验证ITK抑制增强CAR-T细胞细胞毒性
评估ITK敲低或药物抑制对CAR-T细胞杀伤肿瘤细胞能力的影响。
使用shRNA敲低ITK或soquelitinib处理CAR-T细胞,与B淋巴瘤细胞(DoHH2、HBL-1)共培养,通过LDH释放实验检测细胞毒性,并分选CD4+和CD8+亚群检测杀伤能力。
ITK-targeted immune remodeling enhanced the efficacy of anti-CD19 CAR-T cell therapy.
包含体外细胞功能实验(细胞毒性、凋亡、分化)、体外耗竭模型、转录组测序、Western blot及体内小鼠模型等多个独立证据层级,且包含功能验证和机制验证。
CD19 CAR-T细胞 B细胞淋巴瘤细胞系(HBL-1、DoHH2、NALM6) NALM6-luc荷瘤NCG小鼠模型
ITK抑制方式:shRNA敲低或soquelitinib(0-40nM)处理 CAR-T细胞激活条件:CD3/CD28 Dynabeads和IL-2(500 IU/mL) 体外细胞毒性实验:共培养6小时,E:T比值为1:1或4:1 体内模型:NALM6-luc细胞(5×10^6)尾静脉注射,CAR-T细胞(1×10^6)静脉输注,soquelitinib(30mg/kg)口服 对照设置:vehicle对照和单独CAR-T或单独soquelitinib组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ITK敲低或药物抑制对CAR-T细胞杀伤肿瘤细胞能力的影响。
使用shRNA敲低ITK或soquelitinib处理CAR-T细胞,与B淋巴瘤细胞(DoHH2、HBL-1)共培养,通过LDH释放实验检测细胞毒性,并分选CD4+和CD8+亚群检测杀伤能力。
探究soquelitinib处理对CAR-T细胞扩增、凋亡及细胞因子分泌的影响。
在CD3/CD28激活和IL-2存在下,用soquelitinib处理CAR-T细胞,检测细胞扩增、凋亡(Annexin V/PI)及PMA/ionomycin或肿瘤抗原刺激后的TNF-α和IFN-γ产生。
研究soquelitinib对CAR-T细胞亚群分布和CD62L表达的影响。
通过流式细胞术检测CD45RA、CD197(CCR7)和CD62L表达,分析CAR-T细胞亚群(初始、中央记忆、效应记忆、终末分化)的比例变化。
验证soquelitinib能否通过调控转录因子缓解CAR-T细胞耗竭。
通过流式细胞术检测耗竭标志物(PD-1、TIM3、LAG3、TIGIT、CD39等)表达,Western blot检测PLCγ1磷酸化及转录因子(TCF1、NR4A、NFAT1、TOX、BATF)表达,并进行重复抗原刺激实验建立耗竭模型。
在B细胞恶性肿瘤小鼠模型中,验证soquelitinib联合CAR-T治疗的疗效。
NCG小鼠尾静脉接种NALM6-luc细胞,7天后输注CD19 CAR-T细胞,并每日口服soquelitinib或对照,通过生物发光成像监测肿瘤负荷并记录生存期。
揭示soquelitinib处理对CAR-T细胞转录网络的全局影响。
对soquelitinib或对照处理的CAR-T细胞进行bulk RNA-seq,分析差异表达基因,进行KEGG富集、GSVA和GSEA分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| CAR-T细胞制备 | CD3/CD28磁珠 | Thermo Fisher | 11132D |
| X-VIVO培养基 | Lonza | 04-418Q | |
| 白细胞介素2 | SL Pharm | -- | |
| Countess 3 FL自动细胞计数器 | Thermo Fisher | -- | |
| 药物处理 | soquelitinib(CPI-818) | Corvus Pharmaceuticals Inc | -- |
| 流式分析 | BV510抗人CD3抗体 | Biolegend | 300448 |
| PerCP/Cyanine5.5抗人CD4抗体 | Biolegend | 300530 | |
| PerCP抗人CD4抗体 | Biolegend | 300528 | |
| APC/Cyanine7抗人CD8抗体 | Biolegend | 344713 | |
| PE/Cyanine7抗人CD8抗体 | Biolegend | 344750 | |
| FITC抗人CD45RA抗体 | Biolegend | 304105 | |
| PE/Cyanine7抗人CD197(CCR7)抗体 | Biolegend | 353225 | |
| BV421抗人CD25抗体 | Biolegend | 356114 | |
| PE抗人CD69抗体 | Biolegend | 310906 | |
| PE抗人CD244(2B4)抗体 | Biolegend | 329507 | |
| FITC抗人CD366(TIM3)抗体 | Biolegend | 345022 | |
| FITC抗人CD223(LAG3)抗体 | Biolegend | 369308 | |
| PE抗人TIGIT抗体 | Biolegend | 372704 | |
| APC抗人CD279(PD-1)抗体 | Biolegend | 379208 | |
| PE抗人TNF-α抗体 | Biolegend | 502909 | |
| APC抗人IFN-γ抗体 | Biolegend | 502512 | |
| PE抗人CD107a抗体 | Biolegend | 328608 | |
| PE抗人NFATc1抗体 | Biolegend | 649605 | |
| PE抗人BATF抗体 | Biolegend | 654803 | |
| PE抗人IRF4抗体 | Biolegend | 646403 | |
| FITC抗人CD38抗体 | Biolegend | 303504 | |
| FITC抗人CD39抗体 | Biolegend | 328205 | |
| CAR-T检测 | 兔抗小鼠FMC63 scFv单克隆抗体(Alexa Fluor 647) | BioSwan Laboratories | 200102 |
| Western blot | 磷酸化PLCγ1(Ser1248)抗体 | Cell Signaling Technology | 8713 |
| PLCγ1抗体 | Cell Signaling Technology | 5690 | |
| TCF1抗体 | Cell Signaling Technology | 2203 | |
| NR4A抗体 | Cell Signaling Technology | 3960 | |
| NFAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 5861 | |
| TOX抗体 | Cell Signaling Technology | 36778 | |
| BATF抗体 | Cell Signaling Technology | 8638 | |
| TNF-α抗体 | Cell Signaling Technology | 3707 | |
| LAG3抗体 | Cell Signaling Technology | 15372 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| IFN-γ抗体 | Proteintech Group | 15365-1-AP | |
| 抗小鼠IgG(H+L链)HRP标记二抗 | MBL | 330 | |
| 抗兔IgG(H+L链)HRP标记二抗 | MBL | 458 | |
| 细胞裂解液 | Invent | INKLWB1000S | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 04693124001 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | 04906837001 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23227 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| ECL select Western blot检测试剂 | Millipore | WBKLS0500 | |
| 化学发光检测系统(VILBER FUSION SL4) | VILBER BIO IMAGING | -- | |
| 药物处理 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | FastStart Universal实时PCR预混液 | TaKaRa | -- |
| Applied Biosystems 7500-Fast实时PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式分析 | Beckman Coulter CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 细胞毒性实验 | CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G1780 |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | Sino Biological | KIT10602 |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Dakewe | 1110002 | |
| RNA-seq | FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒 | Vazyme Biotech | RC112-01 |
| 动物实验 | NCG小鼠 | Beijing GemPharmatech | -- |
| NALM6-luc细胞 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAR-T细胞制备 | PBMC来源、CD3+ T细胞分离方法、激活磁珠与细胞比例、IL-2浓度和转导时间 阅读提示:Materials and methods: CAR-T cells preparation |
| 体外细胞毒性实验 | soquelitinib浓度、处理时间、靶细胞类型(DoHH2、HBL-1、NALM6)、E:T比、共培养时间 阅读提示:Results: Blocking ITK potentiates CAR-T cytotoxicity; Figure 1 |
| 体外耗竭模型 | 重复抗原刺激的次数、时间、靶细胞(HBL-1)的比例、soquelitinib浓度 阅读提示:Results: ITK inhibition reprograms transcriptional networks; Figure 4 |
| 体内疗效评估 | 小鼠品系、性别、年龄、肿瘤细胞接种量、CAR-T细胞输注剂量、soquelitinib给药方案(剂量、途径、频率)、肿瘤负担监测时间点 阅读提示:Results: Soquelitinib augments CD19 CAR-T cell-mediated eradication; Materials and methods: Mouse Models |
| 转录组分析 | RNA提取方法、RNA-seq平台、数据分析阈值(如|log2FC|>1.2,P<0.05)、基因集来源 阅读提示:Materials and methods: Bulk RNA sequencing and data analyses; Figure 6 |