在转基因小鼠中通过胞嘧啶碱基编辑LPA可避免大片段缺失

脂蛋白(a)（Lp(a)）是一种遗传决定的因果性心血管疾病风险因素，大约20%的人群表现出升高的水平。虽然有前景的药物正在开发中，但目前尚无专门设计用于降低Lp(a)水平的获批疗法。对于Lp(a)水平极高的高危个体，肝脏定向的基因组编辑可能是一种有效的一次性解决方案。CRISPR和TALEN等基因组编辑方法可以降低LPA转基因小鼠模型中的Lp(a)，但它们常常诱导大型且可能有害的基因组缺失。在此，我们报告了首次应用TadA衍生的胞嘧啶碱基编辑（CBE），通过辅助依赖性腺病毒（HDAdV）和腺相关病毒（AAV）载体递送，在LPA中引入提前终止密码子。该策略在LPA转基因小鼠中产生了循环载脂蛋白(a)（apo(a)）的稳健且持久的降低。使用带有单分子独特分子标识符（UMI）的SMRT-seq，我们量化了缺失事件，发现CBE在靶向单个LPA位点时不诱导大片段缺失，并且在跨多个位点编辑时仅产生一小部分（<4%）的大片段缺失。相反，CRISPR/Cas9切割LPA主要导致大片段缺失。这些发现表明，CBE能够在LPA转基因小鼠模型中持续降低循环载脂蛋白(a)水平，同时在很大程度上保持基因组完整性。