建立靶基因沉默模型
验证脂质偶联siRNA能否有效沉默肿瘤微环境中免疫细胞的靶基因mRNA。
使用人肿瘤异种移植或同系肿瘤模型,经皮下注射RNAi-ALDH2(对照靶点)或RNAi-STAT3/PDL1,收集肿瘤及引流淋巴结,通过qPCR或RNAscope检测靶mRNA水平。
RNAi mediated silencing of STAT3/PD-L1 in tumor-associated immune cells induces robust anti-tumor effects in immunotherapy resistant tumors
包含体外细胞分化实验、多种小鼠肿瘤模型(同系移植、人源异种移植)、功能验证(敲低靶基因)、机制验证(CD36介导摄取)及体内疗效和安全性评估。
小鼠同系肿瘤模型(Pan02、4T1、MC-38、Hepa1-6、CT26) 人肿瘤异种移植模型(LS411N、PANC1) CD36基因敲除小鼠 人PBMC来源的树突状细胞分化模型
RNAi-lipid偶联物类型(C16、C18、C22、C24)及给药剂量(10-50 mg/kg) 给药途径(皮下)及给药方案(单次或多次) 靶基因沉默效率(mRNA水平,通过qPCR或RNAscope) 肿瘤模型及免疫表型(CPI抵抗型如Pan02、4T1 vs. 敏感型如Hepa1-6、MC-38) CD36受体在免疫细胞上的表达水平及其对递送的必要性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证脂质偶联siRNA能否有效沉默肿瘤微环境中免疫细胞的靶基因mRNA。
使用人肿瘤异种移植或同系肿瘤模型,经皮下注射RNAi-ALDH2(对照靶点)或RNAi-STAT3/PDL1,收集肿瘤及引流淋巴结,通过qPCR或RNAscope检测靶mRNA水平。
确定siRNA递送和基因沉默发生在哪些肿瘤相关免疫细胞亚群中。
通过MACS从肿瘤中分离CD11b+细胞、MDSC亚群(G-MDSC、M-MDSC)或引流淋巴结中的CD11b+和CD11c+细胞,然后检测靶基因mRNA水平。
测试RNAi-STAT3或RNAi-PDL1单药及其与免疫检查点抑制剂联合的肿瘤生长抑制效果。
在免疫健全小鼠中建立同系肿瘤(Pan02、4T1、MC-38、Hepa1-6),按方案给药,测量肿瘤体积,观察肿瘤生长抑制和存活。
确认治疗后肿瘤微环境中免疫细胞浸润和激活标志物的变化。
通过免疫组化检测pSTAT3、CD8、颗粒酶B、穿孔素等蛋白变化;通过Nanostring基因表达分析检测免疫相关基因变化。
证明CD36受体是脂质偶联siRNA被肿瘤相关免疫细胞摄取的必要条件。
使用CD36敲除小鼠和体外PBMC分化DC模型,检测CD36表达与siRNA摄取和基因沉默的关联。
评估人源活性STAT3和PDL1偶联物的非临床安全性。
进行小鼠和猴的5周毒性研究,检测最大耐受剂量、心血管功能、遗传毒性等。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞处理 | 白细胞介素-4 | Peprotech | -- |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-10 | Peprotech | -- | |
| RNA提取 | RNeasy RNA提取试剂盒 | Qiagen | 74106 |
| RT-qPCR | 高通量cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4368813 |
| TaqMan快速高级预混液 | Thermo Fisher Scientific | 4444557 | |
| RNAscope | RNAscope 2.5 HD检测试剂盒(红色) | ACD | 322350 |
| 免疫组织化学 | 抗pSTAT3抗体(9145) | Cell Signaling | 9145 |
| 抗穿孔素抗体(31647) | Cell Signaling | 31647 | |
| 抗颗粒酶B抗体(44153) | Cell Signaling | 44153 | |
| 抗CD8抗体(ab209775) | Abcam | ab209775 | |
| Signal Stain DAB底物试剂盒 | Cell Signaling | 8059 | |
| Omni Map抗兔HRP试剂盒 | Ventana | 760-4311 | |
| 细胞分选 | GentleMACS小鼠组织解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-730 |
| CD11b磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-049-601 | |
| MDSC分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-094-538 | |
| 药物处理 | 抗小鼠PD-L1抗体 | Bio X Cell | -- |
| 抗小鼠CTLA-4抗体 | Bio X Cell | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系和培养 | 细胞系来源和培养条件:如Pan02、4T1、MC-38、Hepa1-6等细胞系的生长培养基、添加物(如FBS),以及培养条件(温度、CO2浓度) 阅读提示:Materials and methods - Cell lines |
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6、Balb/c、nude、CD36 KO)、细胞接种数量、接种部位、肿瘤生长至目标大小(300-400 mm3)的时间 阅读提示:Materials and methods - Murine tumor models |
| RNAi给药 | siRNA偶联物类型(C16、C18等)、剂量(25或50 mg/kg)、给药途径(皮下)、给药体积(10 mL/kg)、给药频率(如每周一次) 阅读提示:Materials and methods - Murine tumor models; Results - Structure-activity relationship |
| 联合治疗 | 抗PD-L1或抗CTLA-4抗体的剂量(10 mg/kg)、给药途径(腹腔)、给药频率(如每周一次) 阅读提示:Results - STAT3 inhibition in combination...; Materials and methods - Murine tumor models |
| 检测方法 | qPCR引物探针序列(如Mm01198461_m1等)、RNAscope探针(ALDH2等)、IHC抗体及稀释比例、图像分析软件(Halo)参数设置 阅读提示:Materials and methods - Quantitative RT-PCR measurements, RNAscope, Immunohistochemistry |
| CD36机制验证 | CD36 KO小鼠来源、肿瘤细胞系(Pan02)接种数量、RNAi-PDL1剂量和给药方案、TDLN和肿瘤样本收集时间点 阅读提示:Results - The fatty acid transporter CD36...; Materials and methods - Murine tumor models |