小分子药物筛选
筛选能增强CAR T细胞杀伤肿瘤细胞的小分子化合物。
将MDA-MB-231-FFluc细胞单独或与B7-H3 CAR T细胞共培养(E:T=1:4),并分别加入624个小分子化合物(1 μM)处理24-48小时,通过发光检测肿瘤细胞活性;同时单独处理CAR T细胞检测表型。
A drug screening to identify novel combinatorial strategies for boosting cancer immunotherapy efficacy.
包含体外细胞系筛选、3D肿瘤球实验、RNA-seq转录组分析、免疫缺陷小鼠异种移植模型及免疫活性小鼠原位模型,并进行功能验证和机制验证。
MDA-MB-231人乳腺癌细胞系 HCT116人结直肠癌细胞系 B7-H3 CAR T细胞 MC38和4T1小鼠肿瘤模型 M-NSG免疫缺陷小鼠异种移植模型
筛查浓度为1 µM,处理时间24-48小时 异种移植模型中B7-H3 CAR T细胞剂量1×10^7,静脉注射,第7天和第14天 小鼠模型中JK184剂量5 mg/kg,腹腔注射,第7天至第17天 ICB抗体剂量100 μg,腹腔注射,第7天和第10天 效应细胞与靶细胞比例(E:T)为4:1, 1:1, 1:4
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选能增强CAR T细胞杀伤肿瘤细胞的小分子化合物。
将MDA-MB-231-FFluc细胞单独或与B7-H3 CAR T细胞共培养(E:T=1:4),并分别加入624个小分子化合物(1 μM)处理24-48小时,通过发光检测肿瘤细胞活性;同时单独处理CAR T细胞检测表型。
评估筛选出的药物(BML284、PPP、JK184)对肿瘤细胞和CAR T细胞的功能影响。
用MTT法测定药物对MDA-MB-231和HCT116的IC50;用Annexin V/7AAD检测凋亡;共培养实验检测CAR T细胞杀伤、穿孔素和颗粒酶B分泌;RTCA实时监测细胞活力;3D肿瘤球模型评估药物联合CAR T的肿瘤抑制。
探索药物对肿瘤细胞和T细胞信号通路的影响。
对药物处理的MDA-MB-231细胞和T细胞进行RNA-seq,并进行GO、KEGG通路富集和GSEA分析;用qPCR验证关键基因表达。
验证JK184联合B7-H3 CAR T细胞在体内的抗肿瘤效果。
将MDA-MB-231-FFluc或HCT116-FFluc细胞皮下注射至M-NSG小鼠,第7天和第14天静脉注射CAR T细胞,连续10天腹腔注射JK184或PBS,监测肿瘤生长和生存。
评估JK184联合ICB在免疫活性小鼠中的抗肿瘤效果及对肿瘤微环境的影响。
将MC38或4T1细胞皮下接种至C57BL/6或BALB/c小鼠,第7天开始给予JK184,第7天和第10天给予抗PD1或抗CTLA4抗体,测量肿瘤体积和生存率,并通过流式分析肿瘤浸润免疫细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| T细胞培养 | 白细胞介素-2 | PeproTech | 200-02 |
| T细胞激活试剂 | Miltenyi Biotec | 130-111-160 | |
| X-vivo培养基 | Lonza | -- | |
| 白细胞介素-15 | PeproTech | 200-15 | |
| T细胞转导 | 重组人纤连蛋白片段 | TaKaRa | T100A/B |
| 化合物筛选 | 小分子化合物库 | TOPSCIENCE | L4000 |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | Sigma-Aldrich | CT02 |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| 细胞计数 | Countstar Rigel S5细胞计数仪 | Countstar | -- |
| 共培养实验 | xCELLigence实时细胞分析仪 | ACEA Biosciences | -- |
| 3D肿瘤球培养 | 超低吸附培养皿 | Corning | -- |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | -- | |
| B27添加剂 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | |
| 人重组表皮生长因子 | Sino Biological | 10605-HNAE | |
| 人重组成纤维细胞生长因子 | Sino Biological | 10573-HNAE | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/7AAD凋亡检测试剂盒 | Meilunbio | MA0428 |
| 共培养标记 | CFSE细胞增殖示踪染料 | Biolegend | 423801 |
| 3D成像 | 钙黄绿素/碘化丙啶染色试剂 | Beyotime | C2015M |
| 流式细胞术 | Zombie NIR™可固定活力染料试剂盒 | -- | -- |
| LSR Fortessa流式细胞仪 | BD | -- | |
| FlowJo软件 | -- | v.10.6.1 | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara | RR047A |
| SYBR Green预混液 | Vazyme | Q411-02 | |
| 免疫荧光 | 肌动蛋白绿色荧光探针 | Beyotime | C2201S |
| DAPI染色液 | Solarbio | C0060 | |
| 动物实验 | JK184 | -- | -- |
| 小鼠抗PD1抗体 | BioXcell | BE0146 | |
| 小鼠抗CTLA4抗体 | BioXcell | BE0131 | |
| 同型对照抗体 | BioXcell | BE0089 | |
| IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C4-BIOC | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | 10104159001 | |
| 70微米细胞筛网 | BD Falcon | -- | |
| 数据采集 | CLARIOstar酶标仪 | BMG LABTECH | -- |
| 动物成像 | IVIS小动物活体成像系统 | Caliper Life Sciences | -- |
| 显微成像 | 共聚焦显微镜 | Zeiss 880 | -- |
| 共聚焦显微镜 | Olympus IXplore SpinSR | -- | |
| 荧光显微镜 | Olympus DP80 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小分子药物筛选 | 细胞系MDA-MB-231-FFluc,B7-H3 CAR T细胞;化合物库(624种)浓度1 μM;处理时间48小时(肿瘤细胞)或24小时(CAR T细胞) 阅读提示:Methods 'Screening and viability assays',Fig. 1A legend |
| 体外抗肿瘤活性 | MDA-MB-231和HCT116;药物浓度(IC50值);处理时间24小时;共培养比例(E:T=1:1) 阅读提示:Methods 'Cytotoxicity assays'、'Cell proliferation assay',Fig. 2 legend |
| RNA-seq分析 | 细胞系MDA-MB-231和T细胞;药物浓度1 μM;处理时间24小时;生物学重复数 阅读提示:Methods 'RNA-sequencing analysis',图3和图4的图注 |
| 体内异种移植模型 | M-NSG小鼠;肿瘤细胞系MDA-MB-231-FFluc、HCT116-FFluc;注射细胞数2×10^6;CAR T细胞剂量1×10^7;JK184剂量5 mg/kg;给药方案 阅读提示:Methods 'In vivo treatments',图5 legend |
| 免疫活性小鼠模型 | C57BL/6和BALB/c小鼠;肿瘤细胞系MC38和4T1;接种细胞数1×10^5;JK184剂量5 mg/kg;ICB抗体剂量100 μg;给药方案;肿瘤测量方法 阅读提示:Methods 'In vivo treatments',图6和图7 legend |