临床队列分析:HAIC治疗后TLS形成与预后相关性
评估HAIC治疗后HCC肿瘤内TLS的形成情况及其与临床疗效和生存的关系。
分析接受HAIC治疗(单独或联合ICB)和未治疗HCC患者的肿瘤组织,通过H&E和多重免疫组化检测TLS,并分析其密度与治疗反应、PFS和OS的相关性。
Enhanced formation of tertiary lymphoid structures shapes the anti-tumor microenvironment in hepatocellular carcinoma after FOLFOX-HAIC therapy.
包含临床队列分析、多重免疫组化、单细胞RNA/TCR测序、体外细胞培养和原位小鼠肿瘤模型等多层级实验,并进行功能验证和机制验证。
HCC患者肿瘤组织样本(HAIC治疗队列、验证队列、HAIC联合ICB队列、未治疗对照队列) 健康供者外周血T细胞体外培养模型 小鼠原位肝癌模型(C57BL/6小鼠,Hepa1-6细胞)
HAIC治疗前肿瘤切除:治疗队列n=123,验证队列n=35,HAIC+ICB队列n=49;未治疗对照组n=90 TLS定量:H&E染色,密度计算为TLSs/cm²,肿瘤内TLS阳性率治疗组63.7%(72/123),对照组10%(9/90) CXCL12处理小鼠:5 μg重组小鼠CXCL12瘤内注射(第5天),OXA 5 mg/kg腹腔注射(第7、9天),第11天取材 体外T细胞培养:2×10^5 T细胞/孔,αCD3/28刺激,10% TIF处理,培养6天 scRNA-seq:4例HAIC响应患者肿瘤,共22,667个细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HAIC治疗后HCC肿瘤内TLS的形成情况及其与临床疗效和生存的关系。
分析接受HAIC治疗(单独或联合ICB)和未治疗HCC患者的肿瘤组织,通过H&E和多重免疫组化检测TLS,并分析其密度与治疗反应、PFS和OS的相关性。
明确HAIC诱导的TLS内细胞组成和CD8+ T细胞激活状态。
通过多重免疫组化分析TLS内CD8+ T细胞、CD20+ B细胞、DC-LAMP+ DC、PNAd+ HEV的密度,并检测CD69、PD1、GZMA表达及HLA分子和抗原呈递细胞。
鉴定HAIC治疗后肿瘤内可能参与TLS形成的细胞亚群及其特征。
对4例HAIC响应患者肿瘤进行scRNA-seq和scTCR-seq,分析细胞聚类、基因表达、轨迹分析和克隆多样性。
验证HAIC处理的肿瘤微环境是否能在体外诱导TCM样CD4+ T细胞。
用来自HAIC治疗或未治疗的HCC肿瘤组织的TIF刺激健康供者外周血T细胞,通过流式细胞术检测TCM样CD4+ T细胞(CD45RO+TCF1+CCR7+IL7R+)和LTβ表达。
验证TCM样CD4+ T细胞、FOLR2+巨噬细胞和FAP+成纤维细胞在TLS内的空间共定位和相互作用。
通过多重免疫组化检测TCF1+CD3+CD4+ T细胞、FOLR2+巨噬细胞、FAP+成纤维细胞在TLS内的分布和接近程度。
验证CXCL12和OXA联合治疗是否能促进体内TLS形成和抗肿瘤效果。
C57BL/6小鼠原位接种Hepa1-6细胞,分别用PBS、OXA、CXCL12或OXA+CXCL12处理,测量肿瘤体积并计数TLS样结构。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化/多重免疫组化 | 兔抗CD3单克隆抗体 | Abcam | ab16669 |
| 兔抗CD4单克隆抗体 | Abcam | ab133616 | |
| 兔抗CD8单克隆抗体 | ZSGB-BIO | ZA-0508 | |
| 兔抗ITGAM/CD11b单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 49420S | |
| 兔抗CD20单克隆抗体 | Abcam | ab78237 | |
| 兔抗CD21单克隆抗体 | Abcam | ab75985 | |
| 小鼠抗CD23单克隆抗体 | Abcam | ab254162 | |
| 兔抗CD45RO单克隆抗体 | ZSGB-BIO | ZM-0055 | |
| 小鼠抗CD68单克隆抗体 | ZSGB-BIO | ZM-0060 | |
| 兔抗CD69单克隆抗体 | Abcam | ab233396 | |
| 小鼠抗CD279/PD1抗体 | Sino Biological | 10377-MM03 | |
| 兔抗TCF1单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2203S | |
| 大鼠抗PNAd单克隆抗体 | Biolegend | 120802 | |
| 小鼠抗FOLR2单克隆抗体 | Asbio | TA808026-100 | |
| 兔抗FAP单克隆抗体 | Abcam | ab207178 | |
| 小鼠抗ICAM1单克隆抗体 | Origene | TA506870S | |
| 兔抗LTB多克隆抗体 | Sigma-Aldrich | HPA048884 | |
| 兔抗LTBR多克隆抗体 | ThermoFisher | PA5-102743 | |
| 小鼠抗HLA-DR单克隆抗体 | ThermoFisher | 14-9956-82 | |
| 小鼠抗HLA-A+HLA-B单克隆抗体 | Abcam | ab134189 | |
| 小鼠抗CXCL12/SDF1单克隆抗体 | R&D | MAB350-SP | |
| 小鼠抗CD34单克隆抗体 | ZSGB-BIO | ZM-0046 | |
| 流式细胞术 | PE-Cy7抗人CD4抗体 | BD | 560644 |
| Brilliant Violet 605抗人CD45RO抗体 | Biolegend | 304238 | |
| Alexa Fluor® 488抗人/小鼠TCF1抗体 | Cell Signaling Technology | 6444S | |
| Brilliant Violet 421抗人CD127/IL7R抗体 | BD | 562436 | |
| APC抗人CD197/CCR7抗体 | Biolegend | 353214 | |
| T细胞分离培养 | 人Pan T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-535 |
| Ultra-LEAF™纯化抗人CD3抗体 | Biolegend | 317326 | |
| Ultra-LEAF™纯化抗人CD28抗体 | Biolegend | 302934 | |
| 动物实验 | 重组小鼠SDF-1alpha (CXCL12) | PeproTech | 250-20A |
| 多重免疫荧光 | PANO 6重免疫组化试剂盒(酪胺信号放大,TSA) | PANOVUE | 10294100100 |
| 动物实验 | Corning® Matrigel®基底膜基质 | Corning | 356231 |
| 奥沙利铂 | Hengrui Pharmaceuticals Co. | H20050962 | |
| 免疫组化 | AEC过氧化物酶底物试剂盒,20× | Solarbio | A2010 |
| 流式细胞术 | eBioscience™ Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | Invitrogen | 00-5523-00 |
| 细胞培养 | Hepa1-6细胞系 | ATCC | CRL-1830 |
| DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT | |
| 胎牛血清 | BOVOGEN | SFBS | |
| 免疫组化 | DAB显色剂 | Nichirei | 425314F |
| 多标免疫荧光封片 | 封片剂 | ZS | ZLI-9601 |
| RNA-seq | TRIzol RNA提取试剂 | ThermoFisher | -- |
| 单细胞测序 | Chromium单细胞5′ V2试剂盒 | 10× Genomics Inc. | -- |
| Novaseq 6000测序平台 | Illumina | -- | |
| RNA-seq | MGIseq2000测序平台 | -- | -- |
| 免疫组化扫描 | KFBIO数字病理扫描仪 | KFBIO | KF-PRO-020 |
| 多重免疫荧光扫描 | Nikon AXR NSPARC显微镜 | Nikon | -- |
| Vectra Polaris多光谱成像系统 | Akoya Biosciences | -- | |
| 流式细胞术 | Cytoflex流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集和TLS定量 | HAIC治疗队列、验证队列、HAIC+ICB队列和未治疗对照组的患者数量(n=123、35、49、90);H&E染色和TLS密度定量方法(TLSs/cm²);患者入组标准:2018-2024年,中山大学肿瘤防治中心,晚期或不可切除HCC 阅读提示:STAR★Methods中的Patients and specimens部分及Figure 1 legend |
| 多重免疫组化和免疫荧光 | 抗体名称、克隆号、品牌和货号(如CD3、CD4、CD8、CD20、CD21等);抗原修复条件(EDTA pH9.0)和检测方法(DAB、AEC、TSA);切片厚度4μm 阅读提示:STAR★Methods中的Immunostaining部分及Key resources table |
| 单细胞RNA测序和TCR测序 | 4例HAIC响应患者肿瘤组织;10× Genomics Chromium Single Cell 5′ V2试剂盒;测序平台NovaSeq 6000;数据分析软件版本(Cellranger v3.0、Seurat v4.4.0、Harmony、DoubletFinder v2.0.3等) 阅读提示:STAR★Methods中的Single cell preparation, preparation and sequencing和scRNA-seq and scTCR-seq data analysis部分 |
| 体外T细胞培养 | 健康供者外周血T细胞分离方法(Ficoll密度梯度离心);αCD3/28刺激浓度(2.5 μg/mL);TIF处理浓度(10%);培养时间(6天);检测标志物(CD45RO、TCF1、CCR7、IL7R、LTβ) 阅读提示:STAR★Methods中的T cell isolation and culture和Flow cytometry部分 |
| 小鼠原位肝癌模型 | 6-8周龄雌性C57BL/6小鼠;Hepa1-6细胞数量(8×10^5);OXA剂量(5 mg/kg,腹腔注射,第7和9天);CXCL12剂量(5 μg,瘤内注射,第5天);PBS对照;第11天取材;每组n=5 阅读提示:STAR★Methods中的Mouse model部分及Figure 7H legend |