鉴定卵巢癌干细胞中高表达的CPT1A
筛选参与OCSCs干性维持的差异表达蛋白。
通过悬浮球体培养富集OCSCs,进行蛋白组学分析,并用Western blot、流式细胞术和免疫荧光验证CPT1A在OCSCs中的表达。
CPT1A-mediated MFF succinylation promotes stemness maintenance in ovarian cancer stem cells.
包含细胞系、患者样本、移植瘤模型及多种功能验证和机制验证,如干性表型、脂质代谢、MAMs形成和信号通路分析。
SKOV3细胞系 A2780细胞系 SKOV3裸鼠移植瘤模型 卵巢癌患者组织样本
CPT1A在卵巢癌干细胞中高表达,与干性标志物共定位 CPT1A敲低降低干性标志物表达、球体形成能力和自我更新 CPT1A通过调控脂质去饱和,补充棕榈油酸或油酸可恢复干性 CPT1A调控MAMs形成,影响SREBP1/SCD1轴 Glyburide抑制CPT1A的LSTase活性,增强顺铂抗肿瘤效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选参与OCSCs干性维持的差异表达蛋白。
通过悬浮球体培养富集OCSCs,进行蛋白组学分析,并用Western blot、流式细胞术和免疫荧光验证CPT1A在OCSCs中的表达。
探究CPT1A对OCSCs干性表型和自我更新的影响。
通过shRNA敲低CPT1A,检测干细胞标志物表达、球体形成能力、细胞分裂方式及分化标志物。
验证CPT1A是否通过调节脂质去饱和来维持OCSCs干性。
对CPT1A敲低细胞进行转录组和脂质组学分析,并补充单不饱和脂肪酸(棕榈油酸、油酸)观察干性恢复。
探究CPT1A调控SCD1表达的分子机制。
通过Western blot、免疫荧光和抑制剂处理,检测SREBP1的激活及SCD1表达。
探究CPT1A调控MAMs形成的分子机制。
通过亚细胞分级分离、免疫荧光、透射电镜等方法,检测MAMs形成,并验证MFF在其中的作用。
验证MFF琥珀酰化是否参与CPT1A调控MAMs形成和干性维持。
通过使用CPT1A突变体(G710E和H473A)及琥珀酰化抑制剂,检测MFF琥珀酰化水平、MAMs形成和干性表型。
验证抑制CPT1A的LSTase活性在体内能否增强化疗效果。
构建SKOV3裸鼠皮下移植瘤模型,给予Glyburide、顺铂及其联合治疗,评估肿瘤生长和干性标志物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Solarbio | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | -- | |
| 质粒构建 | pLKO.1-TRC shRNA质粒 | Addgene | -- |
| pCDH-CMV载体 | -- | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | 细胞裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Cell Signaling | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 免疫组织化学 | 全景数字切片扫描仪 | 3D HISTECH | Pannoramic |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488或Alexa Fluor 594二抗 | Molecular Probes | -- |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Leica | -- | |
| DeltaVision显微镜 | General Electric Company | -- | |
| Real-time PCR | 总RNA提取试剂盒 | GenStar | -- |
| Max DNA聚合酶 | TaKaRa | -- | |
| CFX96 Touch实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT溶液 | -- | -- |
| SDS-HCl溶液 | -- | -- | |
| 酶标仪 | BioTek | ELX808 | |
| 划痕实验 | 倒置显微镜 | Nikon | Ti-E733876 |
| Transwell实验 | Transwell小室 | BD | -- |
| 基质胶 | Corning | 354234 | |
| 透射电镜 | 锇酸 | -- | -- |
| Embed 812树脂 | -- | -- | |
| 日立7700透射电子显微镜 | HITACHI | -- | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Beijing HFK Bioscience | -- |
| 流式细胞术 | PE-CD133抗体 | BD | -- |
| FITC-CD44抗体 | -- | -- | |
| 流式细胞仪 | Beckman Coulter | cytoFLEX | |
| FACSAria III细胞分选仪 | Becton & Dickinson | -- | |
| 对称分裂分析 | 诺考达唑 | -- | -- |
| DAPI | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 球体形成实验 | 超低吸附培养板 | Corning | -- |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | -- | |
| ITS胰岛素 | Gibco | 41400045 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | B2064 | |
| 表皮生长因子 | Sino Biological | 10605-HNAE | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Sino Biological | 10014-HNAE | |
| 白血病抑制因子 | Sino Biological | 14890-HNAH | |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140050 | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | -- | |
| 脂质组学 | 甲醇 | -- | -- |
| Accucore C30色谱柱 | Thermo | -- | |
| 超高效液相色谱-高分辨质谱联用系统 | Thermo | -- | |
| LipidSearch软件 | Thermo | -- | |
| 蛋白质组学 | SDT裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂 | Sigma | BCA1 | |
| Nanoelute高效液相色谱系统 | Bruker Daltonics | -- | |
| timsTOF Pro质谱仪 | Bruker | -- | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- | |
| 胆固醇检测 | 总胆固醇检测试剂盒 | Solarbio | BC1985 |
| 琥珀酰辅酶A检测 | 酶联免疫吸附测定板 | Fenxi Biotechnology | FX8976 |
| 药物处理 | 格列本脲 | -- | -- |
| 顺铂 | -- | -- | |
| Fatostatin A | -- | -- | |
| 棕榈油酸 | -- | -- | |
| 油酸 | -- | -- | |
| 丙戊酸 | -- | -- | |
| 依托莫昔 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、培养条件 阅读提示:Methods 细胞培养部分 |
| 质粒构建与转染 | shRNA靶序列、过表达载体、转染试剂和条件 阅读提示:Methods 质粒构建和慢病毒包装部分 |
| Western blot | 抗体信息(稀释比例、品牌)、蛋白裂解液成分、曝光条件 阅读提示:Methods Western blot部分和补充表2 |
| 免疫荧光 | 一抗二抗信息、固定和透化条件、成像设备 阅读提示:Methods 免疫荧光和共聚焦显微镜部分 |
| 球体形成实验 | 培养基配方、细胞接种密度、培养时间、球体计数和直径测量方法 阅读提示:Methods 球体形成实验部分 |
| 流式细胞术 | 抗体浓度、孵育时间和温度、洗涤步骤、分析仪器设置 阅读提示:Methods 流式细胞术分析和细胞分选部分 |
| 透射电镜 | 固定液浓度、脱水、包埋和切片条件 阅读提示:Methods 透射电子显微镜部分 |
| 动物实验 | 动物品系、年龄、性别、细胞接种数量、给药剂量和途径、治疗时间、肿瘤测量方法 阅读提示:Methods 异种移植研究部分 |