体外验证SARS-CoV-2诱导衰老样表型
验证SARS-CoV-2感染是否在未感染细胞中诱导衰老样表型,并观察SASP因子的表达。
用SARS-CoV-2 MA10株(MOI=0.1)感染ACE2-HDFs,在感染后第1、6、9天进行免疫荧光和RT-qPCR,检测病毒感染、p16INK4a表达和SASP因子。
Senescence-like cells recruit γδ T cells to drive prolonged hyposmia after SARS-CoV-2 infection in mice.
包含体外细胞感染实验、小鼠感染模型、基因敲除小鼠(p16/p21 DKO、Omp-cre/Il17ra flox)、药理学干预(ABT263、中和抗体)及行为学测试(OAT和OHDT)等多个独立证据层级,并进行了机制验证(IL-17RA缺失、p38磷酸化检测)。
SARS-CoV-2感染小鼠模型(MA10株) p16/p21双敲除(DKO)小鼠 嗅觉神经元特异性IL-17RA敲除小鼠(Omp-cre/Il17raflox/flox) 人肺二倍体成纤维细胞(TIG-3/ACE2-HDFs)
小鼠品系和性别:C57BL/6背景,雌性,10-14周龄 病毒感染剂量:SARS-CoV-2 MA10株,1.0×10^6 PFU,鼻内接种 ABT263给药方案:100 mg/kg口服,感染后第0-3、5-7、9-13天 中和抗体给药:感染后第11和13天腹腔注射,抗CXCR3/IFNγ/TCRγδ剂量200 μg,抗IL-17A剂量250 μg 行为学测试时间:OHDT在第3、12、13、34天进行,OAT在第4和13天进行
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SARS-CoV-2感染是否在未感染细胞中诱导衰老样表型,并观察SASP因子的表达。
用SARS-CoV-2 MA10株(MOI=0.1)感染ACE2-HDFs,在感染后第1、6、9天进行免疫荧光和RT-qPCR,检测病毒感染、p16INK4a表达和SASP因子。
在小鼠模型中确认SARS-CoV-2感染后嗅黏膜出现衰老样细胞,并比较WT和DKO小鼠的差异。
WT和p16/p21 DKO小鼠鼻内感染MA10,在感染后第4天和第14天收集嗅黏膜,通过RT-qPCR和免疫组化检测病毒RNA、p16INK4a表达,并分析体重变化。
评估衰老样细胞是否通过SASP因子招募γδ T细胞,并检测相关基因表达。
在感染后第14天,通过RT-qPCR检测嗅黏膜Tcrgv1、Ifng、Cxcl9、Cxcl11、Cd3e和Il17a表达,并通过免疫荧光检测TCRγδ和CD3ε阳性细胞。
评估SARS-CoV-2感染后嗅觉功能障碍,并比较不同基因型和处理组的恢复情况。
使用OAT和OHDT分别检测小鼠对厌恶气味和中性气味的反应。在感染后第3、12、13、34天进行OHDT,第4、13天进行OAT。
验证药理学清除衰老细胞是否能减轻嗅觉功能障碍和γδ T细胞浸润。
感染小鼠给予ABT263(100 mg/kg,口服)或溶剂,在第13天进行OHDT,第14天收集嗅黏膜进行RT-qPCR和免疫荧光检测。
验证γδ T细胞及其相关信号在嗅觉功能障碍中的作用。
感染小鼠在第11和13天腹腔注射抗CXCR3、抗IFNγ、抗TCRγδ或抗IL-17A中和抗体,在第13天进行OHDT,第14天收集组织进行RT-qPCR。
验证IL-17A作用于嗅感觉神经元是否是嗅觉功能障碍所必需的。
使用Omp-cre/Il17raflox/flox小鼠和Il17raflox/flox对照感染MA10,在第3、13天进行OHDT,第14天收集嗅黏膜进行RT-qPCR和免疫荧光分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | MP Biomedicals | 2917354H | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | P4333 | |
| 潮霉素 | -- | -- | |
| 阿霉素 | -- | -- | |
| 免疫组织化学 | Bouin固定液 | Muto Pure Chemicals | 33142 |
| 柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| BLOXALL | Vector | SP-6000 | |
| DAPI | Dojindo | 340-07971 | |
| Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 | |
| TSA Cyanine 5系统 | AKOYA Biosciences | NEL705A001KT | |
| TSA TMR系统 | AKOYA Biosciences | NEL702001KT | |
| VECTOR M.O.M.免疫检测试剂盒 | Vector | BMK-2202 | |
| ImmPRESS聚合物抗兔IgG | Vector | MP-7401 | |
| ImmPRESS聚合物抗山羊IgG | Vector | MP-7405 | |
| Tissue-Tek冷冻包埋盒 | Sakura Finetek | 4557 | |
| O.C.T.包埋剂 | Sakura Finetek | 45833 | |
| 低温恒温器 | Leica Biosystems | -- | |
| BZ-X710荧光显微镜 | Keyence | -- | |
| BZ-X800荧光显微镜 | Keyence | -- | |
| Leica Mica共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| RNA提取和RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara Bio Inc. | PR047A | |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara Bio | RR820A | |
| Thermal Cycler Dice实时荧光定量PCR系统III | Takara Bio | -- | |
| QuantStudio 1实时荧光定量PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 行为学测试 | 测试笼 | TECNIPLAST | 1245ISO00DPBOX |
| 滤纸 | GE Healthcare | 3030-909 | |
| 2,4,5-三甲基噻唑 | Tokyo Chemical Industry | T1068 | |
| 丁香油酚 | Nacalai | 15806-42 | |
| 药物处理 | ABT263 | Selleck | S1001 |
| 聚乙二醇400 | Nacalai | 28215-95 | |
| Phosal 50 PG | -- | -- | |
| 抗体中和 | 抗小鼠CXCR3抗体 | Bio X Cell | BE0249 |
| 抗小鼠IFNγ抗体 | Bio X Cell | BE0312 | |
| 抗小鼠TCRγ/δ抗体 | Bio X Cell | BE0070 | |
| 抗小鼠IL-17A抗体 | Bio X Cell | BE0173 | |
| 亚美尼亚仓鼠IgG同型对照 | Bio X Cell | BE0091 | |
| 小鼠IgG1同型对照 | Bio X Cell | BE0083 | |
| 抗体(免疫荧光) | p16INK4a抗体 | Santa Cruz | sc-56330 |
| p16INK4a抗体 | Abcam | ab211542 | |
| SARS-CoV-2核衣壳蛋白抗体 | Sino Biological | 40143-R001 | |
| SARS-CoV-2刺突蛋白抗体 | GeneTex | GTX632604 | |
| CXCL9抗体 | R&D Systems | AF-492 | |
| Ki67抗体 | Thermo Fisher Scientific | 14-5698-82 | |
| TCRγδ抗体 | Santa Cruz | sc-19608 | |
| TCRγδ抗体 | LSBio | LS-B5684 | |
| 磷酸化p38 MAPK抗体 | Cell Signaling | 4511 | |
| OMP抗体 | Wako | 019-22291 | |
| 细胞角蛋白8抗体 | Abcam | ab53280 | |
| IL-17RA抗体 | Abcam | ab180904 | |
| CD3ε抗体 | Abcam | ab16669 | |
| IL-17A抗体 | Invitrogen | PA5-114455 | |
| 驴抗小鼠IgG Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher | A-21202 | |
| 驴抗兔IgG Alexa Fluor 555 | Thermo Fisher | A-31572 | |
| 驴抗山羊IgG Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher | A-11055 | |
| 山羊抗亚美尼亚仓鼠Alexa Fluor 568 | Abcam | ab175716 | |
| 驴抗兔IgG Alexa Fluor Plus 488 | Thermo Fisher | A-32790 | |
| 驴抗山羊IgG Alexa Fluor Plus 555 | Thermo Fisher | A-32816 | |
| 过氧化物酶标记的亲和纯化山羊抗亚美尼亚仓鼠IgG | ImmunoResearch Laboratories | 127-035-160 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物感染模型 | 小鼠品系(C57BL/6)、性别(雌性)、年龄(10-14周龄)、病毒株(MA10)、感染剂量(1.0×10^6 PFU)、接种途径(鼻内)、麻醉方式(异氟烷) 阅读提示:Methods: Animal experiments |
| 衰老细胞检测 | 组织固定(Bouin's溶液或4% PFA)、脱钙(10% EDTA)、切片厚度(5 μm)、抗原修复(柠檬酸缓冲液)、抗体(p16INK4a、CXCL9、Ki67) 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry, Figure 1, Figure EV2 |
| 行为学测试 | 测试笼规格、滤纸尺寸、气味剂(eugenol稀释比例、nTMT体积)、测试时间、每只小鼠仅测试一次 阅读提示:Methods: Olfactory avoidance test, Olfactory habituation-dishabituation test |
| 药物处理 | ABT263剂量(100 mg/kg)、给药途径(口服)、给药时间(第0-3、5-7、9-13天)、溶剂组成 阅读提示:Methods: Animal experiments, Figure 2A |
| 抗体中和实验 | 抗体种类、剂量(200 μg或250 μg)、给药途径(腹腔)、给药时间(第11和13天) 阅读提示:Methods: Animal experiments, Figure 4A |