体外验证α7 nAChR激活对ZIKV感染的影响
检测α7 nAChR激活是否影响ZIKV在多种细胞系中的感染水平。
用GTS-21处理细胞,然后感染ZIKV,通过Western blot和RT-qPCR检测病毒蛋白和基因水平。
Activation of nicotinic acetylcholine receptor α7 subunit limits Zika viral infection via promoting autophagy and ferroptosis
包含体外多种细胞系感染实验、转录组分析、机制验证(基因敲低、Co-IP、泛素化检测)及体内敲除和药物干预小鼠模型。
A549细胞 SH-SY5Y细胞 Vero细胞、C6/36细胞、Bv2细胞、RAW 264.7细胞 新生小鼠ZIKV感染模型
GTS-21处理浓度(50 μM)及处理时间(感染前30分钟) ZIKV感染复数(MOI 0.2)及感染时间(24小时) 基因敲低序列及对应shRNA 小鼠品系(C57BL/6背景,Chrna7−/−)及感染途径(颅内注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测α7 nAChR激活是否影响ZIKV在多种细胞系中的感染水平。
用GTS-21处理细胞,然后感染ZIKV,通过Western blot和RT-qPCR检测病毒蛋白和基因水平。
探索α7 nAChR激活调控的宿主基因和信号通路。
对A549细胞进行RNA-seq,分析4个处理组(PBS-PBS, GTS-PBS, PBS-ZIKV, GTS-ZIKV)的差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析。
确认自噬通路是否参与α7 nAChR介导的抗ZIKV效应。
通过基因敲低(ULK1, LC3A/B, BECN1)和自噬抑制剂处理,检测ZIKV病毒载量变化。
阐明α7 nAChR调节p62表达和定位的分子机制。
检测p62水平及其磷酸化状态,进行Co-IP和泛素化实验,检测p62的核转位。
检验α7 nAChR激活是否诱导铁死亡,并影响ZIKV感染。
检测GSH、MDA、Fe2+水平,分析铁死亡相关基因表达,使用铁死亡抑制剂和诱导剂处理。
确认α7 nAChR在体内对ZIKV感染和疾病严重程度的影响。
使用新生小鼠模型,通过GTS-21给药和Chrna7基因敲除,观察生存率、病毒载量和疾病症状。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | GTS-21 | Abcam | ab120560 |
| MG132 | MedChemExpress | 133407-82-6 | |
| 来普霉素B | InvivoGen | inh-lep | |
| 氯喹 | Sigma-Aldrich | C6628-25G | |
| Importazole | Selleck | S8446 | |
| 雷帕霉素 | Selleck | S1039 | |
| LY294002 | Selleck | S1105 | |
| 铁死亡检测 | FerroOrange | Dojindo | F374 |
| Liperfluo | Dojindo | L248 | |
| 铁死亡诱导 | 1S,3R-RSL 3 | Sigma-Aldrich | SML2234 |
| 铁死亡抑制 | Ferrostatin-1 | Sigma-Aldrich | SML0583 |
| 铁死亡诱导 | Erastin | Sigma-Aldrich | E7781 |
| 凋亡检测 | 细胞凋亡检测试剂盒I | BD Biosciences | 556547 |
| 生化检测 | 脂质过氧化(MDA)检测试剂盒 | Abcam | ab118970 |
| 铁检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK025 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| F-12K培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 极限必需培养基 | Gibco | -- | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | -- | |
| 蛋白提取 | 细胞裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Selleck | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | Cell Signaling Technology | 9863S |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | -- | -- |
| 蛋白质印迹化学发光底物 | Tanon | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成 | 逆转录酶试剂盒 | Tiangen | -- |
| qPCR | SYBR Green | Selleck | -- |
| RNA-seq | BGIseq500平台 | BGI | -- |
| 组织学 | 徕卡手动切片机(RM2125 RTS) | Leica | -- |
| 细胞成像 | 奥林巴斯FV-1200 | Olympus | -- |
| 细胞培养 | 八孔细胞培养载玻片(NUNC) | NUNC | -- |
| 抗体 | 小鼠抗ZIKV包膜蛋白抗体 | BioFront | 1176-46 |
| 兔抗ZIKV NS5蛋白抗体 | GeneTex | GTX133312 | |
| 兔抗HO1抗体 | Cell Signaling Technology | 43966 | |
| 兔抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 兔抗NRF2抗体 | Abcam | ab137550 | |
| 兔抗过氧化氢酶抗体 | Cell Signaling Technology | 14097 | |
| 兔抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 5832S | |
| 兔抗磷酸化AMPKα (T172)抗体 | Cell Signaling Technology | 50081S | |
| 小鼠抗流感病毒核蛋白抗体 | Abcam | ab128193 | |
| 兔抗IFITM3抗体 | Proteintech | 11714-1-AP | |
| 兔抗GAPDH抗体 | EMAR | EM32010-02 | |
| 小鼠抗LaminB1抗体 | Proteintech | 66095-1-Ig | |
| 兔抗RIG-I抗体 | Cell Signaling Technology | 3743S | |
| 兔抗磷酸化IRF3 (S386)抗体 | Abcam | ab76493 | |
| 兔抗磷酸化STAT1 (S727)抗体 | Cell Signaling Technology | 8826S | |
| 兔抗磷酸化STAT1 (Y701)抗体 | Cell Signaling Technology | 9167S | |
| 兔抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9172S | |
| 兔抗Raptor抗体 | Cell Signaling Technology | 2280T | |
| 兔抗磷酸化Raptor (S792)抗体 | Cell Signaling Technology | 2083T | |
| 兔抗NEDD4-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-25508 | |
| 兔抗SQSTM1/p62抗体 | Bimake | A5180 | |
| 兔抗LC3A/B抗体 | Cell Signaling Technology | 4108S | |
| 兔抗Akt1抗体 | Cell Signaling Technology | 2938S | |
| 兔抗磷酸化Akt1 (S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9018S | |
| 山羊抗兔HRP | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 山羊抗小鼠HRP | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG (H+L) AF594 | Thermo Fisher Scientific | A-11037 |
| 山羊抗小鼠IgG (H+L) AF488 | Thermo Fisher Scientific | A-11029 | |
| DAPI | Cell Signaling Technology | 4083 | |
| 泛素化下拉 | Ni-NTA酸珠 | Qiagen | 30210 |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| TPCK处理的胰蛋白酶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、抗生素浓度、培养温度CO2浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| ZIKV感染 | ZIKV毒株、制备方法、感染复数、感染时间、感染时培养基成分 阅读提示:Materials and methods: Viruses and infection |
| GTS-21处理 | GTS-21浓度、处理时间(30分钟预处理)、溶剂对照 阅读提示:Results: Activation of α7 nAChR decreases ZIKV viral loads in vitro; Figure 1 legend |
| 蛋白检测 | 抗体类型、稀释比例、裂解液成分、样本量 阅读提示:Materials and methods: IP and western blot |
| 基因敲低 | shRNA序列、慢病毒转导条件、筛选时间 阅读提示:Materials and methods: Lentiviral short hairpin RNA-mediated gene knockdown |
| 体内实验 | 小鼠品系、年龄、感染途径、病毒剂量、GTS-21给药剂量和途径 阅读提示:Materials and methods: Mice and animal infection; Figure 8 legend |