验证HTN-CK2α的激酶活性
确认带有HaloTag标签的CK2α是否保持正常的结构和激酶活性。
通过结构建模预测HTN-CK2α的空间结构,用HaloTrap免疫沉淀检测与CK2β的相互作用,并用ADP-Glo实验测定激酶活性。
Targeted O-GlcNAcylation of CK2α Triggers Its Ubiquitin-Proteasome Degradation and Alters Downstream Phosphorylation.
包含体外激酶活性测定、细胞水平OGTAC诱导O-GlcNAc修饰、CHX追踪降解实验、泛素化检测、CRL4CRBN组分过表达/敲低、co-IP、体外pull-down及下游磷酸化检测等多个证据层级,并进行功能与机制验证。
HeLa细胞 HCT116细胞 HEK293T细胞
HTN-CK2α与fOGT的共转染比例(1:0.2) OGTAC-1处理浓度(100 nM)和处理时间(8小时) CHX追踪实验中CHX浓度(50 μg/mL)及时间点 MG132(25 μM)和CQ(100 μM)处理条件 CRL4CRBN组分(CUL4A、DDB1、CRBN)的敲低效率
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认带有HaloTag标签的CK2α是否保持正常的结构和激酶活性。
通过结构建模预测HTN-CK2α的空间结构,用HaloTrap免疫沉淀检测与CK2β的相互作用,并用ADP-Glo实验测定激酶活性。
验证OGTAC-1能否特异地在活细胞中诱导CK2α Ser347位点的O-GlcNAc修饰。
在共表达fOGT和HTN-CK2α的HeLa细胞中,用不同浓度的OGTAC-1处理8小时,通过免疫沉淀和RL2抗体检测O-GlcNAc水平;用S347A突变体验证位点特异性;用GalT标记和PEG化实验确认无新位点。
探究OGTAC-1诱导的O-GlcNAc修饰是否影响CK2α的蛋白稳定性。
用CHX追踪实验比较OGTAC-1处理与DMSO处理的HTN-CK2αWT和S347A的降解速率;用MG132和CQ处理检测降解途径。
验证CK2α的降解是否通过泛素-蛋白酶体途径,并检测O-GlcNAc修饰对泛素化的影响。
在MG132预处理后,用OGTAC-1处理细胞,通过HaloTrap捕获HTN-CK2α,用抗泛素抗体检测泛素化水平。
确认CK2α是否为CRL4CRBN复合物的底物。
过表达CRL4CRBN组分(CUL4A、DDB1、CRBN)检测CK2α泛素化变化;进行co-IP验证相互作用;用siRNA敲低各组分检测内源CK2α水平和降解速率。
探究O-GlcNAc修饰是否增强CK2α与CRBN的相互作用。
在共表达HTN-CK2α(WT或S347A)和Flag-CRBN的细胞中,用OGTAC-1处理后进行co-IP检测CRBN结合量;体外pull-down验证。
评估CK2α O-GlcNAc修饰对下游信号通路磷酸化的影响。
用OGTAC-1处理细胞,通过Western blot检测Akt Ser129/Ser473/Thr308、PFKP Ser386、NF-κB P65 Ser529、STAT3 Ser727、PTEN Ser370的磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Gibco-Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Gibco-Invitrogen | -- | |
| 转染 | Lipo2000转染试剂 | AboRo | RL0401 |
| 药物处理 | OGTAC-1 | -- | -- |
| 硫胺素G | Bidepharm | BD571819 | |
| MG132 | MedChemExpress | HY-13259 | |
| 氯喹 | MedChemExpress | HY-17589A | |
| SGC-CK2-1 | MedChemExpress | HY-139004 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| 免疫沉淀 | RIPA裂解液 | ThermoFisher | 89900 |
| 免疫沉淀裂解液 | ThermoFisher | 87787 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | MedChemExpress | HY-K0010 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | MedChemExpress | HY-K0021 | |
| 通用苯甲酸核酸酶 | Vazyme | RM1022-01 | |
| 蛋白A/G磁珠 | MedChemExpress | HY-K0202 | |
| 抗Flag磁珠 | MedChemExpress | HY-K0207 | |
| 抗Myc标签磁珠 | MedChemExpress | HY-K0206 | |
| HaloTrap磁性琼脂糖 | Proteintech | #otma | |
| 2×SDS上样缓冲液 | Bio-Rad | #161-0737 | |
| 体外下拉 | 甘氨酸 | Meryer | M19902 |
| 蛋白质印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoFisher | 23225 |
| SDS-PAGE凝胶 | Vazyme | E302-01/E304-01 | |
| 预染蛋白分子量标准 | Vazyme | MP102-01 | |
| 抗RL2抗体 | Abcam | ab2739 | |
| 抗CK2α抗体 | Cell Signaling Technology | 2656 | |
| 抗CK2β抗体 | ABclonal | A14722 | |
| 抗泛素抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8017 | |
| 抗β-actin抗体 | ABclonal | AC026或AC004 | |
| 抗OGT抗体 | Cell Signaling Technology | 24083 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47724 | |
| 抗Vinculin抗体 | Santa Cruz Biotechnology或ABclonal | sc-73614或A2752 | |
| 抗HaloTag抗体 | Promega | G9211 | |
| 抗CRBN抗体 | Cell Signaling Technology | 71810 | |
| 抗DDB1抗体 | Fortis | A300-462A | |
| 抗CUL4A抗体 | Fortis | A300-739A | |
| 抗PFKP抗体 | Cell Signaling Technology | 8164 | |
| 抗PFKP磷酸化Ser386抗体 | Signalway | SAB616 | |
| 抗Myc标签抗体 | MedChemExpress | HY-P80232 | |
| 抗Flag标签抗体 | MedChemExpress | HY-P80111 | |
| 抗HA标签抗体 | Vazyme | RA1004 | |
| 抗Akt1抗体 | MedChemExpress | HY-P80007 | |
| 抗Akt1磷酸化Ser129抗体 | Abcam | ab133458 | |
| 抗Akt磷酸化Thr308抗体 | UpingBio | YP-Ab-14409 | |
| 抗Akt1磷酸化Ser473抗体 | MedChemExpress | HY-P80788 | |
| 抗NFκB P65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗NFκB P65磷酸化Ser529抗体 | MedChemExpress | HY-P80470 | |
| 抗STAT3抗体 | MedChemExpress | HY-P80902 | |
| 抗STAT3磷酸化Ser727抗体 | MedChemExpress | HY-P80281 | |
| 抗PTEN抗体 | MedChemExpress | HY-P80286 | |
| 抗PTEN磷酸化Ser370抗体 | Abcam | ab195056 | |
| 抗磷酸化CK2底物[(pS/pT)DXE] MultiMab抗体 | Cell Signaling Technology | 8738 | |
| 抗兔HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 抗鼠HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗兔DyLight 488荧光二抗 | ThermoFisher | 35522 | |
| 抗鼠DyLight 488荧光二抗 | ThermoFisher | 35503 | |
| 泛素化检测 | N-乙基马来酰亚胺 | MedChemExpress/BidePharm | HY-D0843/BD144276 |
| 敲低 | siRNA-Mate转染试剂 | GenePharma | G04002 |
| Lipo2000 | Vazyme | TL201 | |
| 蛋白质纯化 | Halo-Link树脂 | Promega | G1912 |
| 激酶活性测定 | Kinase-Lumi Max发光激酶检测试剂盒 | Beyotime | S0158S |
| 酪蛋白激酶2底物肽 | MedChemExpress | HY-P3815 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 诱导CK2α O-GlcNAc修饰 | HTN-CK2α与fOGT的共转染比例(1:0.2);OGTAC-1浓度(100 nM)和处理时间(8小时);细胞系(HeLa) 阅读提示:Methods: Cell Culture, DNA Constructs, and Reagents; Results and Discussion: OGTAC-1 Specifically Induces CK2α O-GlcNAcylation in Living Cells; Figure 2 |
| CHX追踪实验 | CHX浓度(50 μg/mL);时间点(0/3/6/12/24/36小时);OGTAC-1预处理浓度(1 μM)和时长(8小时);细胞系(HeLa和HCT116) 阅读提示:Methods: Cycloheximide (CHX) Chase Assay; Figure 3 |
| 泛素化检测 | MG132预处理浓度(25 μM)和时长(2小时);OGTAC-1浓度(100 nM)和处理时间(8小时);裂解液中NEM(100 mM)和EDTA(5 mM)的添加 阅读提示:Methods: CK2α Ubiquitination Assay; Figure 4 |
| CRL4CRBN组分过表达/敲低 | 过表达质粒(Flag-DDB1、Myc-CUL4A、Flag-CRBN);siRNA敲低序列和浓度(20 pmol);处理时间(36小时) 阅读提示:Methods: siRNA Knockdown; Results and Discussion: CK2α Is a Substrate of the CRL4CRBN E3 Ubiquitin Ligase Complex; Figures 5 and 6 |
| 下游磷酸化检测 | OGTAC-1浓度(10/100/1000 nM)和处理时间(8小时);SGC-CK2-1浓度(1 μM);TMG浓度(10 μM);抗体特异性(phospho-Akt Ser129/Ser473/Thr308, phospho-PFKP Ser386等) 阅读提示:Methods: Phosphorylation Assay; Results and Discussion: Targeted O-GlcNAcylation of CK2α Alters Downstream Phosphorylation; Figure 8 |