临床样本分析
评估宫颈癌组织中PD-L1+淋巴管与PD-1+CD8+ T细胞的分布、相关性及预后意义。
对102例宫颈癌和67例正常宫颈组织进行多重免疫荧光染色,定量分析CD8、PD-1、淋巴管标志物D240和PD-L1的表达,并进行相关性分析和Kaplan-Meier生存分析。
Cancer-secreted exosomal miR-1468-5p promotes tumor immune escape via the immunosuppressive reprogramming of lymphatic vessels
包括临床样本分析、体外细胞实验、体内异种移植模型、机制验证(靶基因预测、荧光素酶报告、ChIP)和多层次验证。
人宫颈癌细胞系Siha、hCEp细胞 人真皮淋巴管内皮细胞(HDLECs) B-NDG小鼠异种移植模型 宫颈癌患者临床样本
临床样本中PD-L1+淋巴管与PD-1+CD8+ T细胞的共定位和相关性 Siha细胞来源外泌体对HDLECs PD-L1表达和管形成的影响 miR-1468-5p对HMBOX1的直接靶向作用 HMBOX1对SOCS1启动子的转录调控 体内模型中α-PD-L1对肿瘤生长和免疫浸润的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估宫颈癌组织中PD-L1+淋巴管与PD-1+CD8+ T细胞的分布、相关性及预后意义。
对102例宫颈癌和67例正常宫颈组织进行多重免疫荧光染色,定量分析CD8、PD-1、淋巴管标志物D240和PD-L1的表达,并进行相关性分析和Kaplan-Meier生存分析。
验证癌细胞分泌的外泌体能否被淋巴管内皮细胞摄取并诱导其免疫抑制表型。
用携带CD63-GFP的慢病毒感染hCEp和Siha细胞,在Transwell中共培养后检测HDLECs对外泌体的摄取;分离纯化外泌体,处理HDLECs后检测PD-L1表达和管形成能力,并与CD8+ T细胞共培养检测免疫抑制。
鉴定介导癌细胞外泌体重编程HDLECs的关键miRNA。
对hCEp细胞、hCEp-exo、Siha细胞和Siha-exo进行miRNA微阵列分析,筛选上调且富集于Siha外泌体中的miRNA,并通过qRT-PCR和功能实验验证miR-1468-5p的作用。
验证miR-1468-5p的直接靶基因并确定其功能。
使用miRWalk和miRDB预测靶基因,通过qRT-PCR和Western blot验证HMBOX1的表达,用荧光素酶报告实验验证miR-1468-5p与HMBOX1 3'UTR的结合。
阐明miR-1468-5p-HMBOX1轴调控JAK2/STAT3通路的分子机制。
检测JAK2/STAT3通路磷酸化水平和荧光素酶活性,验证HMBOX1对SOCS1启动子的结合和转录调控,并使用通路抑制剂(tofacitinib)验证功能。
在体内验证外泌体miR-1468-5p介导的淋巴管免疫抑制对肿瘤生长的影响。
将肿瘤反应性CD8+ T细胞和Siha/anti-1468-5p细胞(单独或与处理过的HDLECs混合)皮下接种B-NDG小鼠,建立异种移植模型,给予α-PD-L1或tofacitinib治疗,监测肿瘤生长并分析肿瘤微环境。
评估血清外泌体miR-1468-5p与宫颈癌患者临床病理特征的关系。
收集宫颈癌患者和正常对照血清,分离外泌体,通过qRT-PCR检测miR-1468-5p水平,并分析与肿瘤组织中PD-1+CD8+ T细胞和PD-L1+淋巴管密度及预后的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 宫颈上皮细胞培养基 | ScienCell | 7601 |
| 内皮细胞培养基 | ScienCell | 1001 | |
| Ficoll-Paque Plus淋巴细胞分离液 | GE Healthcare | -- | |
| 人CD8+ T细胞富集试剂盒 | STEMCELL Technologies | -- | |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 白细胞介素-2 | -- | -- | |
| 抗CD3抗体 (OKT3) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗CD28抗体 (10F3) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| HLA-A24抗体 (K0208-5) | MBL International | K0208-5 | |
| 流式分析 | PE偶联的PD-L1抗体 (329706) | BioLegend | 329706 |
| FITC偶联的抗CD69抗体 (11-0699-42) | Thermo Fisher Scientific | 11-0699-42 | |
| PE偶联的抗IFN-γ抗体 (12-7319-42) | Thermo Fisher Scientific | 12-7319-42 | |
| APC偶联的抗PD-1抗体 (17-2799-42) | Thermo Fisher Scientific | 17-2799-42 | |
| Annexin V-APC凋亡检测试剂盒 (KGF004) | KeyGEN BioTech | KGF004 | |
| FACS LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| miRNA检测 | Mir-X miRNA第一链合成试剂盒 | TaKaRa | -- |
| PrimeScript RT预混液 | TaKaRa | -- | |
| qRT-PCR | SYBR Premix Ex Taq试剂 | TaKaRa | -- |
| TaqMan分析 | -- | -- | |
| SYBR Green分析 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 完全蛋白酶抑制剂片剂 | Roche | -- | |
| Pierce BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| TSG101抗体 (ab125011) | Abcam | ab125011 | |
| CD63抗体 (ab216130) | Abcam | ab216130 | |
| HSP70抗体 (ab2787) | Abcam | ab2787 | |
| SOCS1抗体 (ab62584) | Abcam | ab62584 | |
| SOCS2抗体 (ab3692) | Abcam | ab3692 | |
| SOCS3抗体 (ab16030) | Abcam | ab16030 | |
| JAK2抗体 (#3230) | Cell Signaling Technology | 3230 | |
| pJAK2抗体 (#4406) | Cell Signaling Technology | 4406 | |
| STAT3抗体 (#30835) | Cell Signaling Technology | 30835 | |
| pSTAT3抗体 (#9145) | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| GAPDH抗体 (#2118) | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| HMBOX1抗体 (PA5-21558) | Thermo Fisher Scientific | PA5-21558 | |
| HRP偶联的抗小鼠IgG (ab6728) | Abcam | ab6728 | |
| HRP偶联的抗兔IgG (ab6721) | Abcam | ab6721 | |
| 多重免疫荧光 | Opal 7色荧光免疫组化试剂盒 | PerkinElmer | -- |
| CD8抗体 (ab93278) | Abcam | ab93278 | |
| PD-1抗体 (ab137132) | Abcam | ab137132 | |
| D240抗体 (M361929-2) | Dako | M361929-2 | |
| PD-L1抗体 (ab205921) | Abcam | ab205921 | |
| HRP广谱SuperPicture聚合物检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| ProLong Diamond抗淬灭封片剂 | Life Technologies | -- | |
| 成像 | Zeiss LSM 880共聚焦激光扫描显微镜 | Zeiss | -- |
| 外泌体分离 | 0.22 μm过滤器 | Millipore | -- |
| RNase If (M0243) | New England Biolabs | M0243 | |
| miRNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| H-7500透射电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| NanoSight NS300纳米颗粒分析仪 | Malvern Instruments | -- | |
| 动物实验 | B-NDG小鼠 | Biocytogen | -- |
| 抗PD-L1抗体 (MEDI4736) | AstraZeneca | -- | |
| 托法替布 (HY-40354) | MedChemExpress | HY-40354 | |
| 管形成实验 | 基底膜基质 | BD Biosciences | -- |
| 倒置显微镜 (CX41) | Olympus | -- | |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| 荧光素酶报告实验 | pmiR-RB-REPORT载体 | RiboBio | -- |
| JAK2报告质粒 (MV-h11386) | Applied Biological Materials | MV-h11386 | |
| STAT3报告质粒 (#79730) | BPS Bioscience | 79730 | |
| 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | -- | |
| ChIP实验 | 酶法ChIP试剂盒 (#9003) | Cell Signaling Technology | 9003 |
| HMBOX1抗体 (16123-1-AP) | Proteintech | 16123-1-AP | |
| 正常IgG | Millipore | -- | |
| 测序 | Illumina GAIIx测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 宫颈癌和正常组织样本数量、免疫组化染色条件(抗体稀释度、抗原修复)、阳性细胞定量方法及统计方法。 阅读提示:Materials and methods - Clinical samples and study approval; Multiplexed immunofluorescence staining; Statistical analysis |
| 外泌体分离与鉴定 | 超速离心步骤(转速、时间、温度)、外泌体定量方法(NanoSight分析)、纯度鉴定(TEM和Western blot检测的标志物)。 阅读提示:Materials and methods - Exosome purification and characterization; Figure 3B-D legends |
| 细胞共培养实验 | 供体细胞(hCEp、Siha)和受体HDLECs的细胞密度和比例、共培养时间、外泌体处理浓度(1x10^11 exosomes/1x10^5 cells, 48h)。 阅读提示:Materials and methods - Cell lines and cell culture; Exosome purification and characterization; Figure 3A legend |
| CD8+ T细胞功能性实验 | CD8+ T细胞分离和活化方法(anti-CD3/CD28浓度)、HDLECs预处理时间、共培养时间和检测指标(IFN-γ, CD69, PD-1, Annexin V)。 阅读提示:Materials and methods - Human-activated CD8+ T cell preparation; In vitro CD8+ T cell immune suppression; Figure 3G-J legends |
| miRNA靶基因验证 | 靶基因预测工具和筛选标准、荧光素酶报告质粒构建(WT/MT)、共转染比例、荧光素酶活性检测方法。 阅读提示:Materials and methods - Luciferase activity assay; Figure 6E legend |
| 体内动物模型 | 小鼠品系、周龄、性别、细胞接种数量(Siha/anti-1468-5p 1x10^5,CD8+ T 2x10^6)、给药剂量和方案(α-PD-L1 5 μg/g;tofacitinib 3 μg/g)、肿瘤测量方法。 阅读提示:Materials and methods - In vivo xenograft model; Figure 5A-B legends |
| 临床相关性分析 | 患者血清样本收集和处理、血清外泌体提取方法、miR-1468-5p检测方法(qRT-PCR)、统计检验(Pearson相关、Kaplan-Meier)。 阅读提示:Materials and methods - Clinical samples and study approval; Statistical analysis; Figure 8D-H legends |