SALM4表达检测
验证SALM4在内皮细胞中的表达情况。
通过RT-PCR检测SALM4在HUVECs、人脐动脉内皮细胞、淋巴内皮细胞中的表达,并通过免疫荧光染色检测小鼠组织中的表达。
SALM4 regulates angiogenic functions in endothelial cells through VEGFR2 phosphorylation at Tyr1175.
包含体外细胞实验(HUVECs、MLECs)和体内动物模型(Salm4−/−小鼠、I/R模型),并进行功能验证(迁移、管形成、通透性)和机制验证(磷酸化位点及下游信号)。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 小鼠肺内皮细胞(MLECs) Salm4基因敲除小鼠(Salm4−/−) 大脑中动脉闭塞缺血再灌注模型
转染效率:HUVECs用siSALM4(80 nM)转染48小时 VEGF-A刺激浓度:HUVECs和MLECs使用20 ng/ml或40 ng/ml的VEGF-A Salm4−/−小鼠的生成:使用C57BL/6背景,敲除外显子2和3 I/R模型:大脑中动脉闭塞3小时后再灌注16小时 统计分析:使用配对双尾Student's t检验,数据以平均值±标准差或标准误表示
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SALM4在内皮细胞中的表达情况。
通过RT-PCR检测SALM4在HUVECs、人脐动脉内皮细胞、淋巴内皮细胞中的表达,并通过免疫荧光染色检测小鼠组织中的表达。
评估SALM4敲低对内皮细胞存活、迁移和管形成的影响。
用siSALM4转染HUVECs后,进行MTT细胞活力测定、伤口愈合迁移实验、Boyden小室趋化实验和Matrigel管形成实验。
验证Salm4缺失对VEGF-A诱导的体内血管生成的影响。
使用Matrigel plug实验和主动脉环出芽实验,比较WT和Salm4−/−小鼠的血管生成能力。
评估SALM4对VEGF-A诱导的血管通透性的影响。
使用TEER实验和Miles实验测定HUVECs和小鼠皮肤的血管通透性,并通过免疫荧光染色观察VE-cadherin和F-actin的分布。
确定SALM4调控的VEGFR2磷酸化位点及下游信号通路。
通过Western blot检测VEGFR2在Y951、Y1175、Y1214位点的磷酸化以及下游ERK、PI3K、AKT、eNOS的磷酸化。
分析Salm4敲除对VEGF-A诱导的基因转录的影响。
对WT和Salm4−/− MLECs进行mRNA测序,比较VEGF-A刺激0、4、8小时后基因表达差异。
评估Salm4缺失对脑I/R损伤的保护作用。
通过大脑中动脉闭塞诱导I/R,比较WT和Salm4−/−小鼠的脑梗死体积、BBB通透性、紧密连接蛋白表达和神经炎症反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | 胶原酶II型 | Worthington Biochemical | LS004176 |
| 细胞培养 | M199培养基 | HyClone | SH3025301 |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | MilliporeSigma | GF003AF-MG | |
| 肝素 | -- | -- | |
| 明胶 | -- | -- | |
| 小鼠基因敲除 | 小鼠胚胎干细胞克隆 | Velocigene | 15252A-A12 |
| 免疫荧光染色 | 抗小鼠CD31抗体 | BD Biosciences | 550274 |
| β-半乳糖苷酶抗体 | Thermo Fisher Scientific | A11132 | |
| ZO-1抗体 | Thermo Fisher Scientific | 617300 | |
| claudin-5抗体 | Thermo Fisher Scientific | 341600 | |
| occludin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-8145 | |
| ICAM1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-8439 | |
| VCAM1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-8304 | |
| GFAP抗体 | MilliporeSigma | MAB360 | |
| CD11b抗体 | BD Biosciences | 550282 | |
| 抗大鼠Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher Scientific | A21209 | |
| 抗兔Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A21206 | |
| 抗山羊Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A11055 | |
| 抗小鼠Alexa Fluor 488抗体 | Thermo Fisher Scientific | A11001 | |
| DAPI | MilliporeSigma | D8417 | |
| VE-钙黏蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-9989 | |
| F-肌动蛋白 | Thermo Fisher Scientific | R415 | |
| 抗体稀释液 | Agilent Technologies | S3022 | |
| 显微镜分析 | 共聚焦显微镜LSM 700 Meta | Carl Zeiss | -- |
| 转染 | Lipofectamine | Thermo Fisher Scientific | 18324 |
| Lipofectamine LTX和Plus试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15338 | |
| pEGFP-N1 | -- | U55762 | |
| pFLAG-CMV2 | MilliporeSigma | E7398 | |
| 细胞活力 | MTT | -- | -- |
| 迁移实验 | Transwell小室 | BD Biosciences | 3422 |
| Matrigel | BD Biosciences | 354230 | |
| 细胞分离 | 胶原酶II型和IV型 | Worthington Biochemical | LS004188 |
| 70μm细胞筛网 | BD Biosciences | 352350 | |
| CD31偶联磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 11035 | |
| ICAM2偶联磁珠 | BD Biosciences | 553326 | |
| 细胞培养 | 内皮基础培养基2 | Lonza | CC-3156 |
| 内皮生长培养基2试剂盒 | Lonza | CC-4176 | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 05892970001 |
| PVDF膜 | MilliporeSigma | IPVH00010 | |
| 抗磷酸化VEGFR2-Y951抗体 | Cell Signaling Technology | 4991 | |
| 抗VEGFR2-Y1175抗体 | Cell Signaling Technology | 2478 | |
| 抗VEGFR2抗体 | Cell Signaling Technology | 2479 | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9106 | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 抗磷酸化PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4228 | |
| 抗PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4292 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗eNOS抗体 | Cell Signaling Technology | 9572 | |
| 抗NRP1抗体 | Cell Signaling Technology | 3725 | |
| 抗NRP2抗体 | Cell Signaling Technology | 3366 | |
| 抗磷酸化VEGFR2-Y1214抗体 | R&D Systems | AF1766 | |
| 抗磷酸化eNOS抗体 | Bioss Antibodies | bs-3447R | |
| 抗VEGFR1抗体 | Abcam | ab32152 | |
| 抗GFP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-9996 | |
| 抗Flag M2抗体 | MilliporeSigma | F1804 | |
| 抗VE-PTP抗体 | Cloud-Clone | PAB048Hu01 | |
| 抗PTP1B抗体 | R&D Systems | AF1366 | |
| 抗IgG抗体 | GeneTex | 26702 | |
| 抗SALM4抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-20706 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-15739 | |
| 山羊抗兔辣根过氧化物酶 | Thermo Fisher Scientific | 31460 | |
| 山羊抗小鼠辣根过氧化物酶 | Thermo Fisher Scientific | 31430 | |
| 化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 32106 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | MilliporeSigma | 16-156 |
| 动物实验 | 三溴乙醇(阿佛丁) | -- | -- |
| 伊文思蓝 | MilliporeSigma | E2129 | |
| 组胺 | MilliporeSigma | H7125 | |
| 6-0硅胶涂层单丝缝线 | Doccol | 602156PK10 | |
| 加热垫 | Jeung-Do Bio and Plant | JD-OT-03106 | |
| 定量PCR | Maxima Sybr Green/Rox qPCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | K0221 |
| CRISPR/Cas9 | Cas9 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HUVECs培养条件:20% FBS、100 U/ml青霉素、100 μg/ml链霉素、3 ng/ml FGF、5 U/μl肝素,明胶包被,37°C、5% CO2,使用3-7代。 阅读提示:Materials and Methods: Isolation and culture of umbilical cord blood mononuclear cells and HUVECs |
| 基因敲除小鼠 | Salm4−/−小鼠生成:C57BL/6背景,敲除外显子2和3,胚胎干细胞克隆来自C57BL/6N,雄性小鼠用于实验。 阅读提示:Materials and Methods: Generation of Salm4−/− mice |
| siRNA转染 | HUVECs转染:siRNA浓度80 nM,Lipofectamine转染3小时,48小时后检测。 阅读提示:Materials and Methods: Transfection of small interfering RNAs and plasmids into HUVECs |
| 细胞功能实验 | MTT:细胞密度3×10^4 cells/ml,VEGF-A 40 ng/ml处理12小时;迁移:VEGF-A 40 ng/ml,8小时;管形成:1.5×10^5 cells/ml,10小时。 阅读提示:Materials and Methods: 3-(4,5-Dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl-2H-tetrazolium bromide assay, EC migration assay, In vitro tube formation assay |
| 血管通透性 | TEER:HUVECs生长至汇合,VEGF-A 50 ng/ml处理30分钟;Miles:小鼠6-8周龄,EB静脉注射,VEGF-A 50 ng/ml或组胺200 nmol/ml皮内注射,30分钟后测量。 阅读提示:Materials and Methods: Trans-endothelial/epithelial resistance assay, Miles vascular permeability assay |
| 体内血管生成 | Matrigel plug:6周龄小鼠,Matrigel含VEGF-A 200 ng/ml或FGF-2 200 ng/ml,10 U/ml肝素,皮下注射,7天后分析。 阅读提示:Materials and Methods: Matrigel plug angiogenesis assay |
| 缺血再灌注模型 | MCAO:8-10周龄小鼠,左大脑中动脉闭塞3小时,再灌注16小时,使用硅胶涂层缝线,体温维持37°C。 阅读提示:Materials and Methods: I/R model through middle cerebral artery occlusion |
| 信号通路分析 | VEGF-A刺激浓度:20 ng/ml(信号通路实验),处理时间未明确说明;Western blot检测各磷酸化位点。 阅读提示:Results: SALM4 controls VEGFR2-Y1175 phosphorylation in response to VEGF-A stimulation |