基因表达分析
评估SIRPα和PD-L1在结直肠癌中的表达及临床相关性
利用单细胞测序数据、TCGA和GEO数据库分析SIRPα和PD-L1表达及与预后的关系
Discovery of a novel small molecule as CD47/SIRPα and PD-1/PD-L1 dual inhibitor for cancer immunotherapy.
包含体外分子结合实验、细胞功能实验、体内肿瘤模型验证、联合放疗实验及安全性评估,多个实验层级相互支撑。
MC38结肠癌小鼠皮下移植瘤模型 BMDMs与MC38/B16-OVA肿瘤细胞共培养体系 Jurkat T细胞与CHO-K1-PD-L1细胞共培养体系 稳定表达CD47或PD-1的CHO-K1细胞系
SMC18对人和鼠SIRPα及PD-L1的结合亲和力(KD值) SMC18阻断CD47/SIRPα和PD-1/PD-L1相互作用的IC50值 SMC18在体外对巨噬细胞吞噬和T细胞IL-2分泌的增强效果 SMC18在MC38荷瘤小鼠中的抗肿瘤剂量(2和6 mg/kg) SMC18联合放疗(20 Gy)的协同抗肿瘤效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SIRPα和PD-L1在结直肠癌中的表达及临床相关性
利用单细胞测序数据、TCGA和GEO数据库分析SIRPα和PD-L1表达及与预后的关系
验证SMC18能否特异性结合SIRPα和PD-L1并阻断其与配体的相互作用
通过MST测定亲和力,用细胞阻断实验测定IC50,分子对接分析结合位点
评估SMC18对巨噬细胞吞噬作用和T细胞活性的影响
通过吞噬实验、共培养实验、 Western blotting检测SIRPα和PD-1磷酸化
验证SMC18在MC38荷瘤小鼠中的抗肿瘤效果及免疫调节作用
在MC38皮下移植瘤模型中,给予不同剂量SMC18,测量肿瘤体积,通过流式检测免疫细胞浸润
评估SMC18是否引起血液学和肝脏毒性
检测红细胞、血红蛋白、ALT、AST水平,进行H&E染色
研究SMC18与放疗联合的抗肿瘤效果
在MC38荷瘤小鼠中,给予单次20 Gy局部照射和SMC18治疗,测量肿瘤生长
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| MST结合实验 | 人SIRPα-IgV-His蛋白 | ACRO Biosystems | SIA-H5225 |
| 人PD-L1-IgV-His蛋白 | Sino Biological | 10084-H08H | |
| Red-NHS647染料 | NanoTemper | NT-MO-L001 | |
| SMC18 | ChemDiv | C385-0664 | |
| 阻断实验 | SIRPα-Fc蛋白 | ACRO Biosystems | SIA-H5251 |
| PD-L1-Fc蛋白 | Sino Biological | 10084-H02H | |
| 吞噬实验 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | 315-03 |
| 抗CD47抗体(克隆miap301) | Invitrogen | 16-0471-81 | |
| 抗F4/80抗体 | eBioscience | 17-4801-82 | |
| DiR染料 | Beyotime | R-22070 | |
| 共培养实验 | 佛波醇-12-十四烷酰基-13-乙酸酯 | Sigma | 16561-29-8 |
| 植物血凝素 | Sigma | L8902 | |
| 抗人CD3抗体(OKT3) | BioGems | -- | |
| 抗人CD28抗体(CD28.2) | BioGems | -- | |
| 蛋白转运抑制剂 | BD Biosciences | 555029 | |
| 抗人CD45抗体 | eBioscience | HI30 | |
| 抗人IL-2-APC抗体 | eBioscience | MQ1-17H12 | |
| MTT实验 | MTT | Sigma | 298-93-1 |
| Western blotting | 抗SIRPα抗体 | Abcam | AB8120 |
| 抗PD-1抗体 | Abcam | ab52587 | |
| 抗磷酸酪氨酸抗体 | Millipore | 05-321 | |
| HRP偶联的山羊抗兔IgG | Sangon Biotech | D110058 | |
| HRP偶联的山羊抗小鼠IgG | Sangon Biotech | D110087 | |
| ECL检测试剂盒 | Applygen | P1030 | |
| 动物实验 | MC38结直肠癌细胞 | -- | -- |
| 抗小鼠CD45-FITC抗体 | eBioscience | 30-F11 | |
| 抗小鼠CD3-PerCP-eFluor710抗体 | eBioscience | 17A2 | |
| 抗小鼠CD8α-PE抗体 | eBioscience | 53-6.7 | |
| 抗小鼠CD11b-eFluor450抗体 | eBioscience | M1/70 | |
| 抗小鼠F4/80-PerCP-Cyanine5.5抗体 | eBioscience | BM8 | |
| 抗小鼠CD11c-APC抗体 | eBioscience | M418 | |
| 抗小鼠CD206-PE抗体 | eBioscience | MR6F3 | |
| 离子霉素 | Sigma | I0634 | |
| 抗小鼠IFN-γ-APC抗体 | eBioscience | XMG1.2 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | 11875093 |
| DMEM培养基 | Gibco | 11965092 | |
| 胎牛血清 | BI | 04-001-1ACS | |
| 青霉素 | Solarbio | P8420 | |
| 链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 分子对接 | MOE | Chemical Computing Group | -- |
| 流式分析 | BD FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- |
| BD FACSCelesta流式细胞仪 | BD | -- | |
| 共聚焦显微镜 | LSM880激光共聚焦显微镜 | Carl Zeiss AG | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞类型、培养基、FBS浓度、青霉素/链霉素浓度 阅读提示:见Methods中的Cell lines and cell culture |
| MST结合实验 | 蛋白浓度、SMC18浓度范围、标记染料 阅读提示:见Methods中的Microscale thermophoresis (MST) binding assay |
| 阻断实验 | SIRPα-Fc和PD-L1-Fc浓度、细胞系、SMC18浓度 阅读提示:见Methods中的Blocking assays |
| 吞噬实验 | BMDM诱导条件(GM-CSF浓度、时间)、SMC18浓度、肿瘤细胞比例 阅读提示:见Methods中的Phagocytosis assays |
| 共培养实验 | Jurkat细胞刺激条件、共培养比例、SMC18浓度 阅读提示:见Methods中的Co-culture assays |
| 体内肿瘤模型 | MC38细胞接种量、小鼠品系、SMC18剂量、给药方式、时间 阅读提示:见Methods中的Tumor models and treatments |
| 联合放疗模型 | 放疗剂量、SMC18剂量、给药方式、时间 阅读提示:见Methods中的Tumor models and treatments |