体外药效评估
评估EriB联合HHT对t(8;21) AML细胞增殖和凋亡的影响
使用Kasumi-1和SKNO-1细胞,测定单药IC50和联合指数(Ci),并检测细胞活力、细胞计数和凋亡率。
Combination of eriocalyxin B and homoharringtonine exerts synergistic anti-tumor effects against t(8;21) AML.
包含细胞活力与凋亡检测、转录组与CUT&Tag分析、蛋白质互作与降解机制验证、动物移植瘤模型及患者样本验证等多层级证据。
Kasumi-1细胞系 SKNO-1细胞系 共表达RUNX1-RUNX1T1和KITN822K的BALB/c小鼠骨髓移植模型 t(8;21) AML患者骨髓单个核细胞(BMMCs)
细胞系:Kasumi-1、SKNO-1,培养条件(RPMI-1640,10%或20% FBS,SKNO-1需补充GM-CSF) 药物浓度:EriB(Kasumi-1 0.5 μM,SKNO-1 1 μM)、HHT(20 nM),处理时间(24小时) 体内给药:EriB 5 mg/kg,HHT 0.25 mg/kg,每日一次,连续7天 动物模型:共表达RUNX1-RUNX1T1和KITN822K的BALB/c小鼠,药物在移植后第7天开始 患者样本:t(8;21) AML伴KIT突变患者的BMMCs(n=5)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估EriB联合HHT对t(8;21) AML细胞增殖和凋亡的影响
使用Kasumi-1和SKNO-1细胞,测定单药IC50和联合指数(Ci),并检测细胞活力、细胞计数和凋亡率。
探究EriB联合HHT对RUNX1-RUNX1T1转录调控功能的影响
对处理9小时的Kasumi-1细胞进行RNA-seq和CUT&Tag分析,检测RUNX1-RUNX1T1的结合变化和下游基因表达。
确认EriB联合HHT诱导RUNX1-RUNX1T1降解和抑制KIT表达的分子机制
通过Western blot、JC-1染色、细胞色素c释放和ChIP-qPCR验证JNK-caspase-3通路和NF-κB通路的作用。
评估EriB联合HHT在动物模型中的治疗效果和安全性
在共表达RUNX1-RUNX1T1和KITN822K的BALB/c小鼠中给药,监测外周血、脾脏、白血病细胞比例和生存期。
在原发性t(8;21) AML样本中验证联合治疗的协同效应
从t(8;21) AML伴KIT突变患者骨髓中分离BMMCs,检测EriB和HHT单独或联合处理后的凋亡、活力和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 毛萼乙素 | Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences | -- |
| 高三尖杉酯碱 | Hangzhou Minsheng Pharmaceutical | -- | |
| 达沙替尼 | Sigma-Aldrich | SML2589 | |
| JNK抑制剂IN 8 | Selleck | S4901 | |
| 多西环素 | Selleck | S5159 | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Selleck | S1623 | |
| 多柔比星 | Selleck | S1208 | |
| 阿糖胞苷 | Selleck | S1648 | |
| Z-DEVD-FMK | Selleck | S7312 | |
| 肿瘤坏死因子α | Abclonal | RP00001 | |
| 重组蛋白 | 重组人CBFβ蛋白 | Sino Biological | 14569-H07E |
| 重组人RUNX1-RUNX1T1蛋白 | CUSABIO | -- | |
| 重组人HEB蛋白 | CUSABIO | -- | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875-093 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099-141 | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | R&D Systems | 7954-GM | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| RNA-seq | RNeasy Micro试剂盒 | QIAGEN | 74004 |
| TruSeq RNA文库制备试剂盒v2 | Illumina | RS-122-2001 | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| CUT&Tag | Hyperactive Universal CUT&Tag检测试剂盒 | Vazyme | TD903-01 |
| 抗RUNX1T1抗体 | Abcam | ab220347 | |
| 核/胞质分离 | Qproteome核蛋白提取试剂盒 | QIAGEN | 37582 |
| 线粒体分离 | 细胞线粒体分离试剂盒 | Beyotime | C3601 |
| ChIP-qPCR | ChIP-IT高灵敏度试剂盒 | Active Motif | 53040 |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242S | |
| SYBR Green荧光染料 | QIAGEN | 204243 | |
| 免疫共沉淀 | 抗IgG抗体 | Santa Cruz | sc-2025 |
| 表面等离子共振 | Biacore T200分子相互作用仪 | Cytiva | -- |
| Biacore 8k分子相互作用仪 | Cytiva | -- | |
| NTA传感芯片 | Cytiva | 28994951 | |
| CM5传感芯片 | Cytiva | BR100012 | |
| PBS-P缓冲液 | Cytiva | 28995084 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | Kasumi-1、SKNO-1等细胞系的培养条件,包括培养基(RPMI-1640)、血清浓度(10%或20%)、SKNO-1需补充GM-CSF(10 μg/L) 阅读提示:Materials and methods: Cell lines |
| 体外药物处理 | EriB和HHT的浓度(EriB 0.5-1 μM,HHT 20 nM)、处理时间(9-48小时不等)、细胞密度 阅读提示:Figure legends 1, 2, 3, 4 |
| RNA-seq和CUT&Tag | Kasumi-1细胞处理条件(EriB 0.5 μM,HHT 20 nM,9小时),RNA提取和测序平台(NovaSeq 6000) 阅读提示:Materials and methods: RNA-seq and analysis; CUT&Tag |
| 动物实验 | BALB/c小鼠周龄(6周)、细胞移植方式(GFP标记的脾细胞)、给药方案(EriB 5 mg/kg,HHT 0.25 mg/kg,每日一次,连续7天)、给药起始时间(移植后第7天) 阅读提示:Materials and methods: Animal model; Figure legend 5 |
| 患者样本 | t(8;21) AML伴KIT突变患者的BMMCs(n=5),EriB和HHT处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: Patient samples; Figure legend 6 |