自噬通过SQSTM1/p62介导的选择性自噬降解CDKN1A/p21和CDKN2A/p16来调节细胞衰老在黏液样二尖瓣变性中的作用

Autophagy regulates cellular senescence by mediating the degradation of CDKN1A/p21 and CDKN2A/p16 through SQSTM1/p62-mediated selective autophagy in myxomatous mitral valve degeneration.

作者信息Qiyu Tang, Keyi Tang, Greg R Markby, Maciej Parys, Kanchan Phadwal, Vicky E MacRae, Brendan M Corcoran
PMID39988732
期刊Autophagy
发布时间2025-07
DOI10.1080/15548627.2025.2469315

实验完整度

包含细胞模型(犬原代VICs、HEK293T)、分子生物学验证(基因过表达/敲低/敲除)、功能验证(衰老、SASP、增殖)和机制验证(co-IP、PLA、荧光共定位)等多层级证据。

主要模型

犬原代瓣膜间质细胞(qVICs和aVICs) HEK293T细胞

重点核对

犬源性MMVD(Whitney grade 2)和健康对照的瓣膜组织 雷帕霉素(200 nM)和torin-1(80 nM)处理条件 ATG7和ATG3过表达及敲除/敲低方法 SQSTM1敲低/敲除对CDKN1A和CDKN2A降解的影响 bafilomycin A1(baf-A1)和MG132处理以阻断自噬流和蛋白酶体

摘要

黏液样二尖瓣变性(MMVD)是人类和犬类中最重要的年龄依赖性退行性心脏瓣膜疾病之一。其特征是细胞外基质(ECM)的异常重塑,由衰老的肌成纤维细胞(aVICs)调节,这些细胞从静止的瓣膜间质细胞(qVICs)转变而来,主要受TGFB1/TGF-β1控制。在本研究中,我们发现衰老的aVICs表现出受损的巨自噬/自噬,表现为自噬通量受损和自噬体不成熟。雷帕霉素和托林-1诱导的MTOR依赖性自噬减弱了细胞衰老,并降低了细胞周期依赖性激酶抑制剂(CDKIs)CDKN2A/p16INK4A和CDKN1A/p21CIP1的表达。此外,通过ATG(自噬相关)基因过表达在aVICs中诱导自噬恢复了自噬通量,同时CDKN1A和CDKN2A表达以及衰老相关分泌表型(SASP)减少。相反,自噬缺陷诱导CDKN1A和CDKN2A积累以及SASP,而ATG重新表达减轻了衰老表型转化。值得注意的是,在MTOR拮抗或MG132处理后,CDKN1A和CDKN2A定位于自噬体和溶酶体。SQSTM1/p62被确定为选择性隔离CDKN1A和CDKN2A货物以进行自噬降解的自噬受体。我们的发现首次证明CDKN1A和CDKN2A通过SQSTM1介导的选择性自噬降解,独立于泛素-蛋白酶体途径。这些数据将为开发治疗犬和人类MMVD以及阿尔茨海默病、帕金森病和其他年龄相关退行性疾病的治疗策略提供信息。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
自噬如何调节MMVD中VICs的细胞衰老,特别是CDKN1A和CDKN2A是否通过选择性自噬降解?
核心机制
CDKN1A和CDKN2A通过SQSTM1/p62介导的选择性自噬降解,独立于泛素-蛋白酶体系统;MTOR抑制促进该自噬过程。
主要证据
通过免疫印迹、共聚焦显微镜、PLA和co-IP实验证明CDKN1A和CDKN2A与MAP1LC3和SQSTM1共定位及相互作用;ATG7/ATG3过表达降低CDKN1A/CDKN2A水平,而敲除/敲低则增加其积累。
研究意义
揭示自噬在VICs衰老调控中的保护作用,提示MTOR抑制剂可能成为治疗MMVD及其他年龄相关退行性疾病的潜在策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

检测衰老aVICs中的自噬通量

评估MMVD衍生的aVICs与正常qVICs在自噬诱导条件下自噬通量的差异。

对aVICs和qVICs进行氨基酸饥饿处理,并用baf-A1抑制自噬通量,通过免疫印迹检测MAP1LC3-II、ATG3、ATG5、ATG7、SQSTM1、CDKN1A和CDKN2A蛋白水平。

2

评估自噬体成熟度

比较aVICs和qVICs中自噬体与溶酶体融合及成熟情况。

通过共聚焦显微镜观察MAP1LC3和SQSTM1染色、LysoBrite染色,以及表达mCherry-eGFP-MAP1LC3B报告基因和STEM分析,评估自噬体和自溶酶体数量。

3

MTOR抑制剂对衰老的影响

探究MTOR抑制剂(雷帕霉素和torin-1)是否能逆转aVICs的衰老表型。

用不同浓度和时间段的雷帕霉素和torin-1处理aVICs,检测CDKN1A、CDKN2A表达、SA-GLB1活性、ROS水平、SASP因子表达及增殖能力。

4

ATG过表达对细胞衰老的影响

验证增强自噬是否能减轻aVICs的衰老表型。

在aVICs中过表达ATG7或ATG3,检测CDKN1A、CDKN2A、SQSTM1蛋白水平、自噬通量、衰老标志物、ROS、SASP和增殖能力。

5

ATG缺陷对细胞衰老的影响

评估自噬抑制是否诱导qVICs的衰老表型。

通过CRISPR-Cas9敲除ATG7或使用siRNA敲低ATG7/ATG3,检测CDKN1A、CDKN2A、SQSTM1水平、自噬通量、衰老标志物、ROS、SASP及增殖能力。

6

验证CDKN1A和CDKN2A的自噬降解

证明CDKN1A和CDKN2A定位于自噬体并被MAP1LC3识别。

通过免疫荧光共定位、PLA和co-IP实验检测CDKN1A/CDKN2A与MAP1LC3的相互作用。

7

鉴定SQSTM1介导的选择性自噬

确认SQSTM1作为CDKN1A和CDKN2A自噬降解的受体。

通过co-IP、PLA和共定位实验检测SQSTM1与CDKN1A/CDKN2A及MAP1LC3的相互作用,并在SQSTM1敲低/敲除细胞中验证其对CDKN1A/CDKN2A降解的影响。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
验证免疫效应
评估体内效果
数据分析与统计

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco11995065
胎牛血清GibcoA5256801
青霉素-链霉素Gibco15140122
HEK293T细胞系ATCCCRL-11268
雷帕霉素Cayman Chemical13346
托林-1Cayman Chemical10997
MG132Cayman Chemical10012628
巴弗洛霉素A1Cayman Chemical11038
转化生长因子β1Sino Biological10804-HNAC
pcDNA3.1+载体Addgene208051
pcDNA3.1-HA载体Addgene128034
eSpCas9-2A-Puro (PX459) V2.0质粒Genscript--
Neon转染系统InvitrogenNEON1S
Lipofectamine 3000转染试剂InvitrogenL3000001
Hoechst染料Sigma62249
LysoBrite深红探针AAT Bioquest22646
RIPA裂解缓冲液Thermo Scientific89900
BCA蛋白定量试剂盒Thermo ScientificA55860
硝酸纤维素膜Thermo Scientific88018
牛血清白蛋白Thermo ScientificJ10857-18
吐温-20Sigma AldrichP1379
免疫沉淀裂解缓冲液Thermo Scientific87787
蛋白A/G琼脂糖珠Abcamab206996
SA-β-半乳糖苷酶染色试剂盒Sigma AldrichKAA002
Duolink邻位连接试剂盒Sigma AldrichDUO92101
核质分离试剂盒Thermo Scientific78833
C5细胞因子抗体芯片RayBiotechAAH-CYT-5
GraphPad Prism 8软件GraphPad--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞分离与培养
犬种、年龄、MMVD等级(Whitney grade 2)、分离方法
阅读提示:Materials and methods: Clinical samples and ethics statement; Primary VIC isolation and culture
药物处理
雷帕霉素浓度(25-300 nM)和时间(6-72小时);torin-1浓度(80 nM)和时间(18-48小时);MG132浓度(10 µM)和时间(36-48小时);bafilomycin A1浓度(5-10 µM)和时间(4-6小时)
阅读提示:Results sections and Figure legends; Materials and methods: Antibodies and reagents
基因操作
转染方法(Neon电转)、质粒浓度(10 µg)、siRNA浓度(1 µM)、敲除验证(T7EI)
阅读提示:Materials and methods: Gene overexpression; RNA interference; CRISPR-Cas9 knockout
自噬通量检测
氨基酸饥饿处理条件、baf-A1处理时间、MAP1LC3-II转化检测
阅读提示:Results: Autophagy flux is impaired in senescent aVICs; Figure 1
衰老表型评估
SA-GLB1染色方法、ROS检测方法、SASP因子(TGFB1、IL6、MMP9)检测方法
阅读提示:Materials and methods: Cellular senescence assay; Cellular ROS assay; ELISA