衰老动物模型建立与泪腺形态学评估
比较年轻与中年小鼠泪腺组织学变化及功能差异。
使用6周龄和12月龄C57BL/6J小鼠,通过H&E染色、Masson染色、油红O染色观察组织学变化,测量泪液分泌量。
PINK1/Parkin-Mediated Mitophagy Ameliorates Mitochondrial Dysfunction in Lacrimal Gland Acinar Cells During Aging
包含体内动物模型(年轻与中年小鼠)、组织学染色、Western blot、免疫荧光、TEM、scRNA-seq及药物干预(雷帕霉素/Mdivi-1)等多个独立证据层级,并进行功能验证。
C57BL/6J小鼠泪腺组织(6周龄与12月龄) 小鼠泪腺腺泡上皮细胞
小鼠年龄:6周龄(年轻)与12月龄(中年) 雷帕霉素给药剂量:5 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续1个月 Mdivi-1给药剂量:10 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续1个月 泪液分泌测量方法:酚红棉线法 统计分析:Student's t检验或单因素方差分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较年轻与中年小鼠泪腺组织学变化及功能差异。
使用6周龄和12月龄C57BL/6J小鼠,通过H&E染色、Masson染色、油红O染色观察组织学变化,测量泪液分泌量。
评估衰老对泪腺组织ROS水平和线粒体功能的影响。
使用ROS荧光探针检测ROS水平,JC-1探针检测线粒体膜电位,TEM观察线粒体超微结构。
鉴定泪腺细胞类型,分析衰老过程中腺泡上皮细胞基因表达变化及线粒体自噬通路。
利用10x Genomics平台进行scRNA-seq,鉴定12种细胞类型,对腺泡上皮细胞进行亚聚类分析,进行GO/KEGG/GSEA富集分析,伪时间分析。
验证激活线粒体自噬能否减轻衰老引起的泪腺损伤。
对中年小鼠腹腔注射雷帕霉素,持续1个月,检测组织学变化、ROS、线粒体功能、凋亡和线粒体自噬相关蛋白表达。
验证抑制线粒体自噬是否加剧衰老引起的泪腺损伤。
对中年小鼠腹腔注射Mdivi-1,持续1个月,检测组织学、凋亡、ROS、线粒体功能和线粒体自噬相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 雷帕霉素 | MedChemExpression | #HY-10219 |
| Mdivi-1 | MedChemExpression | #HY-15886 | |
| 组织学染色 | Masson染色试剂盒 | Servicebio | #G1006 |
| 油红O染色试剂盒 | Servicebio | #G1015 | |
| 线粒体功能检测 | JC-1染色试剂盒 | Beyotime | #C2003 |
| 氧化应激检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | #C0063 |
| 凋亡检测 | TUNEL细胞凋亡检测试剂盒 | Servicebio | #G1502 |
| 免疫组化 | DAB染色试剂盒 | Biodragon | #BDAA0192 |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | #P0012 |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| ECL检测试剂盒 | CYTOCH | #PD0001 | |
| TBST缓冲液 | Swiss Affinibody LifeScience AG | #AIWB-008 | |
| HRP标记的抗兔IgG抗体 | Servicebio | -- | |
| 成像系统 | Servicebio | SCG-W2000 | |
| RNA提取 | SteadyPure快速RNA提取试剂盒 | Accurate Biotechnology (Hunan) Co., Ltd. | #AG21023 |
| 逆转录 | 逆转录预混试剂盒 | Accurate Biotechnology (Hunan) Co., Ltd. | #AG11728 |
| 实时定量PCR | SYBR Green qPCR试剂盒 | Accurate Biotechnology (Hunan) Co., Ltd. | #AG11701 |
| DNA提取 | Steadypure通用基因组DNA提取试剂盒 | Accurate Biotechnology (Hunan) Co., Ltd. | #AG21009 |
| 泪腺消化 | 胰蛋白酶溶液 | VivaCell | #C3538 |
| Hanks平衡盐溶液 | NEST Biotechnology | #211031 | |
| 细胞计数 | Countess II自动细胞计数仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 单细胞RNA测序 | 10x Genomics Chromium平台 | 10x Genomics | -- |
| 透射电镜 | 日立透射电子显微镜(HT7800) | Hitachi | HT7800 |
| 显微镜观察 | 光学显微镜 | Nikon | Eclipse E100 |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Nikon | Eclipse C1 |
| 干燥剂 | OCT包埋剂 | -- | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| 免疫组化 | 牛血清白蛋白 | -- | -- |
| 柠檬酸钠缓冲液 | -- | -- | |
| 抗IL-1β抗体 | Servicebio | GB11113 | |
| 抗IL-6抗体 | Servicebio | GB11117 | |
| 抗PPARγ抗体 | Servicebio | GB12164 | |
| 抗NOX4抗体 | Servicebio | GB11347 | |
| 抗3-硝基酪氨酸抗体 | Servicebio | GB112528 | |
| 免疫荧光 | 抗CD45抗体 | Servicebio | GB113886 |
| 抗Ki67抗体 | Servicebio | GB121141 | |
| 抗TOMM20抗体 | Servicebio | GB111481 | |
| 抗LAMP-1抗体 | Servicebio | GB112949 | |
| 抗Parkin抗体 | Servicebio | GB114834 | |
| 抗LC3B抗体 | Servicebio | GB113801 | |
| 抗p62抗体 | Servicebio | GB11531 | |
| 抗γH2AX抗体 | Servicebio | BA3677 | |
| 抗p63抗体 | Servicebio | GB15900 | |
| 抗NaK-ATPase抗体 | Servicebio | GB11902 | |
| 抗αSMA抗体 | Servicebio | GB12045 | |
| 抗AQP5抗体 | Servicebio | GB113318 | |
| Western blot | 抗p16抗体 | Proteintech | 10883-1-AP |
| 抗p21抗体 | Proteintech | 10355-1-AP | |
| 抗LC3B抗体 | ZENBIO | 381544 | |
| 抗p62抗体 | ZENBIO | 380612 | |
| 抗p-mTOR (Ser2448)抗体 | Proteintech | 67778-1-Ig | |
| 抗mTOR抗体 | Proteintech | 28273-1-AP | |
| 抗Beclin-1抗体 | Proteintech | 11306-1-AP | |
| 抗DRP1抗体 | Affinity Biosciences | DF7037 | |
| 抗MFF抗体 | Proteintech | 17090-1-AP | |
| 抗PINK1抗体 | Affinity Biosciences | DF7742 | |
| 抗Parkin抗体 | ZENBIO | 381626 | |
| 抗GAPDH抗体 | Servicebio | GB15002 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与处理 | 小鼠品系、年龄、性别、饲养环境、药物剂量与给药方式 阅读提示:Methods: Animals and Treatment |
| 泪液分泌测量 | 酚红棉线放置时间、测量次数 阅读提示:Methods: Tear Secretion Measurement |
| 组织学染色 | 切片厚度、染色步骤、试剂盒型号 阅读提示:Methods: Hematoxylin and Eosin and Masson Staining, Oil Red O Staining |
| 线粒体功能检测 | JC-1孵育时间、温度,ROS染色时间、温度 阅读提示:Methods: Mitochondrial Membrane Potential, ROS Staining |
| 凋亡检测 | TdT孵育时间、温度,DAPI染色时间 阅读提示:Methods: TUNEL Kit Identified Apoptosis |
| Western blot | 蛋白上样量、一抗稀释比例、二抗稀释比例、封闭条件 阅读提示:Methods: Western Blot Analysis |
| RT-qPCR | 引物序列(补充表S1)、内参基因(GAPDH) 阅读提示:Methods: Quantitative Real-Time PCR, 补充材料 |
| mtDNA测量 | 引物序列(补充表S2)、内参基因(Actin) 阅读提示:Methods: mtDNA Measurement, 补充材料 |
| TEM | 固定液(1% OsO4和3%戊二醛)、脱水乙醇梯度、切片厚度、染色方法 阅读提示:Methods: Transmission Electron Microscope |
| scRNA-seq | 组织消化条件、细胞活力、上机浓度、测序平台、数据分析参数(基因数、UMI数、线粒体reads比例) 阅读提示:Methods: Mice Lacrimal Gland Digestion, Processing of scRNA-seq, Quality Control and Analysis of scRNA-seq Data |