建立母体肥胖模型
模拟母体肥胖,研究其对后代肾脏的影响
雌性C57BL/6J和ICR小鼠分别喂食对照饮食或高脂饮食12周,然后与雄性交配产生后代(mCD-F1和mHFD-F1),后代均喂食对照饮食。
Maternal obesity induces macrophage to myofibroblast transition in kidneys of male offspring through a pathway driven by 20-hydroxyeicosatetraenoic acid.
包含体外细胞共培养、BMDM、体内小鼠模型(FA和IRI)、多组学分析(snRNA-seq、snATAC-seq、代谢组学、脂质组学)及功能验证(抑制剂、基因敲低/敲除)。
母体肥胖小鼠模型(C57BL/6J和ICR) 骨髓源性巨噬细胞(BMDM) THP-1巨噬细胞 HK2近端小管细胞系
母体饮食:对照饮食或高脂饮食(60% kcal来自脂肪),喂养12周 子代处理:8周龄时腹腔注射叶酸(250 mg/kg)诱导急性肾损伤 20-HETE给药:50 μg/kg腹腔注射 HET0016给药:10 mg/kg腹腔注射 Ffar1抑制:DC260126(10 mg/kg)或Ffar1+/-基因型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟母体肥胖,研究其对后代肾脏的影响
雌性C57BL/6J和ICR小鼠分别喂食对照饮食或高脂饮食12周,然后与雄性交配产生后代(mCD-F1和mHFD-F1),后代均喂食对照饮食。
评估母体肥胖对后代肾脏损伤易感性的影响
8周龄雄性后代接受叶酸(FA)注射或IRI手术诱导急性肾损伤,观察肾脏功能和纤维化。
鉴定母体肥胖后代肾脏中关键细胞类型和分子变化
对肾脏进行单核RNA测序(snRNA-seq)、单核ATAC测序(snATAC-seq)、代谢组学和氧化脂质组学分析,鉴定差异表达基因、代谢物和染色质可及性变化。
验证PT细胞来源的20-HETE对巨噬细胞MMT的作用
使用过表达CYP4A11的HK2细胞条件培养基处理M2极化的THP-1巨噬细胞,检测纤维化标志物和线粒体功能。
验证20-HETE-Ffar1通路在体内对肾纤维化的必要性
用HET0016(CYP4A抑制剂)、DC260126(Ffar1抑制剂)或Ffar1+/-基因敲除小鼠处理FA诱导的损伤模型,评估肾脏病理和纤维化。
阐明T3调控Ffar1表达的分子机制
通过CUT&Tag、ATAC-seq、Capture Hi-C、CRISPR/Cas9基因编辑等技术分析T3对FFAR1增强子区域的调控,并验证TRβ-P300-BRD4轴。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | #A5256701 |
| RPMI 1640培养基 | Sangon Biotech | #E600028 | |
| MEM培养基 | Sangon Biotech | #E600102 | |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | #11330032 | |
| 胎牛血清 | Gibco | #A5256701 | |
| 青霉素-链霉素 | BasalMedia | #S110JV30-002-CI | |
| 细胞因子处理 | 重组巨噬细胞集落刺激因子 | BioLegend | #576404 |
| 白细胞介素-4 | Sino Biological | -- | |
| 白细胞介素-13 | Sino Biological | -- | |
| 转化生长因子-β | Sino Biological | #80116-RNAH | |
| 药物处理 | 20-羟基二十碳四烯酸 | -- | -- |
| HET0016 | -- | -- | |
| IM156 | -- | -- | |
| DC260126 | -- | -- | |
| 化合物1-850 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 佛波醇-12-肉豆蔻酸酯-13-乙酸酯 | MCE | #HY-18739 |
| 三碘甲状腺原氨酸 | -- | -- | |
| 瑞美替罗 | -- | -- | |
| JQ1 | -- | -- | |
| L002 | -- | -- | |
| 法西格利芬 | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 脂联素 | -- | -- | |
| 瘦素 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | #9190 |
| RT-qPCR | HiScript III逆转录预混液 | Vazyme | #R323 |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | #Q711 | |
| 免疫荧光 | 一抗:波形蛋白 | Proteintech | #10366-1-AP |
| 一抗:纤连蛋白 | Abcam | #ab2413 | |
| 一抗:III型胶原 | Proteintech | #22734-1-AP | |
| 一抗:ACTA2 | Sigma-Aldrich | #SAB5700835 | |
| 一抗:CD68 | Proteintech | #28058-1-AP | |
| 二抗:山羊抗小鼠IgG (H+L) Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher | #A-11001 | |
| 二抗:驴抗兔IgG (H+L) Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher | #A-21207 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 免疫组化 | VECTASTAIN ABC Elite试剂盒 | Vector Labs | #PK-4001 |
| ImmPACT DAB底物 | Vector Labs | #SK-4105 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | #11836153001 | |
| Micro BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 一抗:VCAM1 | Abcam | #ab134047 | |
| 一抗:SDHA | Proteintech | #14865-1-AP | |
| 一抗:GAPDH | Proteintech | #HRP-60004 | |
| 一抗:SDHB | Proteintech | #10620-1-AP | |
| 一抗:NDUFS3 | Proteintech | #15066-1-AP | |
| 一抗:β-肌动蛋白 | Proteintech | #HRP-60008 | |
| 一抗:FLAG | Proteintech | #66008-3-Ig | |
| 一抗:OXPHOS | Abcam | #ab110413 | |
| 一抗:CYP4A | Santa Cruz | #sc-271983 | |
| 一抗:GPR40 | Invitrogen | #PA5-75351 | |
| 二抗:DyLight 680偶联的山羊抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | #5470 | |
| 二抗:DyLight 800偶联的驴抗兔IgG | Cell Signaling Technology | #5151 | |
| 流式分析 | Live/Dead可固定活力染料780 | BD Biosciences | -- |
| PerCP-Cy5.5抗小鼠CD45 | BD | #550994 | |
| PE抗小鼠F4/80 | BD | #565410 | |
| PE-Cy7抗小鼠CD86 | BD | #560582 | |
| Alexa Fluor 647抗小鼠CD206 | BD | #565250 | |
| BV421抗小鼠Ly6G | BD | #562737 | |
| PE抗小鼠CD3ε | BioLegend | #100307 | |
| PE-Cy7抗小鼠F4/80 | BioLegend | #123113 | |
| FITC抗小鼠CD86 | BioLegend | #105005 | |
| BD LSR Fortessa X-20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 线粒体功能检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | #S0026 |
| 线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime | #C2006 | |
| 钙离子检测 | 4-AM荧光探针 | Shanghai Ma-okang | #MX4504 |
| 20-HETE定量 | Agilent 1290 Infinity II高效液相色谱系统 | Agilent | -- |
| Agilent 6470三重四极杆质谱仪 | Agilent | -- | |
| Phenomenex Kinetex F5色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| Phenomenex C18保护柱 | Phenomenex | -- | |
| Abcam 20-HETE ELISA试剂盒 | Abcam | #ab175817 | |
| MLBio 20-HETE ELISA试剂盒 | MLBio | #ML057413 | |
| 血清肾功能标志物 | BX-3010全自动临床生化分析仪 | Mindray | -- |
| Beyotime小鼠胱抑素C ELISA试剂盒 | Beyotime | #PC215 | |
| 细胞因子检测 | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | HUABIO | #EM0010 |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | HUABIO | #EM0001 | |
| 小鼠IL-1RA ELISA试剂盒 | WELLBIO | #EM30297M | |
| 细胞分离 | 胶原酶I | Gibco | #17018-029 |
| 抗F4/80超纯磁珠 | Miltenyi Biotec | #130-110-443 | |
| MS分选柱 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 生物素化的莲藕凝集素 | -- | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher | #13778100 |
| CRISPR编辑 | FD17纳米颗粒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 母体肥胖模型 | 母体饮食类型(对照或高脂)、喂养时间(12周)、小鼠品系(C57BL/6J或ICR)、后代性别(雄性) 阅读提示:Methods: Animals |
| 急性肾损伤诱导 | FA剂量(250 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、后代年龄(8周)、检测时间点(7或14天);IRI缺血时间(22或30分钟) 阅读提示:Methods: Animals; Figure legends 1 and 2 |
| 药物处理 | 20-HETE(50 μg/kg)、HET0016(10 mg/kg)、IM156(30 mg/kg)、DC260126(10 mg/kg)、clodronate liposomes(200 μL/72h)、1-850(5 mg/kg)的给药途径(腹腔注射)和持续时间 阅读提示:Methods: Animals; Figure legends 3,4,6,8 |
| 细胞培养和处理 | BMDM分化条件(M-CSF 20 ng/mL、7天)、M2极化(IL-4和IL-13各20 ng/mL,48小时)、TGF-β刺激(5 ng/mL,5天);THP-1分化(PMA 100 ng/mL,24小时)、M2极化(IL-4/IL-13,48小时)、TGF-β(25 ng/mL,5天);药物浓度(IM156 25μM、DC260126 5μM等) 阅读提示:Methods: Generation of BMDMs; Cell culture and treatment |
| 分子机制研究 | T3浓度(100 nM)、TRβ激动剂(Resmetirom)和拮抗剂(1-850)浓度、P300抑制剂L002和BRD4抑制剂JQ1的浓度、增强子删除实验所用的sgRNA序列 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment; Results section 'TRβ signaling enhances FFAR1 transcription'; Figure 7 |