黄芩苷诱导结肠癌细胞衰老的表型验证
验证黄芩苷是否诱导结肠癌细胞衰老以及是否伴随凋亡。
用不同浓度黄芩苷处理HCT116和SW480细胞48小时,进行SA-β-Gal染色、细胞周期分析、EdU染色、集落形成实验和Annexin V/PI染色。
Baicalin induces cellular senescence in human colon cancer cells via upregulation of DEPP and the activation of Ras/Raf/MEK/ERK signaling.
包含体外细胞实验、缺氧模型、异种移植小鼠模型、转录组分析、功能获得/缺失验证及机制抑制剂实验。
HCT116人结肠癌细胞系 SW480人结肠癌细胞系 A549人肺癌细胞系 Panc-1人胰腺癌细胞系 HCT116异种移植裸鼠模型
结肠癌细胞系HCT116和SW480在体外实验中的使用 黄芩苷处理浓度:10, 20, 40 μM 体内实验中黄芩苷给药剂量:80 mg/kg,腹腔注射 细胞周期分析中S期细胞比例的变化 DEPP敲低后SA-β-Gal阳性细胞百分比的降低(从28.3%降至13.4%和11.2%)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证黄芩苷是否诱导结肠癌细胞衰老以及是否伴随凋亡。
用不同浓度黄芩苷处理HCT116和SW480细胞48小时,进行SA-β-Gal染色、细胞周期分析、EdU染色、集落形成实验和Annexin V/PI染色。
检测黄芩苷是否通过降低ROS和增强SOD活性发挥抗氧化作用。
用黄芩苷处理HCT116和SW480细胞,检测ROS水平(DCFH-DA染色)、SOD活性以及DNA损伤标志物γH2AX和p-ATM的表达。
筛选黄芩苷处理后调控的基因,尤其是缺氧反应基因,并验证DEPP的上调。
对黄芩苷处理的HCT116细胞进行全基因组微阵列分析,筛选差异表达基因,并用qRT-PCR验证DEPP的mRNA水平,同时检测缺氧条件下DEPP及Ras/Raf/MEK/ERK通路蛋白的表达。
在体内验证黄芩苷抑制肿瘤生长是否通过诱导衰老及DEPP上调。
将HCT116细胞皮下注射到裸鼠,建立异种移植模型,腹腔注射黄芩苷14天,检测肿瘤体积、体重、Ki67、SA-β-Gal、p16INK4A、cleaved-caspase 3表达及信号通路蛋白。
验证DEPP在黄芩苷诱导衰老中的功能必要性。
用siRNA敲低HCT116细胞中DEPP的表达,然后进行黄芩苷处理,检测SA-β-Gal阳性细胞比例、细胞周期分布、集落形成能力。
验证DEPP是否通过激活Ras/Raf/MEK/ERK和p16INK4A/Rb通路诱导衰老。
敲低或过表达DEPP,并联合使用MEK抑制剂U0126和Raf抑制剂sorafenib或siRNA靶向Raf1和ERK,检测信号通路蛋白和衰老表型。
验证其他抗氧化药物(如姜黄素和萝卜硫素)是否也能通过DEPP诱导衰老。
用姜黄素和萝卜硫素处理HCT116细胞,检测SA-β-Gal活性、集落形成、EdU染色以及DEPP和相关信号蛋白的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | EdU染色试剂盒 | Ribobio | C10310-3 |
| 流式分析 | 细胞周期检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| 流式分析 | 抗磷酸化ATM-PE抗体 | Merck Millipore | -- |
| BD FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RNA纯化 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| 微阵列分析 | Quick Amp标记试剂盒(单色) | Agilent Technologies | -- |
| Agilent 4x44K全人基因组基因表达芯片 | Agilent Technologies | -- | |
| Nanodrop ND-1000分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| Agilent微阵列扫描仪G2565BA | Agilent Technologies | -- | |
| qRT-PCR | QuantiFast探针RT-PCR试剂盒 | Qiagen | 204443 |
| Western blotting | 聚偏二氟乙烯膜 | Merck Millipore | IPVH00010 |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Merck Millipore | -- | |
| SA-β-Gal染色 | SA-β-Gal染色试剂盒 | Beyotime | C0602 |
| 转染 | Micropoly转染试剂 | Micropoly | -- |
| 药物处理 | 黄芩苷 | Jiangsu Institute for Food and Drug Control | -- |
| 集落染色 | 结晶紫 | Nanjing Chemical Reagent Co., LTD | -- |
| Western blotting | 抗pRb抗体 | Cell Signaling Technology | 8516 |
| 抗Rb抗体 | Cell Signaling Technology | 9313 | |
| 抗p21抗体 | Cell Signaling Technology | 2947 | |
| 抗p27抗体 | Cell Signaling Technology | 3686 | |
| 抗Ras抗体 | Cell Signaling Technology | 3339 | |
| 抗Raf1抗体 | Cell Signaling Technology | 53745 | |
| 抗p-ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 抗DEPP抗体 | Proteintech | 25833-1-AP | |
| 抗p16INK4A抗体 | SAB Signalway Antibody | 41296 | |
| 抗裂解caspase 3抗体 | SAB Signalway Antibody | 40500 | |
| 抗caspase 3抗体 | SAB Signalway Antibody | 42437 | |
| 抗β-actin抗体 | SAB Signalway Antibody | 4970 | |
| 抗p-Raf1抗体 | SAB Signalway Antibody | 11006 | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗 | SAB Signalway Antibody | 3012 | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | SAB Signalway Antibody | 3032 | |
| 免疫组化 | 抗Ki67抗体 | Merck Millipore | AB9260 |
| SP免疫组化二抗试剂盒(兔) | MaiBio | -- | |
| 流式分析 | 抗γH2AX (S139)-PE抗体 | eBioscience | -- |
| 药物处理 | U0126 | -- | -- |
| 索拉非尼 | -- | -- | |
| 姜黄素 | -- | -- | |
| 萝卜硫素 | -- | -- | |
| 转染 | pcDNA3.1载体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系、培养基(RPMI 1640)、胎牛血清浓度、抗生素浓度、培养条件(温度、CO2) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Lines and Culture |
| 药物处理 | 黄芩苷浓度(10, 20, 40 μM)和处理时间(24, 48小时) 阅读提示:Results: Baicalin-Induced Senescence in Colon Cancer Cells, Figure legends 1 |
| 动物实验 | 动物品系(BALB/c裸鼠)、周龄、细胞接种量、黄芩苷剂量(80 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、给药时间(接种后第5天起持续14天) 阅读提示:Materials and Methods: Animal Study, Figure legend 4 |
| 基因敲低 | siRNA序列、转染试剂、转染时间、敲低效率验证 阅读提示:Materials and Methods: RNA Interference, Figure legend 5 |
| 信号通路抑制 | U0126和Sorafenib浓度、处理时间、细胞系 阅读提示:Results: Ras/Raf/MEK/ERK Signaling Pathway was Involved in DEPP-Mediated Tumor Cellular Senescence, Figure legend 7 |
| SA-β-Gal染色 | 染色试剂盒(Beyotime)、pH、固定液和染色液、显微镜观察和计数方法 阅读提示:Materials and Methods: Assessment of Senescence-Associated β-Galactosidase Activity |
| 细胞周期分析 | 固定方法(70%乙醇)、染色试剂盒(Vazyme)、流式细胞仪 阅读提示:Materials and Methods: FACS Analysis |