确定Axl缺失对JEV感染结局的影响
验证Axl是否影响小鼠对JEV感染的易感性和死亡率。
对4周龄Axl−/−和Axl+/−小鼠腹腔注射不同剂量JEV(104、105、106 PFU),观察生存率和体重变化。
Axl Deficiency Promotes the Neuroinvasion of Japanese Encephalitis Virus by Enhancing IL-1α Production from Pyroptotic Macrophages.
包括小鼠生存实验、病毒载量检测、荧光素酶成像、EB渗漏和NaF渗漏评估BBB通透性、免疫荧光和免疫印迹检测紧密连接蛋白及焦亡标志物、RNA-seq转录组分析、细胞因子分析、IL-1α/IL-6处理、IL-1Ra处理等。
Axl基因敲除小鼠(C57BL/6J背景) 腹膜巨噬细胞(原位和体外培养) bEND.3小鼠脑微血管内皮细胞 BALB/c野生型小鼠
Axl −/− 与 Axl +/− 小鼠的遗传背景一致性(同窝对照) JEV感染剂量(104、105、106 PFU)及给药途径(腹腔注射) 血清IL-1α水平升高与BBB通透性及脑内病毒载量的相关性 巨噬细胞焦亡比例(GSDMD-N+)在JEV感染后24hpi的测定 IL-1α拮抗剂(IL-1Ra)的治疗方案(剂量和时间点)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Axl是否影响小鼠对JEV感染的易感性和死亡率。
对4周龄Axl−/−和Axl+/−小鼠腹腔注射不同剂量JEV(104、105、106 PFU),观察生存率和体重变化。
确定Axl缺失是否影响病毒复制或神经侵袭。
通过qRT-PCR检测血清、脾、肝、肾和脑中的病毒RNA;使用Rluc-JEV进行生物发光成像监测病毒传播。
确定Axl缺失是否影响BBB完整性。
使用Evans blue渗漏、NaF渗漏和IgG渗漏实验评估BBB通透性,并检测紧密连接蛋白claudin-5、occludin和ZO-1的表达和分布。
寻找介导BBB损伤的细胞因子。
在1和7 dpi检测血清中IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-4、IL-6、IL-10、TNF-α、IFN-γ、CCL2和CCL5水平,并验证IL-1α和IL-6的作用。
确定IL-1α的来源及Axl缺失对巨噬细胞死亡的影响。
从JEV感染小鼠分离原位腹膜巨噬细胞,进行RNA-seq、免疫荧光、Western blot和细胞死亡分析。
评估IL-1Ra是否能预防JE。
Axl−/−和BALB/c小鼠在JEV感染前1小时给予IL-1Ra,然后每两天给药一次,监测生存率、体重、症状评分和脑病理变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | PAN | -- | |
| MEM培养基 | Gibco | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 病毒扩增和滴定 | C6/36细胞(白纹伊蚊幼虫细胞) | -- | -- |
| Vero细胞(非洲绿猴肾细胞) | -- | -- | |
| 免疫荧光染色 | 抗NeuN抗体 | Abcam | ab104224 |
| 抗GFAP抗体 | Abcam | ab7260 | |
| 抗Iba1抗体 | Proteintech | 10904-1-AP | |
| 抗CD31抗体 | Abcam | ab9498 | |
| 抗claudin-5抗体 | Affinity Biosciences | AF0130 | |
| 抗occludin抗体 | Thermo | 71-1500 | |
| 抗ZO-1抗体 | Thermo | 61-7300 | |
| 抗F4/80抗体 | Abcam | ab100790 | |
| 抗IL-1α抗体 | Affinity Biosciences | DF6893 | |
| 抗GSDMD-N抗体 | Affinity Biosciences | AF4013 | |
| 抗RIPK1抗体 | Affinity Biosciences | AF7377 | |
| 抗caspase-8抗体 | Abcam | ab227430 | |
| 抗caspase-9抗体 | Abcam | ab202068 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664S | |
| 抗PI3K-p110抗体 | Affinity Biosciences | AF5112 | |
| 抗pAkt抗体 | Affinity Biosciences | AF0016 | |
| Alexa Fluor 488标记的驴抗小鼠IgG | Thermo | A21202 | |
| Alexa Fluor 594标记的驴抗兔IgG | Thermo | A21207 | |
| RNA提取 | EasyPure病毒DNA/RNA提取试剂盒 | TransGen | ER201-01 |
| TransZol试剂 | TransGen | ET101-01 | |
| qRT-PCR | FAM-TAMRA探针 | -- | -- |
| 细胞分离 | 小鼠淋巴细胞分离液 | Dakewe | DKW33R0100 |
| 生物发光成像 | ViviRen底物 | Promega | P1232 |
| BBB通透性评估 | 伊文思蓝 | Macklin | E808783 |
| 荧光素钠 | -- | -- | |
| 细胞因子检测 | Aimplex多重免疫分析 | Beijing Quantobio | -- |
| IL-1α ELISA试剂盒 | Raybiotech | ELM-IL1a | |
| 药物处理 | R428 | Cayman Chemical | 21523 |
| LY294002 | MCE | HY-10108 | |
| 重组小鼠IL-1α | Sino Biological | 50114-MNAE | |
| 重组小鼠IL-6 | Sino Biological | 50136-MNAE | |
| 重组大鼠IL-1Ra | Sino Biological | 80073-R01H | |
| 细胞凋亡检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1086 |
| 蛋白质印迹 | 细胞裂解缓冲液 | Cell Signaling Technology | 9803S |
| SDS上样缓冲液 | Beyotime | P0015 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物感染模型 | 小鼠品系、年龄、性别、感染方式、病毒株、剂量、体积 阅读提示:Materials and Methods - Mice, Animal infection |
| 病毒载量检测 | 组织类型、采样时间、RNA提取方法、qRT-PCR引物和探针 阅读提示:Materials and Methods - RNA extraction, Quantitative real-time PCR |
| BBB通透性评估 | EB浓度、注射体积、血液循环时间、灌注方法、NaF注射剂量和检测方法 阅读提示:Materials and Methods - BBB permeability evaluation |
| 细胞因子分析 | 血清采集时间、检测方法、细胞因子种类 阅读提示:Materials and Methods - Multiplex immunoassays and enzyme-linked immunosorbent assay |
| 巨噬细胞死亡分析 | 原位巨噬细胞分离时间、染色方法(TB、TUNEL、GSDMD-N)、细胞计数方法 阅读提示:Materials and Methods - Trypan blue staining, TUNEL staining, IF staining |
| PI3K抑制实验 | LY294002剂量、给药时间、给药途径 阅读提示:Materials and Methods - Drug administration |
| IL-1Ra治疗实验 | IL-1Ra剂量、给药时间、给药频率、JEV挑战剂量 阅读提示:Materials and Methods - Drug administration |