临床样本分析与相关性研究
探讨 PDGF-BB 在胆管癌组织中的表达水平及其与淋巴结转移和患者预后的关系。
收集 126 例胆管癌患者肿瘤组织,通过 IHC、免疫荧光、ELISA 检测 PDGF-BB 表达,分析其与淋巴结状态和总生存期的相关性。
Cancer-Associated Fibroblasts Promote Lymphatic Metastasis in Cholangiocarcinoma via the PDGF-BB/PDGFR-β Mediated Paracrine Signaling Network.
包含临床样本分析、体外细胞功能实验、体内动物模型及基因敲除和抑制剂验证,多层级证据支持机制结论。
胆管癌细胞系 QBC939 和 HuCCT1 原代癌症相关成纤维细胞(CAFs) 淋巴内皮细胞(HLECs) BALB/c 裸鼠皮下移植瘤及腘窝淋巴结转移模型
CAFs 的 LN+ 和 LN- 状态及其 PDGF-BB 分泌水平 PDGFB 基因敲除 CAFs(CAFPDGFB(KO))的验证 PDGF-BB 阻断抗体(50 μg/kg)和 PDGFR 抑制剂 STI571(50 mg/kg)的剂量及给药方式 GSK 抑制剂 CHIR-98014(20 mg/kg)和 P65 抑制剂 PG490(1 mg/kg)的剂量及给药方式 细胞共注射比例(肿瘤细胞 5×10^6,CAFs 5×10^5)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探讨 PDGF-BB 在胆管癌组织中的表达水平及其与淋巴结转移和患者预后的关系。
收集 126 例胆管癌患者肿瘤组织,通过 IHC、免疫荧光、ELISA 检测 PDGF-BB 表达,分析其与淋巴结状态和总生存期的相关性。
验证 CAFs 中 PDGF-BB 的表达是否高于正常成纤维细胞,并评估 LN+CAFs 对肿瘤细胞恶性行为的影响。
从 CCA 组织和癌旁组织分离原代 CAFs 和 NFs,通过 ELISA 和 Western blot 检测 PDGF-BB 分泌;用 LN+CAFs 和 LN-CAFs 的条件培养基处理肿瘤细胞,进行迁移、侵袭、跨内皮迁移、克隆形成和增殖实验。
评估 CAFs 分泌的 PDGF-BB 对淋巴内皮细胞迁移和管形成的影响。
用 LN+CAFs、LN-CAFs 和 CAFPDGFB(KO) 的条件培养基处理 HLECs,进行 Transwell 迁移和管形成实验。
验证 CAFs 及其分泌的 PDGF-BB 在体内对肿瘤生长和淋巴结转移的影响。
将 QBC939 或 HuCCT1 细胞单独或与 LN+CAFs、LN-CAFs、CAFPDGFB(KO) 共注射到裸鼠皮下或脚垫,监测肿瘤生长和腘窝淋巴结转移;用 PDGF-BB 抗体、STI571、CHIR-98014、PG490 处理。
探索 PDGF-BB 在肿瘤细胞和淋巴内皮细胞中激活的下游信号通路。
用 PDGF-BB 或 CAF 条件培养基处理肿瘤细胞和 HLECs,Western blot 检测 GSK3β、P65、JNK、ERK1/2 等磷酸化水平;使用抑制剂验证通路特异性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | α-SMA 抗体 | Servicebio | GB13044 |
| PDGF-BB 抗体 | ThermoFisher | PA588272 | |
| Podoplanin 抗体 | Novus | NBP1-90211 | |
| LYVE1 抗体 | Abcam | Ab281587 | |
| PDGFR-β 抗体 | Signalway Antibody | 41327 | |
| PDGFR-α 抗体 | Signalway Antibody | 33470 | |
| p-FAK 抗体 | Signalway Antibody | C90918Bio | |
| FAK 抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| p-AKT 抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| AKT 抗体 | Cell Signaling Technology | 2920 | |
| p-P65 抗体 | Abcam | Ab86299 | |
| P65 抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| p-JNK 抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| JNK 抗体 | Abcam | Ab76125 | |
| p-ERK 抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| ERK 抗体 | Cell Signaling Technology | 4696 | |
| p-GSK 抗体 | Cell Signaling Technology | 9336 | |
| GSK 抗体 | Cell Signaling Technology | 12456 | |
| p-YAP 抗体 | Cell Signaling Technology | 13008 | |
| YAP 抗体 | Cell Signaling Technology | 14074 | |
| Ki-67 抗体 | Servicebio | GB111499 | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | V900933 |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Servicebio | G1012 | |
| Alexa Fluor 偶联二抗 | Invitrogen | -- | |
| 激光共聚焦显微镜 LSM780 | Zeiss | -- | |
| 多重TSA染色 | TSA-AF488 | Invitrogen | B40953 |
| TSA-AF555 | Invitrogen | B40955 | |
| ELISA | PDGF-BB ELISA 试剂盒 | Enzyme linked Biotechnology Co. (MIbio) | ml001574J |
| 蛋白质组学分析 | Pierce™ BCA 蛋白测定试剂盒 | -- | -- |
| 测序级修饰胰蛋白酶 | Promega | V5111 | |
| Oasis HLB 柱 | Waters | 186000383 | |
| 动物实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| BALB/c 裸鼠 | Guangdong Province Experimental Animal Center | -- | |
| IVIS Spectrum 成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| Eclipse 80I 系统和 NIS-Elements 软件 | Nikon | -- | |
| 药物处理 | STI571(伊马替尼) | Selleck | -- |
| PG490(P65 抑制剂) | Applied InvivoChem Inc. | -- | |
| CHIR-98014(GSK 抑制剂) | Applied AOBIOUS Inc. | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | 样本量(126例)、来源(中山大学孙逸仙纪念医院)、时间(2012年1月至2018年7月)、纳入标准(病理确诊) 阅读提示:Patients and clinical samples 部分 |
| 细胞培养 | 细胞系(QBC939、HuCCT1、Huh28、HCCC-9810、ZJU-1125)、CAFs 和 NFs 的分离和纯化验证 阅读提示:Results 部分 Expression levels... 中有关细胞系和原代成纤维细胞分离的描述 |
| 体外功能实验 | CAF 条件培养基制备(80% 融合、无血清培养 24 小时)、Transwell 迁移/侵袭、TrEM、克隆形成、MTT 实验的具体参数 阅读提示:Figure 2 和 Figure 3 图注 |
| 淋巴管生成实验 | HLECs 来源、管形成实验和 Transwell 迁移的实验条件 阅读提示:Figure 4 和 Figure 5 图注 |
| 体内动物模型 | 小鼠品系(BALB/c 裸鼠)、年龄(4周)、体重(18-20g)、细胞注射数量、部位(皮下或脚垫)、共注射比例、处理药物剂量和时间 阅读提示:PLM model 和 Subcutaneous tumor models 部分 |
| 药物处理 | anti-PDGF-BB 抗体(50 μg/kg)、STI571(50 mg/kg)、CHIR-98014(20 mg/kg)、PG490(1 mg/kg)的剂量、给药方式(腹腔注射)、频率(每3天) 阅读提示:PLM model 和 Subcutaneous tumor models 部分 |
| 蛋白检测 | 抗体信息(品牌、编号)、蛋白提取和 Western blot 条件 阅读提示:Materials and Methods 中 IHC 部分及 Supplementary Table 2 |