构建AAV9肽展示文库并进行体内定向进化筛选
筛选能够高效穿越血脑屏障并转导中枢神经系统的AAV9变体
通过TRACER平台在AAV9衣壳表面插入随机6氨基酸肽段,构建约4E7变体的文库,经两轮体内筛选(食蟹猴和小鼠)后富集出高脑向性变体VCAP-101和VCAP-102
Highly conserved brain vascular receptor ALPL mediates transport of engineered AAV vectors across the blood-brain barrier
包含体外细胞模型(HEK293T、HeLa、MDCK)和体内模型(小鼠、非人灵长类),以及SPR、Transwell等功能与机制验证。
BALB/c小鼠 C57BL/6J小鼠 食蟹猴 非洲绿猴 狨猴 MDCK细胞 HEK293T细胞 HeLa细胞
VCAP-102经静脉给药后在小鼠和非人灵长类中均可高效转导CNS ALPL为VCAP-102穿越血脑屏障的关键受体,过表达ALPL增强转导约100倍 SPR显示VCAP-102与ALPL结合亲和力约为20 nM,且pH 5.5时快速解离 ALPL抑制剂SBI-425处理降低VCAP-102的脑转导(2.5至4.1倍)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选能够高效穿越血脑屏障并转导中枢神经系统的AAV9变体
通过TRACER平台在AAV9衣壳表面插入随机6氨基酸肽段,构建约4E7变体的文库,经两轮体内筛选(食蟹猴和小鼠)后富集出高脑向性变体VCAP-101和VCAP-102
评估VCAP-102在小鼠中的脑转导效率、细胞嗜性和剂量响应
将携带报告基因的VCAP-102经静脉注射入BALB/c或C57BL/6J小鼠,通过免疫组化、qPCR和免疫荧光分析不同脑区和肝脏的转导
评估VCAP-102在非洲绿猴和狨猴中的转导效率和组织分布
将携带报告基因的VCAP-102经静脉注射入非洲绿猴或狨猴,通过免疫组化、ddPCR和RT-qPCR分析脑区和外周组织的转导
确定VCAP-102穿越血脑屏障所用的人血管受体
利用Retrogenix细胞微阵列和人类ORFeome文库筛选相互作用的蛋白,通过过表达实验、siRNA敲低、SPR结合和竞争抑制实验验证ALPL的功能
验证ALPL是否足以介导VCAP-102穿过极化细胞屏障
在Transwell系统中培养MDCK或稳定表达人ALPL的MDCK细胞,测量VCAP-102从顶端到底端的迁移量
探究体内ALPL表达水平是否影响VCAP-102的脑转导
比较年轻和年迈小鼠中VCAP-102的转导,并用ALPL抑制剂SBI-425处理小鼠或细胞,观察对转导的影响
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | FreeStyle F17表达培养基 | Gibco | -- |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | -- | |
| Pluronic F-68表面活性剂 | Gibco | -- | |
| 病毒生产 | pAdDeltaF6腺病毒辅助质粒 | -- | -- |
| REP质粒 | -- | -- | |
| Triton X-100 | Thermo Scientific | -- | |
| 碘克沙醇 | -- | -- | |
| Sartorius Vivaspin 100K PES超滤管 | Sartorius | -- | |
| 病毒定量 | QuantStudio 3D数字PCR系统 | Bio-Rad | -- |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Corning | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| Eagle最低必需培养基 | ATCC | -- | |
| 嘌呤霉素 | Mirus Bio | -- | |
| 转染与转导 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 小干扰RNA | Ambion | -- | |
| ONE-Glo EX荧光素酶检测系统 | Promega | -- | |
| Synergy NEO2多功能酶标仪 | BioTek | -- | |
| ALPL抑制实验 | SBI-425(ALPL抑制剂) | Millipore Sigma | -- |
| Akalumine-HCl(荧光素酶底物) | Sigma | -- | |
| 体内成像 | AmiHT成像仪 | Spectral Instruments | -- |
| 免疫组织化学 | 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724S |
| 抗Sox9抗体 | Abcam | ab185966 | |
| 抗NeuN抗体 | Abcam | ab177487 | |
| 抗Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 92013S | |
| 抗ALPL抗体 | Invitrogen | MA5-17030 | |
| 抗SMI311抗体 | BioLegend | 837801 | |
| 抗GFAP抗体 | Cell Signaling Technology | 3656S | |
| Opal 520荧光染料 | Akoya Biosciences | -- | |
| Opal 620荧光染料 | Akoya Biosciences | -- | |
| 分子生物学 | RNeasy试剂盒 | QIAGEN | -- |
| Quantitect试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| TRIzol试剂 | -- | -- | |
| Oligotex磁珠 | QIAGEN | -- | |
| EZ-DNase | Life Technologies | -- | |
| Superscript IV第一链合成试剂盒 | Life Technologies | -- | |
| Q5热启动高保真2X预混液 | NEB | -- | |
| Blood and Tissue DNeasy试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| Quantigene裂解液 | Thermo Fisher | QP0523 | |
| 蛋白酶K | Thermo Fisher | QG0517 | |
| Geno-Grinder研磨仪 | SPEX Sample Prep | -- | |
| DNase I | Sigma-Aldrich | AMPD1-1KT | |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher | 4368813 | |
| Bio-Rad CFX384实时PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| QX200微滴数字PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白互作分析 | Biacore 8K表面等离子体共振仪 | Cytiva | -- |
| CM5传感芯片 | Cytiva | 29149603 | |
| His标签的人ALPL重组蛋白 | Sino Biological | 10440-H08H | |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | 3495 |
| EVOM上皮电压电阻仪 | -- | -- | |
| TNAPi(ALPL抑制剂) | EMD Millipore | 613810 | |
| 抗AAV9抗体 | Thermo Fisher | 7103332100 | |
| 蛋白处理 | 磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C | Invitrogen | P6466 |
| 神经氨酸酶 | Sigma | N7885 | |
| 测序 | Illumina Nextseq500测序仪 | Illumina | -- |
| 结构分析 | Glacios冷冻透射电子显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Falcon 4直接电子探测器 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Leginon软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系、年龄、剂量、注射途径 阅读提示:动物与饲养、体内表征部分 |
| 体外转导实验 | MOI、细胞系、转染方法 阅读提示:细胞与表达质粒、转染、siRNA、转导实验部分 |
| SPR结合实验 | 芯片类型、固定/分析物浓度、pH条件 阅读提示:表面等离子体共振部分 |
| Transwell转胞吞实验 | 细胞系(MDCK/ALPL)、培养时间、检测时间 阅读提示:Transwell实验部分 |
| ALPL抑制实验 | SBI-425浓度、处理时间 阅读提示:ALPL抑制实验部分 |