设计双synNotch系统
构建能够同时识别凋亡信号PS和神经元信号Gt1b的双受体系统,以实现特异性的神经元凋亡检测。
设计抗PS synNotch受体(含Annexin A5结合域)和抗神经元synNotch受体(含破伤风毒素Gt1b结合域),并通过“与门”机制激活下游基因表达。
In Situ synNotch-Programmed Astrocytes Sense and Attenuate Neuronal Apoptosis.
包含体外细胞模型(COS7、HEK-293T、原代神经元和星形胶质细胞)实验、功能验证(MTT、ELISA)和机制验证(双受体激活、RNA-seq分析),并涉及体内验证(脑立体定位注射)。
COS7细胞 HEK-293T细胞 小鼠原代神经元 小鼠原代星形胶质细胞 HT22细胞
synNotch受体表达密度(转染0.2-1.6μg质粒)和配体PS浓度(0-50μg/孔)对激活的影响 HEK-293T细胞用0.4μg质粒(1:1比例)转染,原代星形胶质细胞用双慢病毒MOI=1转导 谷氨酸诱导神经元凋亡的浓度(5mM)和时间(2-48小时) BDNF-Flag检测使用夹心ELISA,检测抗体稀释度1:500,检测限31.7pg/mL 统计方法:正态分布数据用单因素或双因素方差分析及Tukey多重比较检验,非正态数据用非参数检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建能够同时识别凋亡信号PS和神经元信号Gt1b的双受体系统,以实现特异性的神经元凋亡检测。
设计抗PS synNotch受体(含Annexin A5结合域)和抗神经元synNotch受体(含破伤风毒素Gt1b结合域),并通过“与门”机制激活下游基因表达。
确定最佳synNotch受体表达量以平衡激活强度、背景噪声和灵敏度。
在COS7细胞中,以不同质粒量(0.2, 0.4, 0.8, 1.6 μg/孔)转染,不同PS浓度(0-50 μg/孔)包被培养板,通过mCherry表达评价激活效率。
建立BDNF-Flag和GLuc-IgG1 Fc蛋白的定量检测方法。
开发夹心ELISA检测BDNF-Flag(抗Flag捕获抗体,生物素化抗BDNF检测抗体);通过生物发光检测GLuc-IgG1 Fc,并验证其穿越BBB的能力。
验证双synNotch系统对包被的PS和Gt1b的响应性及特异性。
在HEK-293T细胞中共表达两个受体,用不同量的PS和Gt1b包被培养板刺激24小时,检测EGFP和分泌蛋白的表达。
验证该系统能否被凋亡的原代神经元激活。
将表达双受体的HEK-293T细胞与原代神经元共培养,用谷氨酸诱导神经元凋亡,检测报告基因表达和BDNF分泌。
验证在星形胶质细胞中通过慢病毒转导实现系统表达,并能响应神经元凋亡。
使用慢病毒(MOI=1)转导原代星形胶质细胞,与神经元共培养后加入谷氨酸诱导凋亡,检测报告分子表达和分泌蛋白。
评估星形胶质细胞中表达synNotch受体是否影响其正常生理功能。
对表达synNotch的星形胶质细胞进行RNA-seq,分析关键功能基因(如突触修饰、代谢、免疫反应)的表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | 11965092 |
| 胎牛血清 | HUANKE | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| Zlip2000转染试剂 | Zomanbio | ZC305 | |
| 胰酶消化液 | Beyotime | C0201 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Solarbio | D8071 | |
| Neurobasal培养基 | Gibco | 21103049 | |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | 35050061 | |
| DMEM-F12培养基 | Gibco | 11320033 | |
| 多聚赖氨酸 | -- | -- | |
| 药物处理 | 磷脂酰丝氨酸 | YuanyeBio | S27340 |
| 神经节苷脂Gt1b | Cayman | 15588 | |
| 谷氨酸 | -- | -- | |
| 蛋白质检测 | 抗Flag抗体 | Sigma | F1804 |
| 生物素标记的兔抗小鼠BDNF抗体 | Signalway antibody | EK5128 | |
| 链霉亲和素标记的辣根过氧化物酶 | Thermofisher | 21140 | |
| TMB底物溶液 | Solarbio | PR1210 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Meilunbio | MA0287 | |
| 硝酸纤维素膜 | PALL | P-N66485 | |
| 脱脂牛奶 | Solarbio | D8340 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗(抗小鼠) | Zsbio | ZB2301 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗(抗兔) | Zsbio | ZB2305 | |
| 细胞免疫荧光 | 驴血清 | Solarbio | SL050 |
| Triton-X100 | Sigma | T8787 | |
| Hoechst 33258 | -- | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 流式分析 | CytoFLEX LX流式细胞仪 | Beckman | -- |
| FlowJo软件 | -- | -- | |
| FACSAria II细胞分选仪 | BD | -- | |
| 在体动物实验 | 立体定位注射仪 | -- | -- |
| 微量注射器 | Hamilton | 10 | |
| 颅骨钻 | -- | -- | |
| 生物发光检测 | 腔肠素 | Beyotime | RG021M |
| SpectraMax iD5酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| IVIS光谱成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 蛋白质纯化 | 抗Flag磁珠 | MCE | HY-K0207 |
| Protein-G磁珠 | Beyotime | P2106 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026CN |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| RNA测序 | VAHTS Universal V6 RNA-seq文库制备试剂盒 | Vazyme | -- |
| 细胞培养 | BDNF-Flag蛋白 | -- | -- |
| Gluc-IgG1 Fc融合蛋白 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | COS7细胞(ATCC CRL-1651)、HEK-293T细胞(ATCC CRL-3216)、HT22细胞(ATCC LHY1277);培养基DMEM+10%FBS+1%青霉素/链霉素;培养条件5% CO2,37°C 阅读提示:Methods 4.1 Cell Lines |
| 质粒构建 | synNotch受体基因构建:Annexin A5 (NM_001154)和破伤风毒素片段 (X06214)与小鼠Notch1片段 (NM_008714)融合;使用Addgene质粒#79126和#15305;启动子为CMV或GfaABC1D;响应元件为5×UAS和7×TRE 阅读提示:Methods 4.2 Plasmid Construction |
| 慢病毒生产 | HEK-293T细胞转染PsPax2:PmD2.G:pHR'SIN:CSW比例为2:1:3;使用Zlip2000转染试剂;转染6小时后换液,48小时后收集病毒上清 阅读提示:Methods 4.3 Lentivirus Production and Purification |
| 原代细胞培养 | 原代神经元:E14-E15胎鼠脑组织分离海马和皮层,用0.25%胰酶消化,Neurobasal培养基+2% B27+1% GlutaMAX培养7-9天;原代星形胶质细胞:新生鼠脑组织,DMEM-F12+10% FBS培养10-12天 阅读提示:Methods 4.4 Culture of Primary Neurons and Astrocytes |
| 药物处理 | PS和Gt1b分别以5mg/mL甲醇溶液包被培养板;谷氨酸浓度5mM(体外实验)或10mM(MTT实验) 阅读提示:Methods 4.5 Plate Coated by PS and Gt1b; 4.11 Cytotoxicity Assay |
| 转染与转导 | 质粒转染:每2×10^5细胞用0.4μg质粒(1:1比例)和2μL Zlip2000;慢病毒转导:MOI=1,感染24小时后换液 阅读提示:Methods 4.6 Plasmid Transfection and Lentiviral Transduction In Vitro |
| 检测与数据分析 | ELISA检测BDNF-Flag使用抗Flag捕获抗体和生物素化抗BDNF检测抗体(1:500);统计方法:正态分布数据用单因素或双因素方差分析和Tukey检验,非正态用非参数检验 阅读提示:Methods 4.9 BDNF-Flag Measurement by ELISA; 4.16 Statistical Analysis |