建立NEC预防和治疗模型
验证谷氨酰胺和谷氨酸在NEC预防和治疗中的不同作用
新生大鼠分预防组和治疗组,预防组在NEC诱导前给予谷氨酰胺或谷氨酸,治疗组在NEC诱导期间同时给药,通过组织学检查和炎症因子检测评估肠道损伤。
The glutamine metabolic switch influences the response of neonatal intestinal macrophages to breast milk
包含新生大鼠NEC预防/治疗模型、人类scRNA-seq重分析、BMDM体外实验、流式细胞术、代谢物检测及机制验证,且进行了功能验证。
新生大鼠NEC模型 新生大鼠骨髓来源巨噬细胞 人体回肠scRNA-seq数据 人乳样本
谷氨酰胺/谷氨酸给药剂量:0.75 g/kg,每日两次 NEC诱导条件:低氧(95% N2 10分钟)、冷应激(4°C 10分钟)、高渗配方奶灌胃 LPS刺激浓度:10 ng/mL 谷氨酰胺和谷氨酸预处理浓度和时间:5 mM/2 mM,12小时 α-KG和琥珀酸干预剂量:5 mg/kg和100 mg/kg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证谷氨酰胺和谷氨酸在NEC预防和治疗中的不同作用
新生大鼠分预防组和治疗组,预防组在NEC诱导前给予谷氨酰胺或谷氨酸,治疗组在NEC诱导期间同时给药,通过组织学检查和炎症因子检测评估肠道损伤。
鉴定NEC中改变的免疫细胞类型和炎症通路
重新分析已发表的人类NEC scRNA-seq数据,比较NEC和对照样本的免疫细胞组成,并通过GO分析富集巨噬细胞中上调的炎症通路。
验证谷氨酰胺和谷氨酸对巨噬细胞炎症反应的预处理和治疗作用
分离新生大鼠回肠巨噬细胞,通过流式细胞术检测TNF-α+巨噬细胞比例;分离BMDM,给予谷氨酰胺或谷氨酸预处理后LPS刺激,检测炎症因子表达。
探讨LPS如何改变谷氨酰胺代谢酶表达及代谢物水平
分析LPS刺激的BMDM转录组数据,qRT-PCR和Western blot验证GLS、GLUL、GLUD1表达;检测回肠组织中α-KG和琥珀酸水平。
验证α-KG和琥珀酸在NEC模型中对谷氨酰胺作用的影响
在NEC模型中,与谷氨酰胺同时给予α-KG或琥珀酸,通过流式细胞术检测TNF-α+巨噬细胞比例。
比较早产和足月母乳中谷氨酰胺和谷氨酸的差异
收集早产和足月母亲的初乳和成熟乳,通过ELISA检测谷氨酰胺和谷氨酸水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | VivaCell | C3103-0500 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270 | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | 315-02 | |
| 药物处理 | L-谷氨酰胺 | Gibco | 35050079 |
| L-谷氨酸 | Sangon Biotech | A600221 | |
| 脂多糖 | Sigma | L2630 | |
| 动物实验 | Similac 60/40配方奶 | Ross Pediatrics | -- |
| Esbilac配方奶 | Pet-Ag | -- | |
| 经口胃管 | GLOBALEBIO | TFEP-001 | |
| 细胞转染 | Lipomaster 3000转染试剂 | Vazyme | TL301-01 |
| 聚凝胺 | Sigma | TR-1003 | |
| 嘌呤霉素 | Solarbio | P8230 | |
| 免疫荧光 | Leica SP8显微镜 | Leica | -- |
| 免疫组化 | 抗CD86抗体 | CST | 91882 |
| DAB底物 | DAKO | K5007 | |
| qRT-PCR | EZ-press RNA纯化试剂盒 | EZBioscience | B0004D |
| EZ-press RNA纯化试剂盒 | EZBioscience | RN4 | |
| HiScript III RT SuperMix试剂盒 | Vazyme | R323-01 | |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q311-02/03 | |
| SLAN-96S实时荧光定量PCR仪 | Shanghai HONGSHI Medical Tech | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime Biotechnology | P1009 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime Biotechnology | P1046 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0009 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| ChemiDoc成像系统 | Tanon | 5200 | |
| 谷氨酰胺合成酶多克隆抗体 | Proteintech | 11037-2-AP | |
| GLS多克隆抗体 | Proteintech | 29519-1-AP | |
| GLUD1多克隆抗体 | Proteintech | 14299-1-AP | |
| 抗谷胱甘肽抗体[D8] | Abcam | ab19534 | |
| GAPDH单克隆抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| β-肌动蛋白重组抗体 | Proteintech | 81115-1-RR | |
| 人乳处理 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 4693116001 |
| ELISA | 谷氨酰胺ELISA试剂盒 | COIBO BIO | CB10636-Hu |
| 谷氨酸ELISA试剂盒 | COIBO BIO | CB10632-Hu | |
| 代谢物检测 | 乳酸含量检测试剂盒 | Sangon Biotech | D799851 |
| 琥珀酸ELISA试剂盒 | mlBio | YJ981747 | |
| Amplex Red α-酮戊二酸检测试剂盒 | Beyotime | S0323s | |
| LPMC提取 | 胶原酶D | Roche | 11088858001 |
| 胶原酶V | Sigma | C9263 | |
| 分散酶 | Thermo | 17105041 | |
| 脱氧核糖核酸酶 | Roche | 04536282001 | |
| 流式细胞术 | FITC抗CD45抗体 | BioLegend | 202205 |
| APC抗F4/80抗体 | BioLegend | 123115 | |
| PerCP/Cy5.5抗CD11b/c抗体 | BioLegend | 201819 | |
| Alexa Fluor 700抗TNF-α抗体 | Novus Biologicals | NBP1-19532AF700 | |
| 抗GLS抗体 | Abcam | ab317032 | |
| 抗GLUL抗体 | Abcam | ab64613 | |
| GLUD1抗体 | Thermo Fisher | PA5-116486 | |
| BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲液 | VivaCell | C3580-0500 |
| LPMC提取 | Hank's平衡盐溶液 | Gibco | 14175095 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| NEC预防模型 | 谷氨酰胺/谷氨酸给药剂量:0.75 g/kg,每日两次,连续2天;给药时间;NEC诱导条件 阅读提示:材料与方法中的“In Vivo Study”部分 |
| NEC治疗模型 | 谷氨酰胺/谷氨酸给药剂量:0.75 g/kg,每日两次,从NEC诱导开始;NEC诱导条件 阅读提示:材料与方法中的“In Vivo Study”部分 |
| BMDM实验 | 谷氨酰胺浓度5 mM,谷氨酸浓度2 mM,预处理时间12小时;LPS浓度10 ng/mL,刺激时间6小时;培养基条件(无谷氨酰胺) 阅读提示:材料与方法中的“Cell Culture”部分及图4图注 |
| 流式细胞术检测 | 抗体克隆号、稀释倍数(CD45 1:200, F4/80 1:200, CD11b/c 1:200, TNF-α 1:100);细胞处理(固定/透化) 阅读提示:材料与方法中的“Flow Cytometry”部分 |
| 代谢物干预 | α-KG剂量5 mg/kg,琥珀酸剂量100 mg/kg,每日给药;给药途径 阅读提示:材料与方法中的“In Vivo Study”部分及图7图注 |