临床试验疗效与安全性评估
评估H101腹腔注射治疗恶性腹水的临床疗效和安全性。
25例患者接受H101治疗,主要终点为重复穿刺时间,次要终点为无穿刺生存期、总生存期、60天穿刺频率及不良事件。
Oncolytic adenovirus in treating malignant ascites: A phase II trial and longitudinal single-cell study
包含II期临床试验(25例患者)、单细胞RNA测序和TCR测序、体外细胞系感染实验、类器官-T细胞共培养、免疫组化及多重免疫荧光验证,证据层级独立且包含功能与机制验证。
恶性腹水患者队列(25例) 腹水来源肿瘤细胞(scRNA-seq/IHC) PANC-1和SW1990胰腺癌细胞系 恶性腹水来源肿瘤类器官(P15和P22)
H101给药剂量(1.5×10^12病毒颗粒,第1、3天腹腔注射) 重复穿刺中位时间与预设对照值(13天)的比较 CD8+ T细胞与肿瘤类器官共培养时的效靶比(20:1)和处理时间(24小时) 单细胞测序样本采集时间点(第0、7、14天,以及一例患者的第2天) TTPR-long和TTPR-short组划分依据(中位TTRP)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估H101腹腔注射治疗恶性腹水的临床疗效和安全性。
25例患者接受H101治疗,主要终点为重复穿刺时间,次要终点为无穿刺生存期、总生存期、60天穿刺频率及不良事件。
解析恶性腹水微环境在病毒治疗过程中的细胞组成和免疫动态变化。
对31份腹水样本(11例患者,第0、7、14天)进行单细胞RNA测序和TCR测序,并对一例患者第0、2、7、14天的样本进行CD45富集后测序。
确定H101在胰腺癌细胞系中的感染动力学和选择性。
用不同感染复数(20、100、1000 TCID50/细胞)的H101感染PANC-1和SW1990细胞,在12、24、48小时通过免疫荧光检测E1A表达。
验证治疗后CD8+ T细胞是否获得增强的肿瘤特异性杀伤能力。
从两名T长组患者(P15和P22)建立腹水来源肿瘤类器官,与第0、7、14天分离的自体CD8+ T细胞共培养,检测肿瘤细胞凋亡和CD8+ T细胞转录谱。
开发并验证一种可预测抗PD(L)1治疗反应的基因特征。
基于T长组患者中CD8_GZMK、CD8_CXCR6和CD8_MKI67细胞中高克隆扩增(>20)的细胞差异表达基因构建OiTE,并在IMvigor210和GSE91061队列中验证其预后价值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | H101 | Shanghai Sunway Biotech | -- |
| 抗体检测 | 抗腺病毒IgG人ELISA试剂盒 | Abcam | ab108705 |
| DNA提取 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69506 |
| 红血球裂解 | ACK低渗裂解缓冲液 | Beyotime | C3702 |
| 流式分选 | CD45-FITC抗体 | Biolegend | 304006 |
| RNA提取 | RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| 类器官培养 | 基质胶 | -- | -- |
| TrypLE Express | Gibco | 12605-010 | |
| 细胞因子处理 | 干扰素-γ | PeproTech | 300-02 |
| T细胞扩增 | 白细胞介素-2 | PeproTech | 200-02 |
| T细胞激活 | CD3/CD28抗体 | STEMCELL | 10971 |
| T细胞分离 | CD8特异性MACS磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 |
| CD45特异性MACS磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-801 | |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V | -- | -- |
| 碘化丙啶 | BD Pharmingen | 556547 | |
| 流式分析 | CD45抗体 | BioLegend | 304015 |
| 免疫组化 | 抗CK19抗体 | CST | 13092 |
| 免疫荧光 | 抗腺病毒2/5 E1A抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-25 |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | 15580 | |
| 抗PD1抗体 | CST | 86163 | |
| 抗CD68抗体 | CST | 76437 | |
| 抗PD-L1抗体 | Abcam | ab279292 | |
| 测序 | Novaseq 6000 | Illumina | -- |
| 分选 | Bio-Rad Model 550酶标仪 | Bio-Rad | -- |
| Qubit 4.0 | Thermo Fisher | -- | |
| NanoDrop 2000 | Thermo Fisher | -- | |
| Agilent 4200 TapeStation | Agilent | -- | |
| Nikon DS-Fi2 | Nikon | -- | |
| TissueFAXS Plus | TissueGnostics GmbH | -- | |
| 测序 | Chromium单细胞控制器 | 10x Genomics | -- |
| 免疫组化 | Opal多重免疫组化检测试剂盒 | PerkinElmer | -- |
| 测序 | Cancer Panel 650试剂盒 | Homgen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组与治疗 | 患者纳入标准、H101给药剂量和方案(1.5×10^12病毒颗粒,第1和3天腹腔注射) 阅读提示:Materials and methods: Participants、Study design |
| 临床疗效评估 | 主要终点:时间到重复穿刺(TTRP)的定义和预设对照值(13天) 阅读提示:Materials and methods: Endpoints |
| 单细胞测序 | 样本采集时间点(第0、7、14天)、测序平台(10x Genomics)和数据分析流程(Cell Ranger、Harmony等) 阅读提示:Materials and methods: Human sample collection、Preparation and sequencing of scRNA-seq and TCR-seq libraries、scRNA-seq data processing and quality control |
| 体外感染实验 | 细胞系(PANC-1、SW1990)、感染复数(20、100、1000 TCID50/细胞)和感染时间(12、24、48小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell line infection |
| 类器官共培养 | 类器官建立方法、CD8+ T细胞分离(MACS)、共培养比例(20:1)和时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Establishment of MA-derived tumor organoids、Identification of CD8+ T cell-mediated tumor-specific killing by co-culture |