建立乳腺癌类器官生物库
生成覆盖不同分子亚型和分期的乳腺癌类器官模型。
从17例乳腺癌患者肿瘤组织成功培养类器官,并稳定传代超过六代。
The combination of breast cancer PDO and mini-PDX platform for drug screening and individualized treatment.
建立了17例乳腺癌类器官生物库,并通过IHC、NGS验证其保真性;结合体外PDO药物筛选和体内mini-PDX验证,并进行了Western blot机制验证。
乳腺癌患者来源类器官(PDO) mini-PDX小鼠模型 乳腺癌患者肿瘤组织
17例乳腺癌类器官成功建立,涉及不同分子亚型。 类器官与原始肿瘤的组织学(HE、IHC)和遗传学(NGS)特征一致性。 体外药物筛选使用CellTiter-Glo检测,药物处理6天。 体内mini-PDX使用BALB/c裸鼠,皮下植入含肿瘤细胞的中空纤维管。 alpelisib和fulvestrant的给药剂量和方式:alpelisib 25 mg/kg口服每日一次,fulvestrant 200 mg/kg皮下注射每周两次。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成覆盖不同分子亚型和分期的乳腺癌类器官模型。
从17例乳腺癌患者肿瘤组织成功培养类器官,并稳定传代超过六代。
确认类器官保留原始肿瘤的组织学和遗传学特征。
通过HE和IHC染色比较类器官与亲本肿瘤的组织形态和标志物表达;对9对样本进行NGS分析基因突变。
筛选对该患者肿瘤最敏感的抗肿瘤药物。
根据NGS结果选择PI3K抑制剂、mTOR抑制剂、CDK4/6抑制剂和TP53激活剂进行药物敏感性测试。
验证alpelisib与fulvestrant的协同抗肿瘤作用。
使用CompuSyn软件分析两药联合的CI值,并通过Western blot检测PI3K/AKT/mTOR通路和ER蛋白水平。
验证体外药物筛选结果的可靠性。
将患者肿瘤细胞悬液填充到中空纤维管中,皮下植入裸鼠,进行药物处理,然后检测细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 原代组织消化 | 胶原酶 | Sigma | C9407 |
| 细胞培养 | Advanced DMEM/F12培养基 | Gibco | 12634010 |
| 基质胶 | Corning | 354230 | |
| HEPES | Gibco | 15630080 | |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | 35050061 | |
| 青霉素/链霉素 | HyClone | SV30010 | |
| B27添加剂 | Gibco | 12587010 | |
| A83-01 | Tocris | 2939/10 | |
| 人表皮生长因子 | Peprotech | AF-100-15-1000 | |
| Noggin | Peprotech | 120-10C-100 | |
| 人成纤维细胞生长因子7 | PeproTech | 100-19-10 | |
| 人成纤维细胞生长因子10 | PeproTech | 100-26-25 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | A9165-5G | |
| 烟酰胺 | Sigma-Aldrich | N0636-100G | |
| Y27632 | Abmole Bioscience | M1817 | |
| R-spondin1 | Sino Biological | 11083-HNAS | |
| Neuregulin1 | Peprotech | 100-03-100 | |
| SB202190 | Sigma-Aldrich | S7067-25MG | |
| 细胞传代 | TrypLE Express消化液 | Gibco | 12605010 |
| 细胞冻存 | 细胞冻存培养基 | Gibco | 12648010 |
| 免疫组织化学 | ERα抗体 | Abcam | ab16660 |
| 雄激素受体抗体 | CST | 5153T | |
| PR抗体 | Abcam | ab101688 | |
| HER2抗体 | CST | 4290S | |
| Ki-67抗体 | Proteintech | 27309-1-AP | |
| 下一代测序 | Agencourt AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter | -- |
| GeneseeqOne泛癌基因panel | Geneseeq Technology Inc. | -- | |
| xGen Lockdown杂交和洗涤试剂盒 | Integrated DNA Technologies | -- | |
| Dynabeads M-270磁珠 | Life Technologies | -- | |
| KAPA HiFi热启动预混液 | KAPA Biosystems | -- | |
| KAPA文库定量试剂盒 | KAPA Biosystems | -- | |
| HiSeq4000测序平台 | Illumina | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo细胞增殖试剂盒 | Promega | G9681 |
| 药物处理 | Alpelisib | Selleck | S2814 |
| Taselisib | Selleck | S7103 | |
| Buparlisib | Selleck | S2247 | |
| Everolimus | Selleck | S1120 | |
| Temsirolimus | Selleck | S1044 | |
| Rapamycin | Selleck | S1039 | |
| AZD8055 | Selleck | S1555 | |
| Palbociclib | Selleck | S1116 | |
| Flavopiridol | Selleck | S1230 | |
| Trilaciclib | Selleck | S8389 | |
| Eprenetapopt | Selleck | S7724 | |
| COTI-2 | Selleck | S8580 | |
| Fulvestrant | Selleck | S1191 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Biyuntian | P0013C |
| 蛋白和磷酸化抑制剂 | Abmole bioscience | M5293 | |
| BCA蛋白浓度检测试剂盒 | Biyuntian | P0012 | |
| 5×上样缓冲液 | Biyuntian | P0015 | |
| 超敏发光液/增强剂 | New Cell & Molecular | -- | |
| PI3K-110α抗体 | Abcam | ab1678 | |
| p-AKT抗体 | CST | 4060S | |
| AKT抗体 | CST | 4691S | |
| p-mTOR抗体 | CST | 5536S | |
| mTOR抗体 | CST | 2983S | |
| p-S6抗体 | CST | 4857S | |
| ER抗体 | CST | 13258S | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 动物实验 | 中空纤维管 | Repligen Shanghai Biological Company | S9320101 |
| 异氟烷小动物麻醉机 | Rayward Life Technology Company | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 类器官培养 | 组织消化时间(1-2小时),胶原酶浓度(2-3 mg/mL),基质胶类型(growth factor reduced Matrigel),培养基成分及浓度,传代频率。 阅读提示:Methods 2.2 人乳腺肿瘤类器官培养 |
| 免疫组织化学 | 一抗浓度、修复条件、封闭时间、DAB显色时间。 阅读提示:Methods 2.3 免疫组织化学 |
| 下一代测序 | 基因panel版本、捕获试剂盒、测序平台。 阅读提示:Methods 2.4 下一代测序 |
| 体外药物筛选 | 细胞数(3000-6000个/孔),药物处理时间(6天),药物浓度梯度,检测方法(CTG)。 阅读提示:Methods 2.5 细胞活力检测及图5 |
| 联合用药分析 | 药物浓度比例、CI值计算软件。 阅读提示:Methods 2.6 联合效应 |
| Western blot | 蛋白裂解方法、抗体稀释比例、孵育时间。 阅读提示:Methods 2.7 Western blot |
| mini-PDX | 小鼠品系(BALB/cJGpt-Foxn1nu/Gpt),年龄(6-8周),细胞数(20000/1.5cm管),药物剂量(alpelisib 25 mg/kg QD,fulvestrant 200 mg/kg BIW),给药时间(7天)。 阅读提示:Methods 2.8 微型患者来源异种移植瘤的生成及图6 |