nm)、CO-IP抗体(anti-Flag、anti-HA)、阴性对照(IgG) 阅读提示:Materials and Methods中的'Fluorescence Resonance Energy Transfer Assay'和'Co-immunoprecipitation Assays',以及Figure Legends 2和3 |
| TJ蛋白表达与分布 | Caco-2细胞培养条件、质粒转染(EE、YA、CO、EYEA)、转染剂量(1 μg)、检测时间(48 h)、抗体(anti-ZO-1 1:500、anti-occludin)、免疫荧光固定和封闭步骤 阅读提示:Materials and Methods中的'Immunofluorescence Assay'和'Western Blotting',以及Figure Legends 4和5 |
| MLCK-MLC通路激活 | Caco-2细胞转染(EYEA、EE、EY)、Western blot抗体浓度(anti-MLCK 1:400、anti-p-MLC 1:1000、anti-MLC 1:1000、anti-p-PKCα 1:500、anti-PKCα 1:1000、anti-Calmodulin 1:500)、蛋白上样量 阅读提示:Materials and Methods中的'Western Blotting',以及Figure Legend 6 |
| EHEC感染TER和TJ蛋白 | 细菌菌株(WT、ΔespF、p-ΔespF)、培养条件(LB、抗生素、L-arabinose)、感染MOI=100、TER测量时间点、Caco-2细胞培养天数(10-14天)、Transwell规格(6.5 mm, 0.4 μm) 阅读提示:Materials and Methods中的'Bacterial Strains and Cells'和'TER Measurement',以及Figure Legend 7 |