小鼠模型建立与表型验证
验证内皮细胞特异性敲除CCM基因是否导致CCM形成
使用Cdh5-CreERT2和Slco1c1-CreERT2等工具鼠,在新生或成年小鼠内皮细胞中敲除Krit1或表达PIK3CA H1047R,观察病变形成。
PIK3CA and CCM mutations fuel cavernomas through a cancer-like mechanism
包含人类样本测序、单核DNA测序、小鼠遗传模型、体外细胞实验、药物干预等多层级证据,并有功能验证。
小鼠脑海绵状血管畸形模型 小鼠睾丸海绵状血管瘤模型 人脐静脉内皮细胞(HUVEC) 人类CCM手术切除标本
人类CCM样本中PIK3CA和CCM基因体细胞突变共存 小鼠内皮细胞中PIK3CA GOF和CCM LOF协同诱导CCM形成 CCM LOF和KLF4增加mTOR信号传导 雷帕霉素对小鼠CCM形成的抑制作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证内皮细胞特异性敲除CCM基因是否导致CCM形成
使用Cdh5-CreERT2和Slco1c1-CreERT2等工具鼠,在新生或成年小鼠内皮细胞中敲除Krit1或表达PIK3CA H1047R,观察病变形成。
测试单独CCM LOF或PIK3CA GOF是否足以在成熟脑中形成CCM,以及两者结合的作用
通过颅窗手术和AAV-Cre病毒注射,在成年小鼠脑中诱导基因重组,并连续成像监测病变形成。
鉴定人类CCM病变中的体细胞突变及其共存情况
对79个人类CCM样本进行靶向测序,并使用单核DNA测序验证突变是否存在于同一细胞。
探究CCM LOF和PIK3CA GOF如何激活mTOR信号通路
通过免疫染色、免疫印迹和qPCR检测p-S6、p-AKT、KLF4等分子表达。
评估mTORC1抑制剂雷帕霉素对CCM形成的影响
在新生和成年小鼠模型中给予雷帕霉素治疗,评估病变体积和分子标志物变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因诱导 | 4-羟基他莫昔芬 | Sigma Aldrich | H7904 |
| 他莫昔芬 | Sigma Aldrich | T564 | |
| 多西环素 | Sigma-Aldrich | D9891 | |
| 药物处理 | 雷帕霉素 | MedChemExpress | HY-10219 |
| 细胞培养 | 人脐静脉内皮细胞 | Lonza | CC-2519 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| cDNA合成 | SuperScript IV VILO预混液 | Thermo Fisher | 11756050 |
| qPCR | Power SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosciences | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Sigma | -- |
| 蛋白酶抑制 | 完全蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 磷酸酶抑制 | PhosSTOP磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Life Technologies | -- |
| 病毒包装 | pMD2.G | Addgene | 12259 |
| psPAX2 | Addgene | 12260 | |
| 病毒感染辅助 | 聚凝胺 | Santa Cruz Biotechnology | SC-134220 |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | InvivoGen | ant-pr-1 |
| RNA纯化 | RNEasy小量提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| DNA提取 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | -- |
| DNA定量 | Qubit双链DNA BR检测试剂盒 | Invitrogen | Q32850 |
| 突变检测 | QX200 AutoDG系统 | BioRad | -- |
| 微滴分析 | QX200微滴读取器 | BioRad | -- |
| 突变检测 | QuantaSoft软件 | BioRad | -- |
| 测序 | SureSelect XT HS靶向富集工作流程 | Agilent | -- |
| HiSeq4000测序仪 | illumina | -- | |
| NovaSeq6000 SP流动槽 | illumina | -- | |
| NextSeq中输出2×150bp试剂盒 | illumina | -- | |
| 细胞分选 | FACSAriaII流式细胞分选仪 | BD | -- |
| MACS MS系统 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 显微镜 | 尼康80i Eclipse显微镜 | Nikon | -- |
| 奥林巴斯DP80显微镜 | Olympus | -- | |
| 蔡司LSM 710共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 蔡司880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 图像处理 | ImageJ软件 | NIH | -- |
| 蛋白印迹成像 | LI-COR Odyssey FC成像系统 | LI-COR | -- |
| 蛋白定量 | ImageStudio软件 | LI-COR | -- |
| 手术 | 立体定位仪 | Stoeling Instruments | -- |
| 牙科钻 | Foredom | -- | |
| 盖玻片 | Warner | -- | |
| 氰基丙烯酸酯胶 | -- | -- | |
| 牙科水泥 | Metabond | -- | |
| 麻醉 | 地塞米松 | Sigma | -- |
| 美洛昔康 | Midwest Vet Supply | -- | |
| 抗原修复 | 柠檬酸盐缓冲液 | Sigma | C9999 |
| 封闭 | 驴血清 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 抗体 | 抗PECAM1/CD31抗体 | HistoBioTec | DIA-310 |
| 抗KLF4抗体 | R&D Systems | AF3158 | |
| 抗GFP抗体 | Rockland Immunochemicals | 600-101-215 | |
| 抗ERG抗体 | Abcam | ab110639 | |
| 抗磷酸化S6抗体 | Cell Signaling Technologies | 4858S | |
| Alexa Fluor二抗 | Invitrogen | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technologies | 2118 | |
| 抗磷酸化AKT Ser473抗体 | Cell Signaling Technologies | 4060 | |
| 抗磷酸化S6 Ser235/236抗体 | Cell Signaling Technologies | 4858 | |
| 抗总AKT抗体 | Cell Signaling Technologies | 2920 | |
| 抗总S6抗体 | Cell Signaling Technologies | 2317 | |
| 抗eNOS抗体 | Cell Signaling Technology | 9586 | |
| 抗GFP抗体 | Cell Signaling Technology | 2555 | |
| 抗KLF4抗体 | Cell Signaling Technology | 4038 | |
| 抗磷酸化S6 (Ser235/236)抗体 | Cell Signaling Technology | 4857 | |
| 抗磷酸化S6 (Ser240/244)抗体 | Cell Signaling Technology | 2215 | |
| 抗S6核糖体蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2217 | |
| 抗磷酸化AKT (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗磷酸化AKT (Thr308)抗体 | Cell Signaling Technology | 4056 | |
| 抗AKT (pan)抗体 | Cell Signaling Technology | 4685 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2148 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Jackson Immuno Research Labs | -- | |
| 核分离 | 细胞核EZ裂解缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 单核测序 | Tapestri平台 | MissionBio | -- |
| EVOS FL荧光显微镜 | Thermo Fisher | -- | |
| 组织学 | ProLong Gold防淬灭剂 | -- | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 蛋白电泳 | 预制梯度凝胶 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白转印 | Trans Turbo Blot转印系统 | Bio-Rad | -- |
| 动物饲养 | Green Line笼具 | Tecniplast | -- |
| 手术 | 立体定位仪 | David Kopf instruments | Nr: |
| 牙科钻 | freedom | K.1070 | |
| 药物 | 卡洛芬 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 新生小鼠模型 | Cre驱动系(Cdh5-CreERT2或Slco1c1-CreERT2)、4OHT剂量(40μg)、P1注射、微生物背景(易感/抗性)、取材时间(P6/P7/P10) 阅读提示:Methods: Mice; 图1a; 扩展数据图1a |
| 成人模型 | 年龄(2月龄)、颅窗手术、AAV-Cre注射量(100nL 5×10^7)、术后观察时间(21天) 阅读提示:Methods: Craniotomy survival surgery, Adeno-associated virus injection; 图1d |
| 人样本测序 | 样本数量(79例CCM)、测序覆盖度(>1000x)、突变筛选标准(等位基因频率>0.5%、COSMIC数据库) 阅读提示:Methods: Sequencing, Sequence Analysis; 图2 |
| mTOR信号检测 | 抗体(p-S6、p-AKT)、组织(P6脑切片)、细胞(HUVEC) 阅读提示:Methods: Immunoblotting; 图3 |
| 雷帕霉素治疗 | 给药途径(腹腔注射)、剂量(新生50μg单次,成年100μg或400μg每日)、给药时间 阅读提示:Methods: Rapamycin injection; 图4 |