鉴定 ICAM1high 肿瘤浸润中性粒细胞亚群
确定肿瘤微环境中区别于其他组织中性粒细胞的独特中性粒细胞亚群。
分析泛癌中性粒细胞 scRNA-seq 图谱,结合多个癌症单细胞数据及流式验证,鉴定出高表达 ICAM1 的中性粒细胞亚群,并比较肿瘤、血液及正常邻近组织中的比例。
ICAM1high Neutrophils Sculpt Tumor Evolution and Metastasis Through Symbiotic Adhesion and Reverse Migration
研究包含体外共培养、体内小鼠模型、空间转录组、组织微阵列及患者来源异种移植等多个独立证据层级,并通过基因敲除、功能阻断抗体等明确功能验证。
小鼠三阴性乳腺癌细胞系(PyMT-N、2208L 等) 小鼠原位移植瘤模型(Balb/c 和 C57/B6) 患者来源异种移植(PDX)模型 人三阴性乳腺癌组织微阵列及空间转录组样本
中性粒细胞与癌细胞共培养比例及时间(5:1,72小时) EMT 诱导条件(SNAIL1/TWIST1 或 mir200c) ICAM1 敲除小鼠品系 中性粒细胞耗竭及过继转移方案 患者样本种族/民族分组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定肿瘤微环境中区别于其他组织中性粒细胞的独特中性粒细胞亚群。
分析泛癌中性粒细胞 scRNA-seq 图谱,结合多个癌症单细胞数据及流式验证,鉴定出高表达 ICAM1 的中性粒细胞亚群,并比较肿瘤、血液及正常邻近组织中的比例。
探究中性粒细胞对不同上皮/间充质状态癌细胞的影响是否不同及其接触依赖性。
将骨髓中性粒细胞与一组具有不同 EMT 状态的鼠 TNBC 细胞系共培养,检测细胞活力和中性粒细胞存活,并通过 Transwell 分离实验验证接触依赖;在体内通过过继转移实验检验中性粒细胞在不同肿瘤中的滞留。
检验中性粒细胞与上皮样癌细胞之间的共生关系是否影响肿瘤内癌细胞克隆演变及中性粒细胞空间分布。
建立混合 PyMT-N-RFP 和 PyMT-M-GFP 细胞的移植瘤模型,并分别进行中性粒细胞耗竭或过继转移,分析两种癌细胞比例变化;通过免疫荧光染色观察中性粒细胞在肿瘤不同区域的分布及其与增殖/凋亡细胞的关系。
验证改变癌细胞的上皮/间充质状态是否足以影响其与中性粒细胞的共生关系。
在 T11 细胞中诱导表达 mir200c 进行 MET,在 PyMT-N/2208L 细胞中诱导表达 SNAIL1 或 TWIST1 进行 EMT,随后与中性粒细胞共培养检测细胞活力和黏附变化。
识别中性粒细胞和上皮样癌细胞之间互惠作用的分子基础。
通过文献分析及转录组数据,在癌细胞中筛选 EMT 调控的黏附分子和弹性蛋白酶抑制因子。通过基因敲低和功能阻断实验验证 F11R 和 SLPI 的作用。
探究 ICAM1high 中性粒细胞是否具有反向跨内皮迁移的能力并介导肿瘤细胞内渗。
利用 Transwell 实验模拟内皮屏障,分别模拟内渗和外渗条件,检测肿瘤细胞在有无中性粒细胞存在下的迁移能力;并通过 sortase A 邻近标记实验追踪与肿瘤细胞接触后的中性粒细胞回到外周血的情况。
确定 ICAM1high 中性粒细胞是否能在体内促进原发性肿瘤的转移。
在鼠 TNBC 模型中,通过瘤内注射 ICAM1high 或 ICAM1low 中性粒细胞、全身过继转移野生型或 ICAM1 KO 中性粒细胞,并配合中性粒细胞耗竭,通过生物发光成像评估肺转移。
验证 ICAM1high 中性粒细胞与肿瘤细胞相互作用及促进内渗的机制在人类 TNBC 中是否存在,并检查潜在的种族差异。
分析空间转录组数据,检查肿瘤细胞、中性粒细胞和内皮细胞共定位及关键基因表达;使用组织微阵列进行多重免疫荧光染色分析;将来源于不同种族患者的 PDX 癌细胞与匹配种族的健康供者中性粒细胞共培养,检测癌细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | -- | ThermoFisher Cat#11-140-050 |
| RPMI-1640培养基 | -- | ThermoFisher Cat#11-140-050 | |
| 青霉素-链霉素-抗真菌剂 | Corning | Cat#30-00-CI | |
| PDX培养 | Advanced DMEM/F12培养基 | ThermoFisher | Cat#12634010 |
| 胶原酶II | ThermoFisher | Cat#17101015 | |
| ROCK抑制剂(Y-27632) | MedChemExpress | Cat#Hy-10583 | |
| GlutaMAX添加剂 | ThermoFisher | Cat#35050061 | |
| HEPES缓冲液 | Cytiva | Cat#SH30237.01 | |
| 红细胞裂解液 | Tonbo Biosciences | Cat#TNB-4300 | |
| 基底膜提取物 | R&D Systems | Cat#3433-005-01P | |
| B27添加剂 | ThermoFisher | Cat#17504044 | |
| 烟酰胺 | ThermoFisher | 128271000 | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | RPI | A10040 | |
| Primocin杀菌剂 | Invivogen | ant-pm-05 | |
| 氢化可的松 | ThermoFisher | A1629203 | |
| 调蛋白B1 | Sino Biological | 11609-HNCH | |
| 成纤维细胞生长因子-7 | Sino Biological | 10210-H07E | |
| 成纤维细胞生长因子-10 | Sino Biological | 10573-HNAE | |
| A83-01 | MedChemExpress | HY-10432 | |
| 表皮生长因子 | Novus Biologicals | NBP2-34952 | |
| SB202190 | MedChemExpress | HY-10295 | |
| 质粒构建 | NEBuilder HiFi DNA组装预混液 | New England Biolabs | E2621 |
| 慢病毒生产 | X-tremeGENE HP DNA转染试剂 | MilliporeSigma | 6366244001 |
| 慢病毒感染 | 聚凝胺 | MilliporeSigma | TR-1003 |
| 肿瘤模型建立 | 生长因子减少的Matrigel基质胶 | Corning | 356231 |
| 中性粒细胞分离 | 小鼠中性粒细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-097-658 |
| 分散酶II | MilliporeSigma | D4693 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | MilliporeSigma | DN25 | |
| 碎片去除液 | Miltenyi | 130-109-398 | |
| Fc受体阻断剂 | Tonbo Biosciences | 70-0161 | |
| 流式分析 | 抗CD45-VF450抗体 | Tonbo Biosciences | 75-0451 |
| 抗CD11b-APC抗体 | Tonbo Biosciences | 20-0112 | |
| 抗Ly6G-FITC抗体 | Tonbo Biosciences | 35-1276 | |
| 抗Ly6C-PECF594抗体 | BD Biosciences | 562728 | |
| 抗ICAM1-PECy7抗体 | Biolegend | 116122 | |
| DAPI染料 | ThermoFisher | R37606 | |
| Ghost Dye活性染料 | Tonbo Biosciences | 13-0868 | |
| 计数微球 | BD Biosciences | 335925 | |
| 抗CD45.1-PECy7抗体 | Tonbo Biosciences | 60-0453 | |
| 抗CD45.2-VF450抗体 | Tonbo Biosciences | 75-0454 | |
| 抗CD45-VF450抗体(人) | Tonbo Biosciences | 75-0459 | |
| 抗CD66b-FITC抗体 | Biolegend | 305104 | |
| 抗CD15-PerCPCy5.5抗体 | Biolegend | 323020 | |
| T细胞增殖实验 | CFSE染料 | ThermoFisher | 34554 |
| 重组小鼠IL-2 | -- | -- | |
| 抗小鼠CD3e抗体 | ThermoFisher | 16-0031-85 | |
| 抗小鼠CD28抗体 | Tonbo Biosciences | 40-0281 | |
| 跨内皮迁移实验 | 人脐静脉内皮细胞 | -- | -- |
| 免疫荧光染色 | 抗原修复液pH 9 | Agilent | S236784-2 |
| 抗原修复液pH 6 | Agilent | S236984-2 | |
| 正常驴血清 | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | |
| 鱼明胶 | MilliporeSigma | G7765 | |
| Triton X-100去污剂 | MilliporeSigma | 93443 | |
| Hoechst 33342染料 | ThermoFisher | 62249 | |
| ProLong Gold抗淬灭封片剂 | ThermoFisher | P36934 | |
| 免疫印迹 | NuPAGE Novex凝胶电泳系统 | ThermoFisher | -- |
| iBlot转印系统 | ThermoFisher | -- | |
| 脱脂奶粉 | Bio-Rad | 1706404 | |
| Odyssey红外成像系统 | LI-COR Biotech | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Micro RNA提取试剂盒 | Qiagen | 74004 |
| RNA定量 | QIAseq FX单细胞RNA文库构建试剂盒 | Qiagen | 180735 |
| RT-qPCR | PowerUp SYBR Green预混液 | ThermoFisher | A25742 |
| CFX实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 成像质谱流式 | 铱DNA嵌入剂 | -- | -- |
| Hyperion组织成像系统 | Standard BioTools | -- | |
| RNA测序 | Illumina mRNA测序文库构建试剂盒 | ABClonal | 20302 |
| 循环肿瘤细胞分离 | 小鼠肿瘤细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-110-187 |
| 体内成像 | D-荧光素 | Goldbio | LUCK-100 |
| IVIS Lumina活体成像系统 | Revvity | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系与培养 | 细胞系来源、培养基及添加物 阅读提示:Methods - Cell lines and cell culture |
| 中性粒细胞分离 | 中性粒细胞分离方法和纯度 阅读提示:Methods - Neutrophil isolation from bone marrow, primary tumors and human blood |
| 体外共培养实验 | 共培养比例、时间、血清浓度 阅读提示:Methods - Co-culture experiment |
| 跨内皮迁移实验 | Transwell 孔径、HUVEC 和基质胶处理顺序 阅读提示:Methods - Transendothelial migration assay |
| 体内肿瘤模型 | 小鼠品系、细胞接种数量、Matrigel 比例 阅读提示:Methods - Tumor model establishment and treatment |
| 中性粒细胞耗竭与过继转移 | 抗体克隆、剂量、给药时间、中性粒细胞数量 阅读提示:Methods - Neutrophil depletion and adoptive transfer |
| 流式细胞术 | 抗体克隆、荧光素标记、门控策略 阅读提示:Methods - Flow cytometry |