囊泡整合膜蛋白36参与HepG2细胞中选择性分泌岩藻糖基化蛋白到胆管样结构

Vesicular Integral-Membrane Protein 36 Is Involved in the Selective Secretion of Fucosylated Proteins into Bile Duct-like Structures in HepG2 Cells.

作者信息Mizuki Muranaka, Shinji Takamatsu, Tsunenori Ouchida, Yuri Kanazawa, Jumpei Kondo, Tsutomu Nakagawa, Yuriko Egashira, Koji Fukagawa, Jianguo Gu, Toru Okamoto, Yoshihiro Kamada, Eiji Miyoshi
PMID37108200
发布时间2023-04-11
DOI10.3390/ijms24087037

实验完整度

高

包含FUT8和VIP36基因敲除、免疫荧光、免疫沉淀、蛋白质组学、内体分级分离等多个实验层级,并进行了功能验证和机制探讨。

主要模型

HepG2肝癌细胞系(具有部分肝细胞极性) FUT8敲除HepG2细胞 VIP36敲除HepG2细胞 Huh7肝癌细胞系(无胆管样结构)

重点核对

FUT8基因敲除对AFP-L3分泌的影响 VIP36基因敲除对AFP-L3和α1-抗胰蛋白酶分泌的影响 免疫荧光共定位分析(AFP/AFP-L3与MRP2) 内体分级分离和免疫印迹分析 Strep-tag/Strep-Tactin系统结合质谱鉴定相互作用蛋白

摘要

岩藻糖基化蛋白被广泛用作癌症和炎症的生物标志物。岩藻糖基化甲胎蛋白(AFP-L3)是肝细胞癌的特异性生物标志物。我们之前表明,血清AFP-L3水平的增加依赖于岩藻糖基化调节基因表达的增加和癌细胞中岩藻糖基化蛋白的异常转运。在正常肝细胞中,岩藻糖基化蛋白选择性地分泌到胆管中,而不是血液中。在没有细胞极性的癌细胞中,这种选择性分泌系统被破坏。在此,我们旨在鉴定参与在HepG2肝癌细胞中将岩藻糖基化蛋白(如AFP-L3)选择性分泌到胆管样结构中的货物蛋白,HepG2细胞具有部分类似于正常肝细胞的细胞极性。α1-6岩藻糖基转移酶(FUT8)是合成核心岩藻糖和产生AFP-L3的关键酶。首先,我们在HepG2细胞中敲除了FUT8基因,并研究了其对AFP-L3分泌的影响。AFP-L3在HepG2细胞的胆管样结构中积累,而这种现象被FUT8敲除所减弱,表明HepG2细胞具有AFP-L3的货物蛋白。为了鉴定参与HepG2细胞中岩藻糖基化蛋白分泌的货物蛋白,进行了免疫沉淀和蛋白质组学Strep-tag系统实验,随后进行质谱分析。蛋白质组学分析结果,鉴定了七种凝集素样分子,我们根据文献考虑选择了囊泡整合膜蛋白基因VIP36作为与N-聚糖上α1-6岩藻糖基化(核心岩藻糖)相互作用的候选货物蛋白。如预期的那样,HepG2细胞中VIP36基因的敲除抑制了AFP-L3和其他岩藻糖基化蛋白(如岩藻糖基化α1-抗胰蛋白酶)分泌到胆管样结构中。我们提出VIP36可能是参与HepG2细胞中岩藻糖基化蛋白顶端分泌的货物蛋白。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
VIP36是否作为货物蛋白参与HepG2细胞中岩藻糖基化蛋白(如AFP-L3)向胆管样结构的分泌?
核心机制
VIP36可能作为凝集素样货物受体,通过识别N-聚糖上的核心岩藻糖和/或末端岩藻糖,介导岩藻糖基化蛋白向顶端胆管侧的选择性转运。
主要证据
VIP36敲除显著降低了AFP和α1-抗胰蛋白酶在胆管样结构中的积累;FUT8敲除也减少了AFP-L3的积累,但VIP36敲除对α1-抗胰蛋白酶的抑制更明显。
研究意义
VIP36可能是参与肝细胞顶端分泌岩藻糖基化蛋白的候选蛋白,其功能失调可能与某些肝脏疾病的发生有关。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

验证FUT8对AFP-L3分泌的影响

确认FUT8基因敲除是否影响AFP-L3在HepG2细胞胆管样结构中的积累。

通过免疫荧光染色检测WT和FUT8-KO HepG2细胞中AFP和AFP-L3的定位,观察胆管样结构(MRP2标记)中的共定位情况。

2

鉴定AFP的潜在相互作用蛋白

通过免疫沉淀和Strep-tag系统结合质谱分析,鉴定可能与AFP结合的凝集素样货物蛋白。

使用抗AFP抗体或Strep-tag系统从细胞培养上清、细胞裂解液和内体组分中分离AFP相互作用蛋白,并进行银染和质谱分析。

3

验证VIP36敲除对AFP分泌的影响

确定VIP36基因敲除是否影响AFP向胆管样结构的转运。

建立VIP36敲除的HepG2细胞,通过免疫荧光染色和统计分析评估胆管样结构中AFP的阳性率。

4

验证VIP36敲除对其他岩藻糖基化蛋白分泌的影响

探讨VIP36是否影响除AFP外的其他岩藻糖基化蛋白(如α1-抗胰蛋白酶)的分泌。

通过免疫荧光染色比较WT、FUT8-KO和VIP36-KO HepG2细胞中α1-抗胰蛋白酶在胆管样结构中的积累情况。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

细胞培养
蛋白表达检测
蛋白定位分析
质谱鉴定

产品清单

实验环节名称品牌货号
Dulbecco改良Eagle培养基Nacalai Tesque08456-36
胎牛血清HyCloneSH30910.02
青霉素-链霉素Nacalai Tesque09367-34
RPMI 1640培养基Nacalai Tesque30264-56
Triton X-100MP Biomedicals807426
二硫苏糖醇Nacalai Tesque14112-94
正常驴血清Sigma-AldrichD9663
牛血清白蛋白Nacalai Tesque01863-35
甘氨酸FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation077-00735
抗AFP抗体Sysmex Corporation--
抗AFP-L3抗体Sysmex Corporation--
抗MRP2抗体KAMIYA BIOMEDICAL--
Alexa Fluor 488标记的驴抗小鼠IgGInvitrogenA21202
Alexa Fluor 546标记的驴抗兔IgGInvitrogenA10040
4',6-二脒基-2-苯基吲哚InvitrogenD1306
抗α1-抗胰蛋白酶抗体Proteintech16382-1-AP
Amicon Ultra-15离心过滤器MilliporeUFC9010
蛋白酶抑制剂混合物Nacalai Tesque25955-11
Bioruptor超声破碎仪Tosho Electric--
超速离心管Beckman Coulter344059
SW 41 Ti水平转子Beckman Coulter--
Optima XPN-90超速离心机Beckman Coulter--
抗LAMP-1抗体Abcamab24170
HRP偶联的抗兔IgG抗体PromegaW4011
ECL系统Nacalai Tesque02230
NucleoSpin凝胶和PCR清洁试剂盒MACHEREY-NAGEL740609
pGEM-T Easy载体系统PromegaA1360
EcoRI限制性内切酶Takara Bio1040A
NEBuilder HiFi DNA组装预混液New England BioLabsE2621
银染MS试剂盒FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation--
BbsI限制性内切酶New England BiolabsR0539
pX330-U6-Chimeric_BB-CBh-hSpCas9载体Addgene42230
GenJet体外转染试剂SignaGen LaboratoriesSL100489-HEPG2
嘌呤霉素InvivoGenanti-pr-1
抗VIP36抗体Sino Biological12455-MM02
JMP Pro 16.0软件SAS Institute Inc.--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系来源(HepG2来自ATCC,Huh7来自RIKEN BRC);培养基类型(DMEM或RPMI 1640);血清浓度(10% FBS);抗生素浓度(100 U/mL青霉素和100 μg/mL链霉素);培养条件(37°C,5% CO2)
阅读提示:Methods 4.1 Cell Lines
基因敲除
VIP36敲除载体构建方法(CRISPR/Cas9,使用pX330载体);转染试剂(GenJet)和用量;嘌呤霉素筛选浓度(2 μg/mL);敲除验证(免疫印迹)
阅读提示:Methods 4.7 Production of VIP36 Knockout Vector, 4.8 Transfection of AFP Gene, VIP36 KO Vector and Immunoblotting of VIP36
免疫染色
固定(4%多聚甲醛,10 min);透化(0.1% Triton X-100,30 min);还原处理(150 mM DTT,30 min,α1-抗胰蛋白酶染色除外);封闭液(10%正常驴血清、1% BSA、0.3 M甘氨酸);一抗浓度(抗AFP 8 μg/mL,抗AFP-L3 20 μg/mL,抗MRP2 1:100,抗α1-抗胰蛋白酶5 μg/mL);二抗浓度(10 μg/mL);核染色(DAPI 1:500或1:400);成像(共聚焦显微镜)
阅读提示:Methods 4.2 Immunohistochemistry
免疫沉淀
收集上清的条件(无血清培养基培养2天);细胞裂解液制备(Golgi溶液和蛋白酶抑制剂);超声破碎条件(Bioruptor,冰上5分钟,15秒开/关循环);离心条件(20,000×g,20分钟,4°C);浓缩滤器规格(10 kDa)
阅读提示:Methods 4.3 Immunoprecipitation
内体分离
细胞裂解方法(22G针头注射器匀浆30次);蔗糖梯度(62%、35%、25%);超速离心条件(210,000×g,90分钟,4°C);组分收集(1 mL/份)
阅读提示:Methods 4.4 Preparation of Endosome Fraction
Strep-tag系统
AFP基因克隆(PCR条件、引物序列);载体构建(pCAGGS-FOS,EcoRI酶切,NEBuilder HiFi组装);转染条件(8 μg质粒DNA,24 μL GenJet)
阅读提示:Methods 4.5 The Proteomic Strep-Tag System, 4.8 Transfection