抗体发现与工程化
获得特异性结合人、小鼠和食蟹猴NKp46的交叉反应抗体
使用人scFv噬菌体文库依次对人NKp46和小鼠NKp46进行淘选,富集后转入酵母表面展示,并通过FACS分选获得交叉反应性克隆;对CDRH3进行定点饱和突变,进一步提高对小鼠NKp46的亲和力,最终获得RLN131。
An engineered NKp46 antibody for construction of multi-specific NK cell engagers.
包括抗体发现与工程化(噬菌体展示、酵母展示)、体外功能验证(NK细胞活化、增殖、细胞毒性)、NKCE构建及体内外活性评估、表位作图等多层级实验。
原代人NK细胞 小鼠NK细胞(C57BL/6脾细胞) 表达NKp46的HEK293T细胞 CD20表达的Raji细胞
抗体浓度和孵育时间(如RN131结合实验) NK细胞培养条件(如IL-2/IL-15刺激) 效应细胞与靶细胞比例(E:T比) NKCE构建体格式(如NKCE1等) 检测方法(如钙黄绿素释放实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得特异性结合人、小鼠和食蟹猴NKp46的交叉反应抗体
使用人scFv噬菌体文库依次对人NKp46和小鼠NKp46进行淘选,富集后转入酵母表面展示,并通过FACS分选获得交叉反应性克隆;对CDRH3进行定点饱和突变,进一步提高对小鼠NKp46的亲和力,最终获得RLN131。
验证RLN131与NKp46的结合亲和力、特异性和种属交叉反应性
通过BLI测量RLN131与人、小鼠、食蟹猴NKp46的亲和力;通过流式检测RLN131对表达NKp46的HEK293T细胞和原代NK细胞的结合。
评估RLN131是否激活NK细胞并促进其增殖
将原代人NK细胞与包被或可溶的RLN131共孵育,检测TNFα、IFNγ和CD107a表达;用CFSE标记NK细胞,在IL-2/IL-15存在下与RLN131共培养11天,检测增殖。
构建不同构型NKCE并评估其增强NK细胞杀伤肿瘤细胞的能力
将RLN131 scFv融合至抗CD20抗体不同位置,构建NKCE1-6;用钙黄绿素释放实验检测NK细胞或PBMC对Raji细胞的杀伤,并比较与未修饰抗CD20抗体的活性。
确定RLN131在NKp46上的结合表位
通过竞争结合实验(BLI)和丙氨酸扫描,确定RLN131结合NKp46的保守表位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白表达 | 人NKp46-his | Acro Biosystems | NC1-H52H4 |
| 小鼠NKp46-his | Sino Biological | 50702-M08H | |
| 食蟹猴NKp46-his | Acro Biosystems | NC1-C52H4 | |
| 抗人NKp46(克隆195314) | R&D Systems | -- | |
| 抗人NKp46(克隆9E2) | Miltenyi Biotec | -- | |
| 抗小鼠NKp46(克隆29A1.4) | Biolegend | 137601 | |
| 蛋白标记 | 生物素NHS酯 | Thermo Fisher | PI21326 |
| AF647-NHS酯 | Thermo Fisher | A37573 | |
| 质粒纯化 | Genejet质粒小提试剂盒 | Thermo Fisher | FERK0503 |
| 细胞培养 | Expi293细胞 | Thermo Fisher | A14527 |
| 蛋白纯化 | 蛋白A | Thermo Fisher | 101142 |
| Ni-NTA琼脂糖珠 | GoldBio | H350 | |
| 蛋白L | Thermo Fisher | 20510 | |
| Amicon Ultra离心过滤器 | EMD Millipore | -- | |
| 噬菌体展示 | TG1大肠杆菌细胞 | Antibody Design Labs | PC001 |
| M13KO7辅助噬菌体 | Antibody Design Labs | PH010L | |
| 链霉亲和素磁珠M-280 | ThermoFisher | -- | |
| 酵母展示 | EBY100酵母 | -- | -- |
| pCT载体 | -- | -- | |
| 克隆 | NheI限制酶 | New England Biolabs | -- |
| BamHI限制酶 | New England Biolabs | -- | |
| Frozen-EZ酵母转化试剂盒 | Zymo Research | T2001 | |
| 流式细胞术 | 抗myc抗体 | Thermo Fisher | A21281 |
| 抗鸡AF488 | Thermo Fisher | A11039 | |
| 抗his AF647 | Thermo Scientific | MA1135A647 | |
| 抗人IgG Fc AF647 | SouthernBiotech | 2048-31 | |
| 链霉亲和素AF647 | Thermo Fisher | S21374 | |
| Sony SH800流式细胞仪 | Sony | -- | |
| BD Accuri流式细胞仪 | BD | -- | |
| 数据分析 | FlowJo软件 | BD Biosciences | -- |
| Prism软件 | Graphpad | -- | |
| 细胞分离 | Ficoll-Paque | Cytiva | 17-1440-02 |
| SepMate管 | STEMCELL Technologies | 85450 | |
| RosetteSep人NK细胞富集试剂盒 | STEMCELL Technologies | 15025 | |
| EasySep小鼠NK细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19855 | |
| 细胞培养 | TrypLE Express | Thermo Fisher | 12605010 |
| 非酶解离缓冲液 | Thermo Fisher | 13151014 | |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 人白细胞介素-2 | PeproTech | -- | |
| 人白细胞介素-15 | PeproTech | -- | |
| 亲和力测定 | Octet NTA传感器 | Sartorius | -- |
| NK细胞活化 | CD107a抗体(克隆H4A3) | BioLegend | 328639 |
| CD3抗体(克隆SK7) | BioLegend | 344817 | |
| CD56抗体(克隆HCD56) | BioLegend | 318309 | |
| IFNγ抗体(克隆4S.B3) | BioLegend | 502521 | |
| TNFα抗体(克隆MAb11) | BioLegend | 502935 | |
| 细胞毒性检测 | 钙黄绿素AM | Thermo Fisher | C1430 |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| BioTek Synergy H4多功能酶标仪 | BioTek | -- | |
| 钙黄绿素蓝 | Thermo Fisher | C1429 | |
| 增殖检测 | CFSE染料 | Thermo Fisher | C34570 |
| Sytox Red活/死染色 | Thermo Fisher | S34859 | |
| BioRad ZE5流式细胞仪 | BioRad | -- | |
| 表位作图 | 抗人AF647 | Southern Biotech | 2040-31 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗体表达与纯化 | 宿主细胞(Expi293)、转染方法、纯化方法(蛋白A、Ni-NTA、蛋白L)、缓冲液成分和pH 阅读提示:Materials and methods: Protein expression |
| NK细胞活化实验 | RLN131包被浓度(5 μg/ml)、孵育时间(4小时)、细胞因子添加(IL-15等)、检测抗体(CD107a、IFNγ、TNFα) 阅读提示:Materials and methods: NK cell activation assays; Figure 2b |
| 细胞毒性实验 | 靶细胞类型(Raji、THP-1)、钙黄绿素标记浓度(15 μM)、E:T比(2:1或10:1)、孵育时间(4小时)、抗体浓度 阅读提示:Materials and methods: Calcein release assays; Figure 3 |
| NKCE构建 | NKCE格式(NKCE1-6)、Fc功能(LALA-PG突变)、linker长度(0-17 aa) 阅读提示:Materials and methods: NKCE construction; Figure 3 |
| 表位作图 | NKp46突变体(K41S/E42A、Y121A/D122A、Y194A等)、抗体浓度(1 nM)、竞争结合条件 阅读提示:Materials and methods: Alanine scanning; Figure 5 |