建立Bcl2-L-13基因敲除和S272A敲入小鼠模型
研究Bcl2-L-13在体内的功能及其磷酸化位点的重要性。
通过基因打靶技术生成Bcl2l13flox/flox小鼠,与βActin-Cre小鼠杂交获得全身性Bcl2l13−/−小鼠;通过genOway公司生成Bcl2l13S272A/S272A敲入小鼠。通过Southern blot和PCR确认基因型。
AMPK regulates Bcl2-L-13-mediated mitophagy induction for cardioprotection.
包含基因敲除小鼠、磷酸化位点敲入小鼠、细胞实验、激酶筛选、体外激酶实验及体内功能验证等多个独立证据层级。
Bcl2-L-13基因敲除小鼠 Bcl2-L-13 S272A磷酸化位点敲入小鼠 HEK293A细胞系 压力超负荷心脏模型(TAC手术)
Bcl2l13−/−小鼠与Bcl2l13+/+小鼠经TAC手术后心脏功能比较 Bcl2l13S272A/S272A敲入小鼠与野生型小鼠经TAC手术后心脏功能比较 通过siRNA文库筛选和体外激酶实验确认AMPKα2为磷酸化Bcl2-L-13 Ser272的激酶 通过免疫共沉淀验证AMPKα2与Bcl2-L-13在心脏中的相互作用 线粒体形态及线粒体自噬的检测(电镜、LC3B和ATP合酶共定位)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究Bcl2-L-13在体内的功能及其磷酸化位点的重要性。
通过基因打靶技术生成Bcl2l13flox/flox小鼠,与βActin-Cre小鼠杂交获得全身性Bcl2l13−/−小鼠;通过genOway公司生成Bcl2l13S272A/S272A敲入小鼠。通过Southern blot和PCR确认基因型。
模拟心脏压力超负荷,研究Bcl2-L-13在应激条件下的作用。
对8-12周龄雄性小鼠进行横向主动脉缩窄(TAC)手术,使用25G针头造成轻度压力超负荷,设置假手术对照。术后不同时间点进行超声心动图、组织学及分子生物学检测。
比较不同基因型小鼠在压力超负荷下的心脏功能及重塑反应。
通过超声心动图测量左心室内径、缩短分数、室壁厚度;测量左心室重量/胫骨长度比值;检测Nppa和Nppb mRNA表达;组织学染色评估心肌细胞横截面积和纤维化程度。
探究Bcl2-L-13对压力超负荷下线粒体动力学和线粒体自噬的调控作用。
使用透射电镜观察心肌线粒体形态,测量线粒体长径和面积;通过LC3B和ATP合酶免疫荧光共定位评估线粒体自噬水平;检测线粒体分裂融合相关蛋白的表达。
验证线粒体自噬受损对线粒体功能的影响。
分离心肌细胞,用MitoSOX检测线粒体ROS;用Seahorse分析仪测量耗氧率;用ATP检测试剂盒测量心脏组织ATP水平;用线粒体DNA损伤分析试剂盒评估mtDNA损伤。
鉴定磷酸化Bcl2-L-13 Ser272位点的激酶。
利用siRNA文库进行初筛,通过免疫荧光检测磷酸化Bcl2-L-13;次级筛选中评估线粒体自噬;体外激酶实验验证候选激酶对Bcl2-L-13的磷酸化作用。
在体内和体外验证AMPKα2与Bcl2-L-13的相互作用及磷酸化调控。
通过免疫沉淀和免疫印迹检测内源性蛋白相互作用;在心肌细胞或HEK293A细胞中敲低AMPKα2或使用AMPK激活剂/抑制剂,观察对Bcl2-L-13磷酸化和线粒体自噬的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | 抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 |
| 抗LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 2775 | |
| 抗Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2776 | |
| 抗磷酸化DRP1 (Ser637)抗体 | Cell Signaling Technology | 4867 | |
| 抗磷酸化DRP1 (Ser616)抗体 | Cell Signaling Technology | 3455 | |
| 抗Mitofusin2抗体 | Cell Signaling Technology | 9482 | |
| 抗Mitofusin1抗体 | Cell Signaling Technology | 14739 | |
| 抗OPA1抗体 | Cell Signaling Technology | 80471 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 97166 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| 抗Parkin抗体 | Cell Signaling Technology | 2132 | |
| 抗PINK1抗体 | Cell Signaling Technology | 6946 | |
| 抗AMPKα1抗体 | Cell Signaling Technology | 2795 | |
| 抗AMPKα2抗体 | Cell Signaling Technology | 2757 | |
| 抗AMPKα2抗体 | Proteintech | 18167-1-AP | |
| 抗BCL2L13抗体 | Proteintech | 16612-1-AP | |
| 抗PGC1-α抗体 | Proteintech | 66369-1-Ig | |
| 抗FLAG标签抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 组织学分析 | 抗α-肌节肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A2172 |
| 免疫印迹 | 抗TTC11抗体 | Abcam | ab96764 |
| 抗HMGB1抗体 | Abcam | ab18256 | |
| 免疫荧光 | 抗ATP合酶抗体 | Life Technologies | A-21351 |
| 免疫印迹 | 抗Drp1抗体 | BD Transduction Laboratories | 611738 |
| 细胞培养 | RNAi MAX转染试剂 | Invitrogen | 13778030 |
| 转染 | ScreenFect A转染试剂 | Wako | 299-73203 |
| 细胞培养 | 青霉素-链霉素-谷氨酰胺 | Gibco | 10378016 |
| 遗传霉素 | Gibco | 10131-027; | |
| 药物处理 | 巴弗洛霉素A1 | LC Laboratories | B-1080; |
| 免疫印迹 | ECL Prime免疫印迹检测试剂 | GE Healthcare Life Science | RPN2232 |
| Lumigen ECL Ultra试剂 | Lumigen | TMA-100 | |
| 免疫荧光 | ProLong Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | Thermo Fisher Scientific | P36935 |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX线粒体超氧化物指示剂 | Life Technologies | M36008 |
| 组织学分析 | 异硫氰酸荧光素标记的凝集素 | Sigma | L4895 |
| 免疫印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Cell Signaling Technology | 5871 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Cell Signaling Technology | 5870 | |
| 免疫沉淀 | 用于免疫沉淀的Dynabeads Protein A | Thermo Fisher Scientific | 1001D |
| 蛋白纯化 | GST离心纯化试剂盒 | Thermo Scientific Pierce | 11804025 |
| PreScission蛋白酶 | GE Healthcare Lifescience | -- | |
| 体外激酶实验 | AMPK A2/B1/G1重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PV4674 |
| CAMK2B (CaMKII β)重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PV4205 | |
| ERK4重组蛋白 | SignalChem | M30-34G-20 | |
| FASTK重组蛋白 | SignalChem | F01-10G-05 | |
| Haspin重组蛋白 | SignalChem | G10-11G-05 | |
| IRAK2重组蛋白 | SignalChem | I10-10BG-05 | |
| NLK重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PV4309 | |
| CDC42 BPA (MRCKA)重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PV4398 | |
| 重组人PKM2蛋白 | Abcam | ab89364 | |
| MAP3K7/MAP3K7IP1 (TAK1-TAB1)重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PV4394 | |
| ACVR2A人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PV6124 | |
| AAK1重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | A30967 | |
| RIPK3重组蛋白 | SignalChem | R09-10G-05 | |
| PKAc β,活性 | Eurofins Pharma Discovery | 15-007 | |
| 药物处理 | BAPTA-AM钙螯合剂 | TCI chemicals | T2845 |
| 槲皮素 | Sigma-Aldrich | Q4951 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | A9165: | |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Abcam | ab83355 |
| 凋亡检测 | 原位凋亡检测试剂盒 | Takara Bio | MK500 |
| AMPK活性检测 | AMPK激酶活性检测试剂盒 | Cyclex | CY-1182 |
| DNA提取 | DNeasy血液和组织DNA提取试剂盒 | QIAGEN | 69504 |
| 线粒体DNA损伤检测 | 小鼠实时PCR线粒体DNA损伤分析试剂盒 | Detroit R&D | DD2M |
| 细胞培养 | HEK293A细胞系 | Invitrogen | R70507 |
| siRNA筛选 | Silencer™人激酶siRNA文库 | ThermoFisher Scientific | A30079 |
| siRNA敲低 | AMPKα1 siRNA | ThermoFisher Scientific | AM51551, |
| AMPKα2 siRNA | ThermoFisher Scientific | AM51331, | |
| siRNA对照 | 阴性对照No. 1 siRNA | ThermoFisher Scientific | 4390843 |
| 重组DNA | pDONR223-PRKAA2质粒 | Addgene | 23671 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TAC手术 | 手术使用25G针头;小鼠年龄8-12周;雄性 阅读提示:Methods: TAC and echocardiography |
| 心肌细胞分离 | 使用胶原酶II型(1.2 mg/mL)和蛋白酶XIV(0.016 mg/mL)消化 阅读提示:Methods: Isolation of mouse adult cardiomyocytes |
| Seahorse分析 | 细胞数量(100,000细胞/孔);寡霉素(1 μM)、FCCP(2 μM)、鱼藤酮(2 μM)和抗霉素A(4 μM)的浓度 阅读提示:Methods: Assessment of mitochondrial function |
| siRNA筛选 | siRNA浓度(30 nM);CCCP浓度(15 μM);巴弗洛霉素A1浓度(100 nM);处理时间(4小时) 阅读提示:Methods: siRNA library screening |
| 体外激酶实验 | 激酶和底物用量(各0.5 μg);ATP浓度(1 mM);孵育时间(30分钟)和温度(30°C) 阅读提示:Methods: In vitro kinase assay |