体外细胞增殖实验
验证睾酮对黑色素瘤细胞增殖的影响及剂量依赖性
用不同浓度睾酮处理WM46和YUMM1.7等黑色素瘤细胞,定期计数细胞数量。
ZIP9 Is a Druggable Determinant of Sex Differences in Melanoma
包含体外细胞增殖实验、锌内流检测、RPPA蛋白组学、CRISPR-Cas9基因敲除、动物模型及药物干预等多个独立证据层级,并进行机制验证。
人黑色素瘤细胞系WM46 小鼠黑色素瘤细胞系YUMM1.7 SCID小鼠皮下移植瘤模型 C57BL/6小鼠同种移植瘤模型
ZIP9(SLC39A9)在黑色素瘤细胞中的表达及敲除验证 睾酮浓度及处理时间对细胞增殖的影响 锌内流检测(FluoZin-3)及TPEN螯合实验 MAPK/ERK和YAP1信号通路激活验证 雄激素受体抑制剂(如阿帕鲁胺、比卡鲁胺)在体内外对肿瘤生长的抑制作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证睾酮对黑色素瘤细胞增殖的影响及剂量依赖性
用不同浓度睾酮处理WM46和YUMM1.7等黑色素瘤细胞,定期计数细胞数量。
确定ZIP9是否是睾酮效应的必要介质
使用CRISPR-Cas9敲除SLC39A9,获得ΔZIP9克隆,并回补人ZIP9转基因,检测增殖和锌内流。
检测睾酮是否诱导ZIP9依赖的锌内流
使用FluoZin-3探针监测睾酮处理后的细胞内锌浓度变化。
鉴定ZIP9下游关键信号通路
通过RPPA、Western blot和免疫荧光检测MAPK/ERK、YAP1及其靶基因的变化。
验证ZIP9和雄激素受体抑制剂在体内对肿瘤生长的影响
将WT和ΔZIP9 WM46细胞植入SCID小鼠,用阿帕鲁胺或比卡鲁胺每日口服处理,监测肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Mediatech | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| 细胞增殖检测 | 睾酮 | Sigma-Aldrich | T5411 |
| 睾酮3-(O-羧甲基)肟:BSA | Sigma-Aldrich | T3392 | |
| 锌内流检测 | FluoZin-3 AM | Thermo Fisher Scientific | F24195 |
| 吡啶硫酮锌 | -- | -- | |
| 蛋白表达分析 | β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 |
| ZIP9抗体 | Abcam | 137205 | |
| 磷酸化p44/42 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| p44/42 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 雄激素受体抗体 | Cell Signaling Technology | 5153 | |
| RSK1/2/3抗体 | Cell Signaling Technology | 9355 | |
| 磷酸化p90RSK抗体 | Cell Signaling Technology | 9344 | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | 170-5060 | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2128 | |
| PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| YAP1抗体 | Cell Signaling Technology | 14074 | |
| 免疫荧光 | ProLong Gold防淬灭封片剂含DAPI | Thermo Fisher Scientific | P36935 |
| 免疫组织化学 | SLC39A9抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-52485 |
| Dako内源性酶阻断剂 | Agilent | S2003 | |
| Vectastain试剂盒 | Vector Laboratories | PK-4001 | |
| ImmPACT DAB底物 | Vector Laboratories | SK-4105 | |
| SecureMount封片剂 | Fisher HealthCare | 022-208 | |
| Leica Bond-III仪器 | Leica | -- | |
| Bond聚合物精炼检测系统 | Leica Microsystems | DS9800 | |
| 细胞膜标记实验 | 睾酮3-(O-羧甲基)肟:BSA-FITC | Sigma-Aldrich | T5771 |
| BSA-FITC | Sigma-Aldrich | A9771 | |
| RT-qPCR | RNeasy试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| High Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 | |
| PowerUP SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | A25741 | |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| 比卡鲁胺 | -- | -- | |
| 阿帕鲁胺 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 双氢睾酮 | -- | -- |
| 信号通路抑制 | Ulixertinib | -- | -- |
| 多巴酚丁胺 | -- | -- | |
| PLX-4032(维莫非尼) | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源及传代数,培养基成分(DMEM或McCoy's 5A等)、血清类型(炭吸附血清)、青霉素-链霉素浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and proliferation assays |
| 细胞增殖实验 | 细胞接种密度、培养时长、处理浓度(如100 nM睾酮)、处理频率(每两天换液)、计数方法 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and proliferation assays; Figure 1B, 1C legends |
| CRISPR-Cas9敲除 | gRNA序列、敲除细胞系、筛选药物(嘌呤霉素)、敲除克隆的验证(Western blot和测序) 阅读提示:Materials and Methods: CRISPR-Cas9 mediated ablation of SLC39A9 |
| 锌内流检测 | 探针浓度、加载时间、成像设置(激发波长)、处理条件(如睾酮浓度和时间) 阅读提示:Materials and Methods: Zinc influx analysis; Figure 2B, 2C legends |
| Western blot | 细胞裂解液成分、上样量、抗体稀释度、封闭条件、曝光时间 阅读提示:Materials and Methods: Western blot, immunofluorescence and antibodies |
| 免疫组化 | 组织芯片类型、抗原修复条件、一抗稀释度、评分标准 阅读提示:Materials and Methods: Immunohistochemistry and quantification |
| 动物实验 | 小鼠品系、性别、周龄、细胞注射数量和部位、药物剂量和给药方式、肿瘤测量频率 阅读提示:Materials and Methods: Mice, subcutaneous tumors and pharmacologic treatments |