构建母体高脂饮食模型并观察后代卵巢表型
评估母体妊娠期高脂饮食对后代原始卵泡形成的影响。
孕鼠随机分为正常饮食和高脂饮食组,在P0和P3观察后代卵巢,通过DDX4免疫荧光、RT-qPCR和Western blot检测卵泡形成、卵母细胞数量和标志基因表达。
Maternal vitamin B1 is a determinant for the fate of primordial follicle formation in offspring.
包含多种证据层级:小鼠模型、体外卵巢培养、单细胞测序、ATAC-seq、代谢组学、人类样本,以及功能验证(补充VB1、siRNA和抑制剂)。
C57BL/6小鼠 ICR小鼠 小鼠卵巢体外培养体系 原代小鼠颗粒细胞 人类GDM血清样本
母体饮食处理:正常饮食(D12451J)或高脂饮食(D12492),妊娠期全程 VB1补充剂量:0.25 mg/kg硫胺素腹腔注射,从E14.5开始 VB1拮抗剂:Amprolium 60 mg/kg灌胃,从E7.5开始 VB1缺乏饮食:从E14.5开始 胎仔卵巢取样时间点:P0和P3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估母体妊娠期高脂饮食对后代原始卵泡形成的影响。
孕鼠随机分为正常饮食和高脂饮食组,在P0和P3观察后代卵巢,通过DDX4免疫荧光、RT-qPCR和Western blot检测卵泡形成、卵母细胞数量和标志基因表达。
鉴定母体高脂饮食条件下与后代表型相关的关键代谢物。
通过UPLC-QTOF-MS对母体血清进行代谢组学分析,利用PCA和OPLS-DA区分代谢物谱,并鉴定差异代谢物和富集通路,关注维生素B1。
证明母体VB1水平是影响后代原始卵泡形成的关键因素。
构建VB1缺乏模型(mTA和mTD)和补充模型(mHFD+VB1),检测母体血清和后代卵巢VB1浓度、卵泡形成比例和胎儿生长指标。
检验母体高脂饮食是否通过改变肠道菌群影响VB1吸收。
通过16S rDNA扩增子测序分析菌群组成,检测肠道消化物VB1水平和VB1转运蛋白SLC19A3表达,并通过粪菌移植实验验证因果关系。
表征母体高脂饮食引起的生殖细胞和颗粒细胞的转录变化。
使用10x Genomics scRNA-seq分析P0和P3后代卵巢,鉴定细胞类型,提取生殖细胞进行拟时间分析,发现状态2细胞与线粒体功能相关。
证实VB1缺乏导致PDH活性降低和乙酰辅酶A减少,从而影响卵泡形成。
检测PDH活性和乙酰辅酶A水平,使用Pdha1 siRNA和CPI-613抑制PDH,观察对卵泡形成的影响。
阐明VB1缺乏导致乙酰辅酶A减少后如何影响表观遗传修饰。
通过Western blot检测组蛋白乙酰化水平,使用ATAC-seq分析染色质可及性,并鉴定差异可及区域和富集通路。
验证VB1缺乏导致的细胞周期和增殖缺陷是卵泡形成受损的原因。
使用EdU染色检测颗粒细胞增殖,流式细胞术分析细胞周期分布,并检测细胞周期相关基因的表达。
检验VB1水平是否与人类妊娠期糖尿病相关,以提示临床意义。
收集健康对照和GDM孕妇的血清,检测VB1、GLU、TG水平,进行oGTT,并进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | D12451J (对照组饮食) | Research Diets, Inc. | -- |
| D12492 (高脂饮食) | Research Diets, Inc. | -- | |
| 氨丙啉 | Selleck | S4144 | |
| 硫胺素 | Selleck | S3211 | |
| 硫胺素缺乏饮食 | Dyets | D201218 | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | C11330500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099-141 | |
| 双抗 | HyClone | SV30010 | |
| DMEM培养基 | HyClone | SH30022.01 | |
| siRNA转染 | TransIntro™转染试剂 | TransGen Biotech | FT301 |
| Pdha1 siRNA | GenePharma | -- | |
| Slc19a2 siRNA | GenePharma | -- | |
| Slc19a3 siRNA | GenePharma | -- | |
| 对照siRNA | GenePharma | -- | |
| 药物处理 | CPI-613 | Selleck | S2776 |
| 氨丙啉 | Selleck | S4144 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013C |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| BeyoECL Plus化学发光试剂盒 | Beyotime | A0018 | |
| RT-qPCR | EasyPure® RNA提取试剂盒 | TransGen Biotech | ER101 |
| 反转录试剂盒 | TransGen Biotech | AT311 | |
| TB Green预混液 | TaKaRa | RR820B | |
| Light Cycler 480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 免疫荧光 | 尼康荧光显微镜 | Nikon | A1 |
| DAPI染色液 | -- | -- | |
| Hoechst 33342染色液 | Beyotime | C1022 | |
| 免疫组化 | 苏木素 | -- | -- |
| 透射电镜 | HT7700透射电子显微镜 | Hitachi | -- |
| 代谢组学 | 超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱 | Agilent Technologies | -- |
| 1290液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- | |
| VB1检测 | VB1通用ELISA试剂盒 | Signalway Antibody Co. Ltd | EK4294 |
| 酶标仪 | -- | -- | |
| PDH活性检测 | PDH活性检测试剂盒 | Solarbio | BC0385 |
| 乙酰辅酶A检测 | 乙酰辅酶A检测试剂盒 | Sigma | MAK039 |
| 高氯酸 | Sigma | 34288 | |
| ATP检测 | 增强型ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0027 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 细胞周期分析 | 细胞周期检测试剂盒 | Beyotime | C1052 |
| FACS Calibur流式细胞仪 | Cytoflex LX | -- | |
| FlowJo V10软件 | -- | -- | |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 核糖核酸酶A | -- | -- | |
| scRNA-seq | 胶原酶 | Sigma-Aldrich | C5138 |
| 细胞筛网 | BD Falcon | 352340 | |
| 10x Genomics平台 | -- | -- | |
| ATAC-seq | AMPure DNA磁珠 | -- | -- |
| Agilent Tapestation 2200 | Agilent Technologies | -- | |
| 组织学 | 波因固定液 | Sigma | HT10132 |
| H&E染色试剂盒 | -- | -- | |
| 生物化学分析 | Cobas c-311生化分析仪 | Roche | -- |
| 葡萄糖生化试剂盒 | Roche | 04404483190 | |
| 甘油三酯生化试剂盒 | Roche | 20767107322 | |
| 体外培养 | 3D培养膜 | Millipore | PIHA01250 |
| 体外受精 | HTF培养基 | Aiber Biotechnology Co., Ltd | M1130 |
| TYH培养基 | Aiber Biotechnology Co., Ltd | M2030 | |
| KSOM培养基 | Aiber Biotechnology Co., Ltd | M1430 | |
| 蛋白检测 | AlphaView SA软件 | ProteinSimple | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6或ICR),饮食配方(D12492高脂饮食,D12451J正常饮食),饮食开始时间(E0.5),饲养环境(温度、湿度、光照周期) 阅读提示:Methods: Animal and ethics statement |
| VB1干预模型 | Amprolium剂量(60 mg/kg)、给药方式(灌胃)、给药时间(E7.5开始),VB1缺乏饮食喂养时间(E14.5开始),VB1补充剂量(0.25 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、给药时间(E14.5开始) 阅读提示:Methods: VB1 deficiency and supplementation models |
| 后代卵巢表型分析 | 取样时间点(P0和P3),免疫荧光染色用抗体(DDX4),卵泡计数标准(单个卵母细胞被颗粒细胞包裹),统计方法(Student's t test 或 ANOVA) 阅读提示:Methods: Immunofluorescence (IF), Figure 1 legend |
| 代谢组学分析 | 样本量(每组9只),仪器(UHPLC-Q/TOF-MS),数据处理软件(MassHunter, XCMS),显著差异代谢物筛选标准(P<0.05, VIP>1, FC>2) 阅读提示:Methods: Metabolomics sequencing and analysis |
| 肠道菌群分析 | 16S rDNA测序平台(BMKCloud),粪便样本收集时间点,FMT实验抗生素处理方案(0.5 g/L vancomycin, 1 g/L neomycin, 1 g/L metronidazole, 1 g/L ampicillin) 阅读提示:Methods: 16S rDNA amplicon sequencing and analysis, Antibiotic treatment and fecal transplantation experiments |
| 单细胞测序 | 样本量(每组5只),细胞制备方法(胶原酶消化),测序平台(10x Genomics),数据分析软件(Seurat, Monocle) 阅读提示:Methods: Single cell RNA-sequencing |
| 体外卵巢培养 | 培养时间(72小时),培养基(DMEM/F12 + 10% FBS + 1% 双抗),siRNA转染条件(1.5 μL转染试剂,2 μL 20 μM siRNA),Pdha1 siRNA序列(Pdha1-678) 阅读提示:Methods: Ovary culture in vitro, siRNA and inhibitor treatment |
| 表观遗传学分析 | 组蛋白乙酰化检测抗体(Ac-H3, Ac-H4, Ac-H3K9, Ac-H3K18),ATAC-seq样本量(每组2个重复,每个重复50个卵巢),峰值识别标准(IDR阈值0.05) 阅读提示:Methods: Western blot, ATAC sequencing |
| 人类样本验证 | 样本量(每组31例),GDM诊断标准(空腹血糖≥5.1 mmol/L,1h血糖≥10.0 mmol/L,2h血糖≥8.5 mmol/L),VB1检测方法(ELISA) 阅读提示:Methods: Human participants, Serum biochemical parameters |