验证LRG1缺失对糖尿病肾病表型的影响
评估LRG1缺失是否减轻OVE26糖尿病小鼠的肾损伤
将Lrg1−/−小鼠与OVE26小鼠杂交产生Lrg1−/−;OVE26小鼠,在8-12周龄检测肾重/体重比、24小时尿白蛋白排泄、肾小球面积和系膜基质分数。
LRG1 loss effectively restrains glomerular TGF-β signaling to attenuate diabetic kidney disease
包含单细胞RNA测序、GSEA分析、免疫染色验证、OVE26小鼠模型及功能表型分析,多层级证据支持。
OVE26小鼠(1型糖尿病模型) Lrg1敲除OVE26小鼠 非糖尿病对照小鼠
单细胞RNA测序分析(每种基因型小鼠数量:非糖尿病对照4只,OVE26 2只,Lrg1−/−;OVE26 3只) 免疫染色定量(每组3-4只小鼠,每个肾切片>20个肾小球) 尿液白蛋白排泄(6-12周龄,代谢笼收集24小时尿) 肾小球形态学分析(每只小鼠至少30个肾小球,×400倍镜)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LRG1缺失是否减轻OVE26糖尿病小鼠的肾损伤
将Lrg1−/−小鼠与OVE26小鼠杂交产生Lrg1−/−;OVE26小鼠,在8-12周龄检测肾重/体重比、24小时尿白蛋白排泄、肾小球面积和系膜基质分数。
鉴定肾脏中LRG1表达的细胞类型及糖尿病状态下表达变化
对非糖尿病对照、OVE26和Lrg1−/−;OVE26小鼠肾脏进行scRNA-seq,聚类分析肾细胞类型,检查Lrg1在各类细胞中的表达。
确定LRG1缺失是否逆转糖尿病诱导的GECs基因表达变化
对OVE26与对照GECs的差异表达基因进行分析,识别上调的热休克蛋白等,并进行GO/KEGG通路富集分析;比较Lrg1−/−;OVE26与OVE26 GECs的差异表达基因。
验证LRG1缺失对肾小球细胞TGF-β信号传导的影响
对GECs、系膜细胞和足细胞进行GSEA分析TGF-β通路基因;免疫染色检测p-Smad3和p-Smad1/5。
验证与GECs、系膜细胞相关基因的表达变化
免疫染色检查GPR56、SIRT1和YAP1在肾小球中的表达,并定量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血糖测量 | 罗氏卓越型血糖仪 | Roche | -- |
| 血尿素氮测量 | BUN试剂盒 | Bioassay Systems | -- |
| 尿白蛋白测量 | ELISA试剂盒 | Bethyl Laboratory Inc. | -- |
| 肾组织消化 | II型胶原酶 | Sigma | C6885 |
| 蛋白酶E | Sigma | P6911 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | -- | |
| 细胞计数 | Countess II自动细胞计数器 | Invitrogen | C10227 |
| 单细胞测序 | Chromium单细胞3'试剂盒v.3 | 10x Genomics | -- |
| Illumina NovaSeq测序仪 | Illumina | -- | |
| 免疫染色 | 抗磷酸化Smad3抗体 | Abcam | ab52903 |
| 抗synaptopodin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-515842 | |
| 抗磷酸化Smad1/5抗体 | Cell Signaling Technology | 9516 | |
| 抗GPR56抗体 | Millipore Sigma | MABN310 | |
| 抗SIRT1抗体 | Abcam | ab110304 | |
| 抗YAP1抗体 | Cell Signaling Technology | CST14070 | |
| Vectastain ABC试剂盒 | Vector Laboratories | -- | |
| 图像采集 | AxioVision II显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| 形态计量分析 | Zeiss AX10显微镜 | Carl Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系(FVB/NJ)、基因型(Lrg1−/−;OVE26)、年龄(8-12周)、性别(雄性、雌性)、饲养环境(SPF)、光照周期(12小时) 阅读提示:Methods: Mouse model |
| 代谢监测 | 血糖测量方法(尾静脉血)、血糖仪型号(Accu-Chek Aviva)、测量频率(每两周)、BUN试剂盒(Bioassay Systems) 阅读提示:Methods: Blood glucose and urea nitrogen measurements |
| 尿液分析 | 24小时尿液收集方法(代谢笼)、尿白蛋白检测试剂盒(Bethyl Laboratory Inc.)、收集时间点(6-12周龄) 阅读提示:Methods: Urine albumin and creatinine |
| 肾脏组织学 | 固定液(4%中性缓冲甲醛)、染色方法(PAS)、图像分析软件(ImageJ)、每只小鼠肾小球数量(至少30个)、放大倍数(×400)、盲法分析 阅读提示:Methods: Kidney histology and morphologic analysis; Figure legends |
| 单细胞RNA测序 | 组织消化酶(胶原酶II、蛋白酶E、DNase I)、消化的温度和时间(37°C,15分钟)、细胞活力(>80%)、10x Genomics试剂盒版本(Chromium Single Cell 3' Reagent Kit v.3)、测序平台(Illumina NovaSeq)、细胞筛选标准(基因数200-6000,线粒体基因比例<50%) 阅读提示:Methods: Kidney single-cell preparation and processing; scRNA-seq data processing |
| 免疫染色 | 抗体(抗p-Smad3、抗Synaptopodin、抗p-Smad1/5、抗GPR56、抗SIRT1、抗YAP1)、二抗(Alexa Fluor 488/568或生物素标记)、核染色(DAPI)、封片剂(Aqua PolyMount)、图像定量(每只小鼠至少20个肾小球) 阅读提示:Methods: Immunostaining; Figure legends |
| 统计分析 | 统计方法(单因素或双因素ANOVA、Tukey后检验、Kruskal-Wallis非参数检验、Dunn后检验)、显著性阈值(p<0.05)、软件(GraphPad Prism v.10) 阅读提示:Methods: Statistical analysis |