建立CD4+ T细胞特异性IPMK敲除小鼠模型
研究IPMK在CD4+ T细胞中的生理功能。
通过将Ipmk floxed小鼠与CD4-Cre小鼠杂交,获得IPMKΔCD4小鼠,并验证T细胞发育正常。
A non-catalytic role of IPMK is required for PLCγ1 activation in T cell receptor signaling by stabilizing the PLCγ1-Sam68 complex.
包含体内动物模型(ConA肝炎模型)、体外细胞实验(MEF、NIH3T3、T细胞)、机制验证(免疫共沉淀、体外激酶实验、显性负性肽干预)等多层级实验。
CD4+ T细胞特异性IPMK敲除小鼠(IPMKΔCD4) 初始CD4+ T细胞 小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs) NIH3T3细胞
CD4+ T细胞特异性IPMK敲除(IPMKΔCD4) ConA诱导肝炎模型(12 mg/kg静脉注射,24-26 g小鼠) TCR刺激(anti-CD3和anti-CD28抗体,浓度和持续时间) IPMK-DN肽(93-126片段)处理 PLCγ1 Y783磷酸化检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究IPMK在CD4+ T细胞中的生理功能。
通过将Ipmk floxed小鼠与CD4-Cre小鼠杂交,获得IPMKΔCD4小鼠,并验证T细胞发育正常。
评估IPMK缺失对T细胞介导的肝脏损伤的影响。
对IPMKf/f和IPMKΔCD4小鼠静脉注射ConA(12 mg/kg),12小时后检测血清ALT/AST水平、肝组织病理和TUNEL凋亡。
检验IPMK缺失对PLCγ1激活及下游信号的影响。
从脾和淋巴结分离初始CD4+ T细胞,用anti-CD3和anti-CD28抗体刺激,通过Western blot检测PLCγ1 Y783磷酸化,流式检测钙流和IL-2产生。
鉴定IPMK的新的结合伙伴。
通过酵母双杂交筛选、体外结合实验、GST pull-down和免疫共沉淀,验证IPMK与Sam68的直接相互作用,并定位结合区域。
验证IPMK是否通过稳定Sam68-PLCγ1复合物来促进PLCγ1磷酸化。
通过免疫共沉淀检测IPMK缺失或过表达对Sam68-PLCγ1结合的影响,并在细胞中检测复合物形成。
验证IPMK-Sam68相互作用对PLCγ1磷酸化和T细胞活化的必要性。
在NIH3T3和初始CD4+ T细胞中转导或转导IPMK-DN片段(93-182或93-126),检测PLCγ1磷酸化、钙流和IL-2。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 刀豆蛋白A | Sigma-Aldrich | -- |
| 组织学分析 | 原位细胞死亡检测试剂盒(荧光素) | Roche | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Biowest | -- |
| 胎牛血清 | Atlas Biologicals | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Welgene | -- | |
| 细胞转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus | -- |
| Lipofectamine LTX转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| siRNA敲低 | IPMK siRNA | Bioneer | -- |
| T细胞分离 | MACS小鼠初始CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| MagniSort小鼠CD4初始T细胞富集试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| T细胞培养 | 抗CD3抗体 | eBioscience | 16-0031-85 |
| 抗CD28抗体 | eBioscience | 16-0281-86 | |
| β-巯基乙醇 | Gibco | -- | |
| 细胞增殖检测 | CellTrace CFSE增殖试剂盒 | Invitrogen | C34554 |
| TCR刺激 | 抗亚美尼亚仓鼠IgG二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratory | -- |
| PTD肽 | Peptron | -- | |
| 质粒构建 | pCMV-GST载体 | Addgene | -- |
| 病毒生产 | pMD2G包装质粒 | -- | -- |
| psPAX2.0包装质粒 | -- | -- | |
| pCL-Eco包装质粒 | -- | -- | |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 病毒筛选 | 嘌呤霉素 | Gibco | -- |
| 病毒转导 | 重组人IL-2 | Peprotech | -- |
| 蛋白提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 蛋白定量 | Bradford蛋白定量试剂盒 | Bio-rad | -- |
| 免疫印迹 | 抗Flag抗体 | Sigma Aldrich | F1804 |
| 抗Tubulin抗体 | Sigma Aldrich | T5109 | |
| 抗Sam68抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1238 | |
| 正常兔IgG | Santa Cruz Biotechnology | sc-2027 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 抗LAT抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53550 | |
| 抗HA抗体 | Biolegend | MMS-101R | |
| 抗GST抗体 | Cell Signaling Technology | 2622 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| 抗磷酸化PLCγ1 (Tyr783)抗体 | Cell Signaling Technology | 2821 | |
| 抗PLCγ1抗体 | Cell Signaling Technology | 5690 | |
| 抗磷酸化Src家族(Tyr416)抗体 | Cell Signaling Technology | 6943 | |
| 抗Src抗体 | Cell Signaling Technology | 2108 | |
| 抗磷酸化PKCθ (Thr538)抗体 | Cell Signaling Technology | 9377 | |
| 抗PKCθ抗体 | Cell Signaling Technology | 13643 | |
| 抗IPMK抗体 | Novus Biologicals | NBP1-32250 | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag M2磁珠 | Millipore | -- |
| TrueBlot磁珠 | Rockland Immunochemicals | -- | |
| GST pull-down | 谷胱甘肽琼脂糖磁珠 | Incopharm | -- |
| 体外结合实验 | 重组Flag-Sam68蛋白 | OriGene | TP300263 |
| 体外激酶实验 | Flag-PLCγ1重组蛋白 | OriGene | TP316448 |
| GST-Src重组蛋白 | Sino Biological | 10755-H20B | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Molecular Research Center | -- |
| cDNA合成 | Superscript III逆转录酶 | enzynomics | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green预混液 | Toyobo | -- |
| Step One Plus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | PMA | Calbiochem | -- |
| 离子霉素 | Sigma Aldrich | -- | |
| 布雷菲德菌素A | Invitrogen | -- | |
| 可固定活力染料 | eBioscience | 65-0866-14 | |
| 抗小鼠CD4 eFluor450抗体 | eBioscience | 48-0042-82 | |
| 抗小鼠CD44 APC eFluor780抗体 | eBioscience | 47-0441-82 | |
| 抗小鼠CD25 PE抗体 | eBioscience | 12-0251-82 | |
| 抗小鼠TCRβ抗体 | eBioscience | 11-5961-82 | |
| 抗小鼠IL-2 APC抗体 | eBioscience | 17-7021-82 | |
| 抗小鼠IFNγ PE抗体 | eBioscience | 12-7311-82 | |
| 抗小鼠IL-4抗体 | eBioscience | 12-7041-82 | |
| 抗小鼠IL-17A PE-Cyanine7抗体 | eBioscience | 25-7177-82 | |
| 抗小鼠CD69 Alexa Fluor 700抗体 | BD Biosciences | 561238 | |
| 抗小鼠TNF PE抗体 | BD Biosciences | 561063 | |
| 抗磷酸化PLCγ1 (Tyr783) Alexa Fluor 647抗体 | Cell Signaling Technology | 88717 | |
| 钙流检测 | Fluo4 AM钙指示剂 | Invitrogen | F14201 |
| Fura Red钙指示剂 | Invitrogen | F3020 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件9.0 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别、体重范围,ConA剂量和给药途径,检测时间点。 阅读提示:Methods: Animal experiments, Induction of ConA-induced hepatitis; Figure 1 legend |
| T细胞分离与刺激 | 细胞来源(脾、淋巴结),分离试剂盒,刺激抗体浓度(anti-CD3 10 μg/mL, anti-CD28 10 μg/mL),刺激时间(3-10分钟),培养基成分。 阅读提示:Methods: In vitro CD4+ helper T cell differentiation, proliferation, and TCR stimulation; Figure 2 legend |
| IPMK敲除或敲低 | 细胞类型(MEF、NIH3T3、T细胞),敲除方法(CRISPR/Cas9, 4-OHT处理条件),siRNA序列和浓度。 阅读提示:Methods: Cell culture and transfection, Virus production and transduction; Figure 3 legend |
| 蛋白相互作用检测 | 抗体种类和用量,免疫沉淀条件(珠子类型),GST pull-down条件,体外结合实验蛋白浓度。 阅读提示:Methods: Immunoprecipitation and GST pull-down assays, In vitro binding assay; Figure 4 legend |
| PLCγ1磷酸化检测 | 抗体(phospho-PLCγ1 Tyr783),刺激条件(TCR或PDGF),时间点,蛋白上样量。 阅读提示:Methods: SDS-PAGE and immunoblotting; Results sections; Figure 5-7 legends |
| 显性负性肽处理 | IPMK-DN肽序列(93-126),浓度(1 μM),处理时间,TCR刺激条件。 阅读提示:Methods: In vitro CD4+ helper T cell differentiation, proliferation, and TCR stimulation; Figure 7 legend |