临床样本收集与免疫组化分析
检测结肠癌组织和癌旁组织中C/EBPα的表达,并分析其与临床病理参数的关系。
收集48例结肠癌患者的肿瘤和癌旁组织,固定包埋后切片,进行免疫组化染色,评估C/EBPα表达水平,并统计分析其与性别、年龄、肿瘤大小、TNM分期和淋巴结转移的关系。
Association of the invasiveness of colon cancer with the expression of C/EBPα.
包含临床样本免疫组化分析和细胞功能实验(划痕实验)及机制相关蛋白检测,但缺乏动物模型和更深入的机制验证。
SW480细胞系 48例结肠癌患者肿瘤及癌旁组织样本
C/EBPα在结肠癌组织中的表达水平(通过免疫组化评分) C/EBPα过表达对SW480细胞迁移能力的影响(划痕实验,观察0、24、48、72小时) C/EBPα过表达后KLF5、MMP-2、MMP-9和ECD蛋白表达的变化 C/EBPα表达与临床病理参数(肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移)的相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测结肠癌组织和癌旁组织中C/EBPα的表达,并分析其与临床病理参数的关系。
收集48例结肠癌患者的肿瘤和癌旁组织,固定包埋后切片,进行免疫组化染色,评估C/EBPα表达水平,并统计分析其与性别、年龄、肿瘤大小、TNM分期和淋巴结转移的关系。
构建C/EBPα过表达载体,用于后续细胞转染实验。
从人C/EBPα cDNA文库中PCR扩增C/EBPα编码序列,经BamHI和EcoRI双酶切后连接到pCDGFP载体,转化TG1感受态细胞,筛选阳性克隆并测序验证。
在SW480细胞中过表达C/EBPα,以研究其对细胞行为的影响。
SW480细胞用含10%FBS的DMEM培养,脂质体法转染pCDGFP-C/EBPα质粒,以空载体为阴性对照。转染后检测C/EBPα表达。
评估C/EBPα过表达对SW480细胞迁移(侵袭)能力的影响。
对转染和未转染的SW480细胞进行划痕实验,在0、24、48、72小时观察并测量划痕宽度,计算细胞迁移率。
验证C/EBPα在转染细胞中的过表达效果。
提取转染和未转染细胞的总RNA,反转录合成cDNA,进行实时定量PCR检测C/EBPα mRNA水平,以cyclophilin为内参。
检测C/EBPα过表达对肿瘤侵袭相关蛋白(KLF5、MMP-2、MMP-9、ECD)表达的影响。
收集转染后48小时的细胞,提取总蛋白,用BCA法测定浓度,SDS-PAGE分离后转膜,用特异性抗体检测KLF5、MMP-2、MMP-9、ECD和β-actin的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 柠檬酸缓冲液 | 北京索莱宝科技有限公司 | -- |
| 过氧化物酶封闭试剂 | Dako; Agilent Technologies, Inc. | -- | |
| 抗C/EBPα抗体 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | sc-61 | |
| 抗小鼠IgG二抗 | Amyjet Scientific | A21010 | |
| ChemMate Envision检测系统 | Dako; Agilent Technologies, Inc. | -- | |
| 免疫前血清 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 质粒构建 | PrimeSTAR聚合酶 | -- | -- |
| BamHI限制性内切酶 | -- | -- | |
| EcoRI限制性内切酶 | -- | -- | |
| T4连接酶 | -- | -- | |
| TG1感受态大肠杆菌 | -- | -- | |
| 细胞培养 | SW480细胞系 | Biowit Technologies Ltd. | -- |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | Merck KGaA | -- | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 10099158 | |
| 细胞转染 | Opti-MEM™培养基 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| RNA提取与RT-qPCR | TRIzol®试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| Taq聚合酶 | Qiagen GmbH | -- | |
| PCR试剂盒 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| Superscript III第一链cDNA合成试剂盒 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| StepOne™实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| RT-qPCR | C/EBPα PCR引物 | GenScript | -- |
| Western blot | Centrifuge 5804/5804 R离心机 | Eppendorf | -- |
| 增强型BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| KLF5抗体 | BIOSS | bs-2020R | |
| MMP-2抗体 | BIOSS | bs-4599R | |
| MMP-9抗体 | BIOSS | bs-20619R | |
| ECD抗体 | BIOSS | -- | |
| 抗β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | sc-47778 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | EarthOx Life Sciences | E030120-01 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | EarthOx Life Sciences | E030110-01 | |
| 增强化学发光试剂 | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 样本量:48例结肠癌患者;样本类型:肿瘤组织和癌旁组织(距肿瘤边缘>5cm);患者年龄范围32-78岁;性别组成;TNM分期分布;淋巴结转移状态 阅读提示:Methods - Clinical data |
| 免疫组织化学 | 一抗浓度(1:200),抗原修复条件(柠檬酸缓冲液98°C 30分钟),评分标准,双人独立评分 阅读提示:Methods - Immunohistochemistry |
| 细胞培养 | SW480细胞来源,培养基成分(DMEM+10% FBS+50 U/ml青霉素/链霉素),培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 2000,15μl),质粒量(5 μg),转染时间(4-6小时),以及后续培时间(24-72小时) 阅读提示:Methods - Cell transfection |
| 划痕实验 | 细胞铺板密度,划痕时间(转染后6小时),观察时间点(0,24,48,72小时),观察点数(10),迁移率计算方法 阅读提示:Methods - Wound-healing assay |
| Western blot | 蛋白提取离心条件(12,000×g, 4°C, 5分钟),上样量(30 μg),一抗浓度(1:500或1:1000),二抗浓度(1:1000) 阅读提示:Methods - Western blot analysis |