患者临床与遗传学特征鉴定
识别导致中心核肌病的遗传变异。
对家系进行全外显子组测序,发现NOTCH2 c.5065A>T (p.I1689F)错义突变,并通过Sanger测序验证。
Understanding the role of NOTCH2 mutation in centronuclear myopathy
包含患者样本、同源突变小鼠模型和体外细胞实验,并进行了功能验证(增殖、分化)和机制验证(N2ICD、Hey1、回补实验)
同源Notch2 p.I1691F突变小鼠 患者骨骼肌样本 小鼠原代肌源性祖细胞 单根肌纤维
NOTCH2突变位点:p.I1689F(c.5065A>T) 小鼠品系:Notch2 p.I1691F敲入突变小鼠 肌肉损伤模型:CTX注射剂量50 μL,浓度未明确说明 分析时间点:2、5、15、30 dpi 定量数据:CSA、Pax7+细胞数量、融合指数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别导致中心核肌病的遗传变异。
对家系进行全外显子组测序,发现NOTCH2 c.5065A>T (p.I1689F)错义突变,并通过Sanger测序验证。
评估Notch2突变在体内对骨骼肌发育和再生的影响。
生成Notch2 p.I1691F敲入小鼠,分析其在稳态和CTX诱导损伤后的肌肉表型。
验证Notch2突变对Pax7+肌源性祖细胞增殖和分化的直接影响。
分离单根肌纤维和Pax7+细胞,进行EdU标记、生长曲线、分化诱导和融合指数分析。
阐明Notch2突变导致功能丧失的分子机制。
通过RNA-seq和RT-qPCR分析基因表达,Western blot检测N2ICD、Hey1等蛋白水平,并进行N2ICD回补实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 肌肉损伤实验 | 心脏毒素类似物IV | MedChemExpress | HY-P1902 |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | EpiZyme Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗Notch2抗体 | ABclonal | A0560 | |
| 抗Hes1抗体 | HuaBio | SC06-21 | |
| 抗HEY1抗体 | Bioss | bs-16500R | |
| 抗PAX7抗体 | Bioss | bs-22741R | |
| 抗MyoD抗体 | Bioss | bs-23809R | |
| 抗MyoG抗体 | Abcam | ab1835 | |
| 抗Fast MyHC抗体 | Bioss | bs-5885R | |
| 抗Myh3抗体 | DSHB | F1.652 | |
| 抗细胞周期蛋白D抗体 | Affinity | DF6386 | |
| 抗PCNA抗体 | Cell Signaling Technology | 13110 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Abcam | ab52866 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara | -- | |
| TB Green Premix Taq II | Takara | -- | |
| Light Cycler 480 实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 免疫荧光 | 抗Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 |
| iFluor 555标记麦胚凝集素偶联物 | ATT Bioquest | 25539 | |
| Alexa Fluor 488标记山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A-11029 | |
| Alexa Fluor 546标记山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-11035 | |
| 含DAPI的封片剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| RNA-seq | VAHTS链特异性mRNA-seq文库制备试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| Qsep100分析仪 | Bioptic | -- | |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 体外EdU标记 | 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | Abcam | ab219801 |
| 组织学 | 奥林巴斯智能显微镜BX63 | Olympus | -- |
| 数据分析 | GraphPad Prism 10 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:Notch2 p.I1691F敲入小鼠;遗传背景:C57BL/6J;饲养环境为SPF级 阅读提示:Materials and methods, Animals |
| 肌肉损伤模型 | CTX剂量:50 μL;注射部位:TA肌肉;分析时间点:2、5、15、30 dpi 阅读提示:Materials and methods, Muscle regeneration assay with CTX injury |
| 细胞分离与培养 | 单根肌纤维分离:使用胶原酶I(400 U/mL),消化时间1 h;Pax7+细胞分离:使用胶原酶II(0.1 mg/mL),消化时间1 h 阅读提示:Materials and methods, Single myofiber isolation and culture; Isolation and culture of mouse muscle satellite cells |
| 免疫印迹 | 抗体:anti-Notch2 (1:1000)、anti-Hey1 (1:1000)、anti-MyoD (1:1000)、anti-MyoG (1:1000)等;蛋白上样量:文中未明确说明 阅读提示:Materials and methods, Immunoblotting analysis |
| RT-qPCR | 内参基因:Gapdh;cDNA合成:使用1,000 ng总RNA 阅读提示:Materials and methods, Quantitative reverse transcription PCR |
| 组织学分析 | 切片厚度:5 μm;固定:10%福尔马林;图像分析软件:FIJI(MyoSight插件) 阅读提示:Materials and methods, Histology and myofiber CSA analysis |