临床样本收集与分组
评估内异症患者和对照组中T-cadherin的表达情况
收集40例内异症患者的在位和异位子宫内膜组织及24例对照患者的正常子宫内膜组织,通过IHC和Western blot检测T-cadherin表达。
T-cadherin inhibits invasion and migration of endometrial stromal cells in endometriosis
包含患者样本比较(40例内异症与24例对照)和细胞功能验证(过表达后transwell侵袭迁移实验),并涉及下游信号通路验证(磷酸化抗体芯片和蛋白质印迹),证据层级至少有两个。
子宫内膜基质细胞(原代) 患者子宫内膜组织样本(正常、在位、异位)
T-cadherin表达载体pCMV3-CDH13及空载体转染效率 子宫内膜基质细胞分离纯度和细胞系来源 transwell迁移和侵袭实验的细胞接种数(迁移2×10^5,侵袭5×10^5)及培养时间(24小时) Western blot检测蛋白表达的抗体浓度和时间点(24和48小时) 磷酸化抗体芯片及后续Western blot验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估内异症患者和对照组中T-cadherin的表达情况
收集40例内异症患者的在位和异位子宫内膜组织及24例对照患者的正常子宫内膜组织,通过IHC和Western blot检测T-cadherin表达。
获取高纯度的原代子宫内膜基质细胞用于后续功能实验
采用胶原酶消化和过滤法分离基质细胞,通过流式细胞术和免疫细胞化学鉴定细胞纯度。
在基质细胞中过表达T-cadherin并验证转染效率
将pCMV3-CDH13表达载体或空载体转染至正常对照和子宫内膜异位症在位基质细胞,转染后24小时收集蛋白,Western blot确认过表达。
评估T-cadherin过表达对基质细胞侵袭和迁移能力的影响
采用transwell小室进行迁移和侵袭实验,在转染后24小时细胞接种于上室,培养24小时后计数迁移或侵袭的细胞。
检测T-cadherin过表达对MMP2、MMP9和vimentin蛋白表达的影响
通过Western blot检测转染后24小时和48小时细胞中MMP2、MMP9和vimentin的表达水平。
鉴定T-cadherin过表达影响的信号通路蛋白磷酸化变化
使用Proteome Profiler Human Phospho-Kinase Array Kit检测磷酸化蛋白谱,并通过Western blot验证HSP27和JNK的磷酸化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离和培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco | -- |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 胎牛血清 | Bovogen | SFBS | |
| 胶原酶I | Sigma-Aldrich | C2674 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶/EDTA | -- | -- | |
| 细胞鉴定 | 抗EpCAM抗体 | abcam | ab112068 |
| 抗CD13抗体 | BD Biosciences | 557454 | |
| 抗波形蛋白抗体 | ProteinTech | 10366-1-AP | |
| 抗细胞角蛋白18抗体 | ProteinTech | 66187-1-Ig | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 蛋白质印迹封闭液 | Beyotime | P0023B | |
| 抗T-钙黏蛋白抗体 | Abgent | -- | |
| 抗MMP2抗体 | Abgent | AM1844b | |
| 抗MMP9抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-16851 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Cell Signal Technology | 3932S | |
| 抗HSP27抗体 | ProteinTech | 66767-1-Ig | |
| 抗磷酸化HSP27抗体 | Beyotime | AF2197 | |
| 抗JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252S | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 4668S | |
| 抗GAPDH抗体 | Abgent | -- | |
| HRP偶联抗小鼠二抗 | R&D Systems | HAF007 | |
| HRP偶联抗兔二抗 | R&D Systems | HAF008 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Merck Millipore | WBKLS0500 | |
| Bio-Rad Molecular Imager ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫组织化学 | 柠檬酸钠缓冲液 | -- | -- |
| 抗体稀释液 | GeneTech | GT100910 | |
| 抗T-钙黏蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | PRS3583 | |
| Dako REAL EnVision HRP兔/鼠二抗 | Dako | K5007 | |
| DAB底物 | Dako | K5007 | |
| Leica DM4 B显微镜 | Leica | -- | |
| 转染 | pCMV3-CDH13表达载体 | Sino Biological | HG11249-UT |
| pCMV3-untagged-NCV空载体 | Sino Biological | CV011 | |
| Qiagen转染试剂 | Qiagen | 301427 | |
| 迁移和侵袭实验 | BD BioCoat Matrigel侵袭小室 | Becton Dickinson | -- |
| 基质胶 | R&D Systems | -- | |
| 结晶紫 | Solarbio | G1062 | |
| Leica DMi8显微镜 | Leica | -- | |
| 磷酸化芯片分析 | Proteome Profiler人磷酸化激酶芯片试剂盒 | R&D Systems | ARY003B |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者年龄、分期、病灶大小、粘连情况;样本来源(正常、在位、异位);对照组疾病类型 阅读提示:Table I;Patients and tissue sample collection 部分 |
| 细胞分离培养 | 胶原酶浓度和消化时间(1 mg/mL,30分钟);过滤网孔径(100目和40目);细胞纯度验证方法 阅读提示:Cell isolation and culture 部分 |
| 转染 | 质粒名称和来源(pCMV3-CDH13 vs 空载体);转染试剂;转染后时间点(6小时换液,24小时收样) 阅读提示:Transfection experiments 部分 |
| 迁移和侵袭实验 | 细胞接种数(迁移2×10^5,侵袭5×10^5);小室孔径(8 μm);基质胶用量(10 μL);培养时间(24小时);计数方法(每膜5视野,重复2次) 阅读提示:Measurement of migration and invasion 部分 |
| Western blot | 抗体稀释度(如anti-T-cadherin 1:1000)、内参(GAPDH);样品收集时间点(24和48小时) 阅读提示:Western blotting 部分;Figure 5 图注 |
| 磷酸化芯片分析 | 蛋白上样量(200 μg);试剂盒型号(ARY003B);验证用样本数(至少3例) 阅读提示:Phosphorylation antibody array assay 部分 |