建立人小肠ALI类器官模型
验证从内镜活检组织能否培养出保留上皮、间充质和多种免疫细胞的类器官
利用气液界面培养系统,将十二指肠活检碎片接种在胶原基质中,用含WNT3A、EGF、Noggin和R-spondin1的培养基培养,观察并表征类器官生长、细胞组成和免疫多样性。
A human autoimmune organoid model reveals IL-7 function in coeliac disease
包含体外类器官模型、患者活检样本、scRNA-seq等多层级验证,并有功能获得和缺失实验明确验证IL-7机制。
乳糜泻患者十二指肠ALI类器官 非乳糜泻对照十二指肠ALI类器官
HLA-DQ2.5表达状态 麸质肽(DQ2.5-glia-α1/α2)处理浓度和时间 IL-7阻断或重组IL-7处理条件 上皮细胞凋亡检测(cleaved caspase-3, NucView) CD8+ T细胞NKG2C/D表达检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证从内镜活检组织能否培养出保留上皮、间充质和多种免疫细胞的类器官
利用气液界面培养系统,将十二指肠活检碎片接种在胶原基质中,用含WNT3A、EGF、Noggin和R-spondin1的培养基培养,观察并表征类器官生长、细胞组成和免疫多样性。
验证HLA-DQ2.5限制性麸质肽能否在CeD类器官中重现上皮损伤和炎症反应
用脱酰胺的麸质肽(DQ2.5-glia-α1/α2)或对照CLIP肽处理类器官2天,检测上皮凋亡、增殖、IL-15产生和免疫细胞活化。
探究麸质肽诱导的免疫细胞亚群变化和细胞间相互作用
通过流式细胞术和scRNA-seq分析处理后的类器官中T细胞、B细胞、NK细胞和髓系细胞的活化状态、受体表达和细胞间通讯。
阐明IL-7在麸质诱导上皮损伤中的必要性、充分性和机制
通过IL-7R ECD阻断IL-7,或添加重组IL-7,观察对上皮凋亡和CD8+ T细胞NKG2C/D表达的影响。
验证IL-7在活动性CeD患者活检组织中是否上调
通过免疫荧光和原位杂交检测活动性CeD和缓解期CeD(无麸质饮食)十二指肠活检组织中的IL-7蛋白和mRNA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 类器官培养 | Cultrex大鼠I型胶原 | R&D Systems | 3443-100-01 |
| WENR培养基 | -- | -- | |
| CHIR 99021 | Biogems | 2520691 | |
| 麸质处理 | 麸质肽(DQ2.5-glia-α1/α2) | GenScript | -- |
| CLIP肽 | GenScript | -- | |
| 免疫调节 | 抗HLA-DR、DP、DQ抗体 | BD | 55557 |
| IL-7RA胞外域 | Sino Biological | 10975-H08H | |
| NKG2C胞外域-Fc嵌合体 | R&D Systems | 138-NK-050 | |
| NKG2D胞外域-Fc嵌合体 | R&D Systems | 1299-NK-050 | |
| 重组人IL-7 | PeproTech | 200-07 | |
| 免疫细胞维持 | IL-2 | PeproTech | AF-200-02 |
| 组织学分析 | Keyence BZ-X700显微镜 | Keyence | -- |
| Leica DMC4500显微镜 | Leica | -- | |
| 免疫荧光 | 蔡司LSM900共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| ImageJ | -- | -- | |
| 流式分析 | BD FACSAria-II SORP | BD | -- |
| NucView 488 | Biotium | 30072 | |
| LIVE/DEAD试剂盒 | Invitrogen | L34957 | |
| RT-qPCR | PicoPure RNA提取试剂盒 | Applied Biosystems | KIT0204 |
| iScript逆转录酶 | Bio-Rad | 1708841 | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | 4367659 | |
| scRNA-seq | Chromium Next GEM单细胞5'试剂盒v2 | 10x Genomics | PN-1000263 |
| Chromium单细胞人TCR扩增试剂盒 | 10x Genomics | PN-1000252 | |
| Chromium单细胞人BCR扩增试剂盒 | 10x Genomics | PN-1000253 | |
| ELISA | 抗人转谷氨酰胺酶IgA检测试剂盒 | Generic Assays | 4033 |
| 原位杂交 | RNAscope探针 - 人IL7 | ACD Biotechne | 424251 |
| RNAscope 2.5 HD双链检测试剂盒 | ACD Biotechne | 322500 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 类器官建立 | 活检来源、HLA-DQ2.5状态、培养时间(9-12天)、培养基成分(WENR) 阅读提示:Methods: Establishment of organoid ALI cultures; 图1a |
| 麸质处理 | 麸质肽浓度(10 μM)和CLIP浓度(10 μM)、处理时间(2天)、培养基(无Y-27632和CHIR99021) 阅读提示:Methods: CeD organoid culture and CLIP or gliadin treatment; 图2 |
| IL-7功能验证 | IL-7R ECD浓度(1 μg/ml)、预处理时间(2天)、重组IL-7浓度(10 ng/ml)、处理时间(4天) 阅读提示:Methods: Immunomodulation treatments; 图5 |
| 免疫检测 | 流式抗体克隆和稀释度(1:500)、凋亡检测试剂(NucView 488)、scRNA-seq平台和建库试剂盒 阅读提示:Methods: Flow cytometry analysis and FACS isolation; Methods: Single-cell RNA-seq; 图3 |
| 临床样本验证 | 活动性CeD和缓解期CeD的诊断标准、活检部位(十二指肠)、IL-7抗体(兔抗IL-7 ab175380 1:400, 鼠抗IL-7 sc-365306 1:100)、RNAscope探针(Hs-IL7, 424251) 阅读提示:Methods: Human specimens; Methods: Immunofluorescence; Methods: In situ hybridization; 图6 |