临床样本GNAQ表达检测
评估GNAQ在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系
对280例胃癌患者手术标本进行免疫组织化学染色,比较癌组织和癌旁正常组织中GNAQ表达,并分析其与年龄、分化、辅助治疗及生存期的关联
G protein subunit α q regulates gastric cancer growth via the p53/p21 and MEK/ERK pathways.
包含临床样本IHC分析、慢病毒敲低功能实验(增殖、集落形成、细胞周期、凋亡)及机制蛋白验证(p53/p21、MEK/ERK),涉及多个独立证据层级。
胃癌细胞系MGC80-3 胃癌细胞系SGC7901 胃癌患者手术标本(280例) HEK293T细胞(慢病毒包装)
GNAQ shRNA序列及慢病毒感染MOI=40 细胞增殖MTT实验的细胞接种密度2×10^3细胞/孔及检测时间点 细胞周期分析中PI染色及RNase处理条件 Western blotting中使用的抗体稀释度(1:1000)及内参GAPDH(1:100000)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GNAQ在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系
对280例胃癌患者手术标本进行免疫组织化学染色,比较癌组织和癌旁正常组织中GNAQ表达,并分析其与年龄、分化、辅助治疗及生存期的关联
比较不同胃癌细胞系中GNAQ蛋白表达水平,选择敲低实验的细胞系
通过Western blotting检测MGC80-3、SGC7901和AGS细胞中GNAQ表达水平,确定表达高低顺序
建立GNAQ稳定敲低的胃癌细胞系,以研究其功能
设计并构建靶向GNAQ的shRNA慢病毒载体,感染MGC80-3和SGC7901细胞,通过qRT-PCR和Western blotting验证敲低效率
检测GNAQ敲低对胃癌细胞增殖和集落形成能力的影响
MTT实验检测细胞生长曲线,集落形成实验检测克隆形成能力
观察GNAQ敲低对细胞周期分布和凋亡的影响
流式细胞术分析PI染色细胞的周期分布,sub-G1百分比反映凋亡
探讨GNAQ敲低影响细胞周期和凋亡的分子机制
Western blotting检测p53、p21、cyclin A、p-CDK2、CDK2以及MEK/ERK信号通路蛋白的表达和磷酸化水平
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | Histostain-Bulk-SP试剂盒 | Zymed | -- |
| GNAQ抗体 | Proteintech | -- | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | HyClone | -- |
| Ham's F12培养基 | Gibco-BRL | -- | |
| DMEM培养基 | HyClone | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 慢病毒包装 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| qRT-PCR | M-MLV逆转录酶 | Promega | -- |
| SYBR Premix Ex Taq试剂 | TaKaRa | -- | |
| ABI 7300实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blotting | BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | PF205629 |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| GNAQ抗体 | Proteintech | 13927-1-AP | |
| p53抗体 | Proteintech | 10442-1-AP | |
| p21抗体 | Cell Signaling Technology | 2947 | |
| cyclin A抗体 | Proteintech | 18202-1-AP | |
| p-CDK2抗体 | Cell Signaling Technology | 2561 | |
| CDK2抗体 | Cell Signaling Technology | 2546 | |
| p-ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| ERK抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-154 | |
| p-MEK抗体 | Signalway Antibody | 11205 | |
| MEK抗体 | Signalway Antibody | 21428 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-2054 | |
| Tanon-4200化学发光分析系统 | Tianneng | -- | |
| 细胞周期分析 | FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 统计 | SPSS 17.0软件 | SPSS, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本IHC | GNAQ抗体稀释度(1:50);染色评分标准(强度×分布面积);样本量280例;癌旁正常组织距肿瘤>5 cm 阅读提示:Materials and methods: Tissue sample immunohistochemistry |
| 细胞培养 | 细胞系培养基(RPMI-1640、Ham's F12、DMEM)及血清浓度(10%或5%);培养条件(5% CO2, 37°C) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 慢病毒感染 | MOI=40;感染时间120小时;shRNA序列(S1和S2) 阅读提示:Materials and methods: Lentivirus construction and transfection |
| 细胞增殖和集落形成 | MTT实验接种密度2×10^3细胞/孔;集落形成接种500细胞/孔;培养时间9天 阅读提示:Materials and methods: Cell growth assay, Cell colony formation assay |
| 细胞周期和凋亡 | PI染色浓度10 μg/ml;RNase浓度200 U/ml处理15分钟;乙醇固定浓度75% 阅读提示:Materials and methods: Cell cycle analysis |
| Western blotting | 抗体稀释度(1:1000,GAPDH 1:100000);裂解液成分(Tris-HCl pH6.8, EDTA, SDS, glycine) 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |