GPR34表达特异性鉴定
鉴定能够区分ILC1s和cNK细胞的表面标志物。
利用单细胞RNA测序分析多种组织中的ILC1s和cNK细胞,并通过构建tdTomato-GPR34和HA-GPR34报告小鼠,通过流式细胞术验证GPR34在不同免疫细胞上的表达。
GPR34 is a metabolic immune checkpoint for ILC1-mediated antitumor immunity
包含体外细胞实验、多种小鼠肿瘤模型(皮下、肝转移)、基因敲除/条件敲除、药理学拮抗剂、流式细胞术、RNA-seq及临床样本分析,具备多层次功能验证和机制验证。
MC38结肠癌细胞皮下及肝转移模型 B16F10黑色素瘤皮下模型 LLC肺癌皮下模型 小鼠肝ILC1体外培养
Gpr34在ILC1上的特异性表达(流式、单细胞RNA-seq) LysoPS在肿瘤微环境中的浓度(LC-MS) GPR34缺失或拮抗对肿瘤生长的影响(皮下及肝转移模型) LysoPS通过cAMP-PKA-CREB通路抑制ILC1功能(体外抑制实验) ABHD16A缺失对LysoPS产生和肿瘤生长的影响(CRISPR敲除)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能够区分ILC1s和cNK细胞的表面标志物。
利用单细胞RNA测序分析多种组织中的ILC1s和cNK细胞,并通过构建tdTomato-GPR34和HA-GPR34报告小鼠,通过流式细胞术验证GPR34在不同免疫细胞上的表达。
验证GPR34是否调控ILC1介导的抗肿瘤免疫。
使用Gpr34全敲除小鼠(Gpr34-/-)、条件性敲除小鼠(Gpr34fl/flNcr1Cre等)及抗NK1.1抗体耗竭实验,分析MC38、LLC、B16F10皮下肿瘤和肝转移模型中的肿瘤生长,并评估ILC1数量、增殖和功能分子(IFNγ、颗粒酶、穿孔素)。
测试LysoPS是否直接抑制ILC1活化,并验证其是否通过GPR34和cAMP-PKA-CREB通路起作用。
分选肝ILC1s,用不同浓度LysoPS预处理,并用IL-12/IL-15/IL-18刺激,检测IFNγ、穿孔素、颗粒酶C/B的表达;使用AC、PKA、CREB抑制剂及Gpr34基因敲除验证信号通路。
确认肿瘤细胞产生的LysoPS通过GPR34抑制ILC1抗肿瘤活性。
使用CRISPR-Cas9在肿瘤细胞中敲除ABHD16A,检测LysoPS产生、肿瘤生长、ILC1数量和功能,并在Gpr34-/-小鼠中验证依赖性。
测试药理学拮抗GPR34是否增强ILC1抗肿瘤活性并抑制肿瘤生长,以及与抗TIGIT联合的效果。
使用GPR34拮抗剂(T8848)处理荷瘤小鼠,监测肿瘤生长;分析ILC1浸润和功能;并与抗TIGIT联合治疗。
评估LysoPS-GPR34轴在人类癌症中的临床意义。
分析人结肠癌、头颈癌、肝癌肿瘤组织中GPR34表达与ILC1活性的关联,使用公共单细胞RNA-seq数据(COAD和黑色素瘤)及TCGA/GEO生存数据。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | BI | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Biological Industries (BI) | -- | |
| 基因编辑 | lentiCRISPR v2载体 | Addgene | 52961 |
| Esp3I限制酶 | New England Biolabs | -- | |
| 细胞处理 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 流式细胞术 | 活力染料620 | BD Biosciences | 564996 |
| 可固定活力染料eFluor 780 | eBioscience | 65-0865-14 | |
| FACSAria Fusion流式细胞分选仪 | BD | -- | |
| LSRFortessa流式细胞分析仪 | BD | -- | |
| 固定/破膜缓冲液 | -- | -- | |
| 细胞刺激 | 佛波醇酯 | Sigma-Aldrich | 79346 |
| 离子霉素 | Sigma-Aldrich | 407952 | |
| 莫能菌素 | Sigma-Aldrich | M5273 | |
| 白细胞介素-12 | Sino Biological | 51004-MCCH | |
| 白细胞介素-15 | Peprotech | 210-15 | |
| 白细胞介素-18 | Sino Biological | 50073-NNCE | |
| 信号通路抑制 | SQ22536 | Selleckchem | S8283 |
| Barbadin | MCE | HY-119706 | |
| CCG-1423 | Selleckchem | S7719 | |
| FTS(法尼基硫代水杨酸) | Cayman | 162520-00-5 | |
| U73122 | TargetMol | T6243 | |
| 毛喉素 | MCE | HY-15371 | |
| H-89 | MCE | HY-15979A | |
| 666-15 | MCE | HY-101120 | |
| 信号通路研究 | 溶血磷脂酰丝氨酸(17:1) | Avanti | 858141 |
| 药物处理 | GPR34拮抗剂 | Shanghai Topscience Biological Technology | 907952-06-1 |
| 抗体治疗 | 抗TIGIT抗体 | Bio X Cell | BP0274 |
| 细胞耗竭 | 抗NK1.1抗体 | Bio X Cell | BP0036 |
| 蛋白质印迹 | 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 60008-1-Ig |
| 抗ABHD16A抗体 | Abcam | ab185549 | |
| 抗CREB抗体 | CST | 4820 | |
| 抗磷酸化CREB (Ser133)抗体 | CST | 9198 | |
| 抗磷酸化PKA底物抗体 | CST | 9624 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| RT-qPCR | HiScript III反转录预混液(去除基因组DNA) | Vazyme | R323 |
| SYBR Green预混液 | Takara Bio | -- | |
| LightCycler 96实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 组织消化 | IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C5138 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | DN25 | |
| 淋巴细胞分离 | Percoll分离液 | -- | -- |
| 组织消化 | I型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C0130 |
| D型胶原酶 | Sigma-Aldrich | 11088866001 | |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | Biosharp | BL503A |
| LC-MS分析 | Vanquish Flex超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Q Exactive四极杆-轨道阱质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Gemini 5U C18色谱柱 | Phenomenex | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| GPR34表达分析 | 小鼠品系(tdTomato-GPR34报告小鼠) 阅读提示:Methods: Animals; Results: Fig. 1c,d |
| 肿瘤模型 | 细胞系(MC38, LLC, B16F10),接种数量(1×10^6, 1×10^6, 5×10^5),接种方式(皮下或脾内),小鼠品系(Gpr34fl/flNcr1Cre等) 阅读提示:Methods: Tumor transplantation and in vivo treatments; Results: Fig. 2c-h,i-l |
| 体外LysoPS抑制实验 | 肝ILC1分选纯度(>98%),LysoPS浓度(1,5 μM),刺激细胞因子浓度(IL-12 20ng/ml, IL-15 50ng/ml, IL-18 100ng/ml),刺激时间(12h),预处理时间(1h) 阅读提示:Methods: In vitro culture and stimulation of ILC1s and cNK cells; Results: Fig. 3b-e |
| GPR34拮抗剂治疗 | GPR34拮抗剂剂量(具体数值见文献),给药方式(腹腔注射每日一次),治疗起始时间(肿瘤体积30-80mm3) 阅读提示:Methods: Tumor transplantation and in vivo treatments; Results: Fig. 5a-c, Extended Data Fig. 9a-c |
| 信号通路分析 | 抑制剂浓度(SQ22536 20μM, H-89 10μM, 666-15 0.5μM),LysoPS刺激时间(15min) 阅读提示:Methods: In vitro culture and stimulation of ILC1s and cNK cells; Results: Fig. 3f-i, Extended Data Fig. 7c |