患者肌肉样本采集与分组
评估不同疾病类型患者与对照组之间cGAS-STING通路表达的差异。
收集26例IIM患者(14例DM、8例IMNM、4例NSIIM)、4例肌营养不良症患者和9例对照的肌肉活检标本,根据临床和病理特征分组。
Activation of cGAS-STING pathway - A possible cause of myofiber atrophy/necrosis in dermatomyositis and immune-mediated necrotizing myopathy.
研究包含患者肌肉样本的蛋白质与mRNA表达检测、免疫组化定位分析,但缺乏体外和体内功能验证实验。
皮肌炎患者肌肉活检样本 免疫介导坏死性肌病患者肌肉活检样本 非特异性IIM患者肌肉活检样本 肌营养不良症患者肌肉活检样本
患者分组:14例DM、8例IMNM、4例NSIIM、4例肌营养不良症、9例对照 检测方法:Western blot、qRT-PCR、免疫组化 关键抗体:anti-cGAS、anti-STING、anti-MX1、anti-CD68等 统计分析:Mann-Whitney U检验,p<0.05为显著性差异
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估不同疾病类型患者与对照组之间cGAS-STING通路表达的差异。
收集26例IIM患者(14例DM、8例IMNM、4例NSIIM)、4例肌营养不良症患者和9例对照的肌肉活检标本,根据临床和病理特征分组。
验证IIM患者肌肉中cGAS-STING通路是否被激活。
通过Western blot检测cGAS、STING、P-STING、TBK1、P-TBK1、P-IRF3、P-NFkB蛋白表达,通过qRT-PCR检测cGAS、STING、TNF-α mRNA表达,通过免疫组化检测蛋白定位。
探索cGAS-STING通路激活是否与肌纤维萎缩/坏死相关。
通过免疫组化观察cGAS和STING在萎缩纤维、坏死纤维、炎性浸润和血管结构中的定位,并用MX1和CD68染色辅助判断纤维类型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | ES science Ltd | ES6002 |
| 抗cGAS抗体 | Abcam | ab224144 | |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| 抗磷酸化STING抗体 | Cell Signaling Technology | 50907 | |
| 抗磷酸化IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 29047 | |
| 抗TBK1抗体 | Proteintech | 28397-1-AP | |
| 抗磷酸化TBK1抗体 | Signalway Antibody | 13488 | |
| 抗磷酸化NFkB抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| qRT-PCR | 组织RNA纯化试剂盒 | ES science Ltd | ES-RN002plus |
| 逆转录试剂盒 | ES science Ltd | ES-RT001 | |
| SYBR Green 预混液 | Thermo Fisher | A25742 | |
| 7500 FAST实时荧光定量PCR系统 | Roche | -- | |
| 免疫组化 | 抗cGAS抗体 | Proteintech | 26416 |
| 抗STING抗体 | Proteintech | 19851-1-AP | |
| 抗MX1抗体 | Abcam | ab95926 | |
| 抗CD68抗体 | ZSGB-Bio | ZM-0060 | |
| PV-9000聚合物检测系统 | ZsBio Ltd | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本 | 患者分组: 26例IIM(14例DM,8例IMNM,4例NSIIM),4例肌营养不良症(FSHD=1, LAMA2=1, LGMD2H=1, BMD=1),9例非疾病对照。所有患者均未使用免疫抑制药物,且在活检前无病毒感染史。 阅读提示:Methods: Patients |
| Western blot | 蛋白上样量10μg,SDS-PAGE浓度7.5%-12.5%,所用抗体包括cGAS、STING、p-STING、p-IRF3、TBK1、p-TBK1、p-NFkB和GAPDH。 阅读提示:Methods: Western blot |
| qRT-PCR | RNA提取试剂盒、逆转录试剂盒、SYBR Green预混液、7500 FAST系统;使用2^-ΔΔCT方法计算相对表达量。 阅读提示:Methods: Quantitativereal-time PCR analysis |
| 免疫组化 | 切片厚度8μm,丙酮固定,PV-9000检测系统,一抗包括cGAS、STING、MX1、CD68;DAB显色,苏木素复染。 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry |