建立内质网应激模型
确定TM诱导HepG2细胞内质网应激的合适浓度,并观察Sestrin2表达变化。
不同浓度TM(0、0.5、1、2、5、10 μg/mL)处理HepG2细胞24小时,检测细胞活力、Sestrin2和内质网应激标志物表达。
Sestrin2 Overexpression Ameliorates Endoplasmic Reticulum Stress-Induced Apoptosis via Inhibiting mTOR Pathway in HepG2 Cells.
包含细胞培养、药物处理、过表达/敲低、Western blot、qPCR、TUNEL等实验,但缺乏动物模型、临床样本或组学等多层级验证。
HepG2细胞
TM浓度:5 μg/mL TM处理时间:24小时 质粒转染剂量:pcDNA3.1-Sestrin2 5 μg,ViaFect试剂2 μL,转染后12小时再加TM处理24小时 Sestrin2敲低:shSestrin2-1显著抑制mRNA和蛋白水平 统计方法:未配对t检验及单因素方差分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TM诱导HepG2细胞内质网应激的合适浓度,并观察Sestrin2表达变化。
不同浓度TM(0、0.5、1、2、5、10 μg/mL)处理HepG2细胞24小时,检测细胞活力、Sestrin2和内质网应激标志物表达。
验证Sestrin2过表达是否能减轻TM诱导的内质网应激和细胞凋亡。
用pcDNA3.1-Sestrin2过表达Sestrin2,然后TM处理,检测ER应激和凋亡相关蛋白及TUNEL染色。
验证Sestrin2敲低是否能加重TM诱导的细胞凋亡。
转染shSestrin2敲低Sestrin2,TM处理,检测凋亡相关蛋白和TUNEL染色。
进一步验证Sestrin2表达与凋亡标志物的负相关关系。
在48个HepG2细胞样本中,通过Western blot量化Sestrin2和凋亡蛋白水平,并用Spearman相关分析。
探究Sestrin2过表达是否通过调控mTOR通路起作用。
过表达Sestrin2后,检测mTOR通路相关蛋白(mTOR、P70S6K、4E-BP1)及其磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 药物处理 | 衣霉素 | Sangon Biotech | A611129-0005 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | TargetMol | -- |
| 转染 | ViaFect转染试剂 | Vigorous Biotechnology | -- |
| 蛋白质提取和定量 | RIPA裂解液 | Fd Bioscience | -- |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物 | Fd Bioscience | -- | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| SDS-PAGE凝胶 | -- | -- | |
| 脱脂牛奶 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA检测 | NanoDrop One紫外分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| cDNA合成 | 逆转录试剂盒 | Applied Biological Materials | -- |
| qPCR | SYBR Green预混液 | Roche Life Science | -- |
| LightCycler 480实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| TUNEL检测 | TUNEL FITC凋亡检测试剂盒 | Vazyme Biotech | -- |
| 多聚赖氨酸包被的玻璃盖玻片 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Invitrogen | -- |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜(DMI 8) | Leica | -- |
| 细胞活力检测 | Synergy TM H1多功能酶标仪 | Bio-tek Instruments Inc. | -- |
| 抗体 | GRP78抗体 | Signalway Antibody | 48119 |
| CHOP抗体 | Signalway Antibody | SAB 40744 | |
| XBP1抗体 | Proteintech | 24868-1-AP | |
| BCL2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP | |
| BAX抗体 | Proteintech | 50599-2-IG | |
| Caspase3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| Caspase12抗体 | Proteintech | 24868-1-AP | |
| 细胞色素C抗体 | Proteintech | 66264-1-IG | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-IG | |
| 裂解的Caspase3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661S | |
| Caspase3抗体 | Cell Signaling Technology | 14220S | |
| mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983S | |
| 磷酸化mTOR (Ser2448)抗体 | Cell Signaling Technology | 5536S | |
| 4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9644 | |
| 磷酸化4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 2855 | |
| P70S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9202 | |
| 磷酸化P70S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9205 | |
| ATF6抗体 | Wanleibio | WL02407 | |
| 二抗 | HRP标记的山羊抗兔IgG | TransGEN Biotech | HS101-01 |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | TransGEN Biotech | HS201-01 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HepG2细胞系,DMEM培养基含10%FBS和1%青霉素/链霉素。 阅读提示:Materials and Methods, 2.2. Cell Culture |
| ER应激诱导 | TM浓度梯度0-10 μg/mL,筛选后使用5 μg/mL处理24小时。 阅读提示:Materials and Methods, 2.2. Cell Culture; Figure 1 |
| 基因过表达/敲低 | pcDNA3.1-Sestrin2或shSestrin2质粒,ViaFect转染试剂,剂量和时间。 阅读提示:Materials and Methods, 2.4. Transient Transfection |
| 蛋白质检测 | Western blot检测ER应激和凋亡相关蛋白,使用β-Actin作为内参。 阅读提示:Materials and Methods, 2.5. Western Blot |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL染色检测凋亡,使用TUNEL FITC凋亡检测试剂盒。 阅读提示:Materials and Methods, 2.7. TUNEL Staining |