构建肝脏PMN模型并检测FAPα表达
验证FAPα在肝脏PMN的HSCs中是否高表达。
通过脾内注射HCT116或MC38细胞构建CRC肝转移PMN模型,通过脾内注射Panc02构建胰腺癌肝转移PMN模型;利用Masson染色、免疫荧光检测ECM成分和免疫细胞浸润;利用scRNA-seq分析供体肝和癌旁肝组织中HSCs的比例及FAPα表达。
Targeting FAP α-positive hepatic stellate cells ameliorates the formation of pre-metastatic niche
包含体外细胞模型、条件性基因敲除小鼠、AAV介导的体内基因敲低、单细胞RNA测序及前药治疗等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
HCT116结肠癌细胞系 MC38小鼠结肠癌细胞系 Panc02小鼠胰腺癌细胞系 C57BL/6小鼠肝转移模型
HSC特异性Fap敲除小鼠(FapΔGfap)的建立与验证 AAV-shNlrp3介导的HSC中Nlrp3敲低 FAPα抑制剂SP-13786处理LX-2FAP细胞 Z-GP-DAVLBH给药剂量(2 mg/kg,静脉注射,隔日一次,共14天) 肿瘤细胞脾内注射构建PMN模型(5×10^5细胞/只)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证FAPα在肝脏PMN的HSCs中是否高表达。
通过脾内注射HCT116或MC38细胞构建CRC肝转移PMN模型,通过脾内注射Panc02构建胰腺癌肝转移PMN模型;利用Masson染色、免疫荧光检测ECM成分和免疫细胞浸润;利用scRNA-seq分析供体肝和癌旁肝组织中HSCs的比例及FAPα表达。
确定FAPα+ HSCs是否促进PMN形成和肿瘤肝转移。
使用HSC特异性Fap敲除小鼠(FapΔGfap)与野生型对照,建立PMN模型和长期转移模型;通过Masson染色、免疫荧光检测ECM重塑和巨噬细胞/MDSC浸润;通过生物发光成像和肝病灶计数评估转移。
阐明FAPα激活HSCs中NLRP3炎症通路的机制。
对LX-2Vector和LX-2FAP细胞进行RNA-seq和KEGG/GO分析;Western blot检测NF-κB/NLRP3/caspase-1/IL-18通路蛋白;ELISA检测IL-18分泌;使用FAPα抑制剂SP-13786处理;在FapΔGfap小鼠中检测外周血IL-18和HSCs中NLRP3/caspase-1/IL-18共定位。
确定FAPα是否通过NLRP3/IL-18促进ECM重塑和巨噬细胞募集。
通过AAV-shNlrp3敲低HSC中Nlrp3,建立PMN模型,检测ECM成分和巨噬细胞浸润;体外敲低NLRP3或IL-18后检测ECM蛋白表达和巨噬细胞迁移/侵袭;检测巨噬细胞极化标志物。
明确肿瘤细胞来源的外泌体miR-2467-3p如何上调HSCs中FAPα。
分离LM-HCT116细胞外泌体,鉴定其特性;用外泌体处理LX-2细胞,检测FAPα和TCF21表达;通过Venn分析预测miRNA,用双荧光素酶报告验证miR-2467-3p与TCF21结合;检测miR-2467-3p表达;过表达TCF21后检测FAP表达。
检验FAPα激活前药Z-GP-DAVLBH是否能抑制PMN形成和肝转移。
在HCT116-luc脾内注射模型中,给予Z-GP-DAVLBH处理;检测ECM重塑、免疫细胞浸润、HSC激活、NLRP3通路和外周血IL-18;评估肝转移和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Beyotime | -- |
| AAV-shNlrp3 | Genechem | -- | |
| Z-GP-DAVLBH | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 药物处理 | SP-13786 | TargetMol | T7890 |
| MCC950 | TargetMol | T6887 | |
| 细胞分化 | 佛波醇12-豆蔻酸酯13-乙酸酯 | TargetMol | TQ0198 |
| DNA提取 | StarSpin通用DNA提取试剂盒 | Genstar | -- |
| PCR | 2×Taq PCR StarMix | Genstar | -- |
| 流式细胞术 | 胶原酶I、II、IV和透明质酸酶 | Yeasen | -- |
| 抗小鼠CD16/32抗体 | BioLegend | -- | |
| 生物发光成像 | D-荧光素 | Yeasen | -- |
| 迁移和侵袭实验 | 基质胶 | Yeasen | -- |
| Transwell系统 | Corning | -- | |
| 伤口愈合实验 | PKH67 | Sigma | MIDI67 |
| PKH26 | Sigma | MINI26 | |
| ibidi培养插件 | ibidi | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | TargetMol | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| RT-qPCR | StarScript III RT Mix with gDNA Remover Kit | Genstar | -- |
| mRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Genstar | -- | |
| miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Sangon Biotech | -- | |
| ELISA | 人IL-18 ELISA试剂盒 | NeoBioscience Technology | -- |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | Cloud-clone | -- | |
| QuantiCyto小鼠IL-18 ELISA试剂盒 | NeoBioscience Technology | -- | |
| 组织学染色 | Masson三色染色试剂盒 | Servicebio | -- |
| 免疫荧光 | QuickBlock免疫染色封闭液 | Beyotime | -- |
| TSAPLus荧光试剂盒 | Servicebio | -- | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔二抗 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 594山羊抗小鼠二抗 | Invitrogen | -- | |
| 鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| PI实验 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| Hoechst染料 | Beyotime | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告检测系统 | Promega | -- |
| 外泌体分离 | 0.22 μm滤膜 | Bioland | -- |
| Optima XPN-100超速离心机 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(HCT116、MC38、Panc02、LX-2、THP-1等);培养条件(DMEM或RPMI-1640,10% FBS,1%青霉素-链霉素);传代代数。 阅读提示:Methods 2.1 |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6、BALB/c-Nu);年龄(5-6周);Fapfl/fl和Gfap-Cre小鼠的遗传背景;他莫昔芬诱导方案(100 mg/kg,灌胃,隔日一次,共3次);肿瘤细胞脾内注射剂量(5×10^5细胞/只);PMN模型时间点(7天和14天);长期转移模型时间点(14天)。 阅读提示:Methods 2.2和2.3 |
| HSC特异性Fap敲除 | FapΔGfap小鼠的构建(Gfap-Cre与Fapfl/fl杂交);基因型鉴定方法;敲除效率验证。 阅读提示:Methods 2.3,结果3.2 |
| HSC中Nlrp3敲低 | AAV血清型(8);注射剂量(5×10^10 vg/只);注射途径(静脉);AAV-shNlrp3序列;敲低效率验证。 阅读提示:Methods 2.3,结果3.4 |
| 药物处理 | SP-13786浓度(50 μmol/L)和处理时间(30分钟);MCC950浓度(1 μmol/L)和处理时间(1小时);Z-GP-DAVLBH剂量(2 mg/kg)、给药方式(静脉注射)、频率(隔日一次)和持续时间(14天)。 阅读提示:Methods 2.5,2.17,结果3.6 |
| 外泌体提取与处理 | LM-HCT116细胞条件培养基制备;超速离心参数(10,000×g离心30分钟去除死细胞,120,000×g离心30分钟收集外泌体);外泌体鉴定(Western blot、TEM、NTA);LX-2细胞与外泌体共培养的时间和剂量。 阅读提示:Methods 2.16,结果3.5 |
| RT-qPCR | RNA提取方法;cDNA合成试剂盒;qPCR循环参数(95°C 5分钟,然后45个循环:95°C 10秒,60°C 10秒,72°C 10秒);内参基因(ACTB);样本重复次数(3次)。 阅读提示:Methods 2.11 |
| Western blot | 蛋白提取方法(RIPA裂解液,冰上30分钟);离心条件(12,000 rpm,4°C,15分钟);BCA定量;SDS-PAGE和转膜条件;一抗和二抗的稀释比例及来源。 阅读提示:Methods 2.10,表S4 |
| 免疫荧光 | 组织固定、包埋、切片厚度(4 μm);抗原修复方法;透化条件(0.1% Triton X-100);封闭液;一抗和二抗的稀释比例及来源;荧光染料(TSAPLus试剂盒,DAPI)。 阅读提示:Methods 2.13 |
| ELISA | 检测分析方法(IL-18、IL-1β);试剂盒品牌和货号;样品类型(细胞上清、外周血)。 阅读提示:Methods 2.12 |