利用重编程因子mRNA诱导小鼠胚胎成纤维细胞的多能性状态

Pluripotent state induction in mouse embryonic fibroblast using mRNAs of reprogramming factors.

作者信息Ahmed Kamel El-Sayed, Zhentao Zhang, Lei Zhang, Zhiyong Liu, Louise C Abbott, Yani Zhang, Bichun Li
PMID25437916
发布时间2014-11-27
DOI10.3390/ijms151221840

实验完整度

研究包含体外细胞重编程、分子表达检测(RT-PCR、qPCR)、表观遗传分析(亚硫酸盐测序)、体外分化(EB形成)及体内畸胎瘤形成等多项独立验证。

主要模型

小鼠胚胎成纤维细胞(MEF) mRNA诱导多能干细胞(mRNA iPSCs) SCID小鼠畸胎瘤模型

重点核对

mRNA浓度:每因子0.25 μg,总1 μg 转染次数:5次每日重复转染 细胞密度:1×10^5 MEF细胞 ES细胞培养条件:含LIF的培养基

摘要

体细胞重编程具有巨大的潜力,可为多种疾病提供治疗方法,并有助于理解早期胚胎发育的机制。通过基于mRNA的方法改进诱导多能干细胞(iPSCs)的产生是目前研究的热点。该方法较以往使用的DNA整合和插入突变等方法具有诸多优势。通过转染特异性合成的多种多能性因子的mRNA,我们从小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)中产生了iPSCs。在重编程过程的不同时间点评估了iPSCs的遗传、表观遗传和功能特性。我们成功引入了合成的mRNA,这些mRNA在细胞内正确定位,并表现出高效且稳定的蛋白质翻译。我们的工作证明了多能性标志物(包括未转染的因子如Nanog、SSEA-1(阶段特异性胚胎抗原1)和Rex-1(ZFP-42,锌指蛋白42))的稳健上调和启动子逐渐去甲基化。使用胚胎干细胞(ESCs)培养条件培养iPS细胞,仅经过五次每日重复转染,约12天后形成ES样集落。这些集落对碱性磷酸酶和与ESCs相关的多能性特异性标志物呈阳性。本研究揭示了通过将多种多能性因子的特异性合成mRNA转染到小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)中,能够诱导多能性并产生小鼠mRNA诱导多能干细胞(mRNA iPSCs)。这些产生的iPSCs表现出与ESCs相似的分子和功能特性,表明该方法是一种高效且可行的ESCs替代方法,可用于进一步的生物学、发育和治疗研究。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
能否通过转染特异性合成的重编程因子mRNA,以较短的暴露时间(五次转染)诱导小鼠胚胎成纤维细胞获得多能性,并建立一种安全高效的iPSCs生成方法?
核心机制
外源mRNA翻译的重编程因子(Oct4、Sox2、c-Myc、Klf4)在细胞内正确入核,激活内源多能性基因(如Nanog、Rex1)表达,并伴随启动子区域CpG位点的渐进性去甲基化,从而实现体细胞重编程。
主要证据
五次mRNA转染后,MEF细胞出现ES样集落,表达多能性标志物(Oct4、Sox2、Nanog、SSEA-1等),碱性磷酸酶染色阳性;Nanog和Oct4启动子区域去甲基化比例升高;体外形成拟胚体并表达三胚层标志物,体内形成含三胚层组织的畸胎瘤。
研究意义
该方法避免了DNA整合和插入突变风险,提供了一种安全、高效的非整合型iPSCs生成途径,可作为ESCs的替代方案,用于生物学、发育及治疗研究。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

质粒构建与mRNA合成

构建携带重编程因子ORF的质粒,并通过体外转录合成mRNA

从鼠组织(睾丸、小肠、结肠)中RT-PCR扩增Oct4、Sox2、c-Myc和Klf4的cDNA,克隆至pCDNA3载体,测序验证后线性化,使用mMESSAGE mMACHINE T7 Kit进行体外转录并纯化mRNA。

2

优化转染条件

确定最优mRNA转染剂量及蛋白表达动力学

用GFP mRNA转染MEF细胞,通过FACS比较不同剂量(1, 1.5, 2 μg)的表达效率,并监测蛋白表达随时间(6-72小时)的变化。

3

mRNA iPSCs的诱导与形成

通过重复转染重编程因子mRNA诱导MEF细胞重编程为iPSCs

MEF细胞以1 × 10^5细胞接种,每天转染1 μg总mRNA(每因子0.25 μg),连续5天,随后更换为ES细胞培养基,观察细胞形态变化及集落形成,直至出现ES样集落。

4

iPSCs的多能性表征

验证iPSCs的分子和功能特性是否与ESCs相似

通过免疫荧光、RT-PCR检测多能性标志物表达,碱性磷酸酶染色,亚硫酸盐测序分析启动子甲基化,EB形成及三胚层分化,畸胎瘤形成实验和核型分析。

5

重编程过程中基因表达和甲基化动态监测

追踪重编程过程中多能性基因的表达水平和启动子甲基化变化

在重编程不同时间点(D1, D6, D9, D12, D15)通过qRT-PCR检测总及内源的多能性因子表达,通过亚硫酸盐测序检测Nanog和Oct4启动子甲基化状态。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
TRIZOL试剂Invitrogen15596-026
NanoDrop 1000分光光度计Thermo Scientific--
PrimeScript RT试剂盒TakaraDRR037A
PrimeSTAR Max DNA聚合酶TakaraDR045A
通用DNA纯化试剂盒TIANGENDP214
TIANprep质粒小提试剂盒TIANGENDP103
EcoRI限制酶----
XhoI限制酶----
T4 DNA连接酶Takara2011A
mMESSAGE mMACHINE T7试剂盒AmbionAM1345
MEGAclear试剂盒AmbionAM1908
DMEM培养基Corning--
胎牛血清Hyclone--
L-谷氨酰胺Gibco25030-081
青霉素-链霉素----
白血病抑制因子Sigma--
非必需氨基酸SigmaM7145
TransIT-mRNA转染试剂盒Mirus BioMIR2225
Opti-MEM培养基----
胰蛋白酶/EDTAGibco--
SYBR Premix Ex Taq (Tli RNaseH Plus)TakaraRR420A
7500实时荧光定量PCR系统ABI--
Triton X-100----
牛血清白蛋白----
抗Oct4抗体Abcam--
抗Sox2抗体Novus BiologicalsNB110-37235
抗Nanog抗体Abcam--
抗c-Myc抗体Biossbs-4963R
抗Klf4抗体Biossbs-1064R
Alexa Fluor 488标记抗兔IgGInvitrogen--
DAPIInvitrogen--
FACSAria流式细胞仪Becton-Dickinson--
AP染色试剂盒SiDanSai1101-050
EZ DNA甲基化试剂盒ZYMO RESEARCHD5001
TOP10感受态细胞Vazyme Biotech--
抗平滑肌肌动蛋白抗体Abcamab5694
抗Sox17抗体Santa Cruzcs-299
抗βIII微管蛋白抗体Abcamab52901
Cy3标记抗兔IgGInvitrogenA10520
SCID小鼠----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
质粒构建与mRNA合成
限制性内切酶EcoRI和XhoI的酶切位点设计;T7 RNA聚合酶体外转录条件;mRNA纯度及完整性
阅读提示:Methods 4.1-4.3
细胞培养和转染
MEF细胞代数(3代内);转染试剂盒用量(2 μL BOOST试剂、2 μL TransIT-mRNA);mRNA剂量(1 μg);转染后培养基更换时间(12小时)
阅读提示:Methods 4.4-4.6
重编程诱导
细胞初始密度(1×10^5);转染次数(5次);每日转染间隔;ES培养基成分(含LIF)
阅读提示:Results 2.3, Methods 4.5
多能性验证
免疫荧光抗体的稀释比例;碱性磷酸酶染色试剂盒;亚硫酸盐测序克隆数(10个);畸胎瘤注射细胞数(1×10^7细胞/mL)
阅读提示:Methods 4.8, 4.10-4.13
基因表达和表观遗传分析
qRT-PCR内参基因(Gapdh);检测时间点(D1, D6, D9, D12, D15);亚硫酸盐测序引物序列
阅读提示:Methods 4.7, 4.11